N-2-chlorobenzyl-(2-chloromethyl)benzimidazole

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: N-2-chlorobenzyl-(2-chloromethyl)benzimidazole
• 英文别名: 1-(2-chlorobenzyl)-2-(chloromethyl)-1H-benzo[d]imidazole；2-(chloromethyl)-1-(2-chlorobenzyl)-1H-benzo[d] imidazole；2-(chloromethyl)-1-[(2-chlorophenyl)methyl]benzimidazole
• 化学式: C₁₅H₁₂Cl₂N₂
• mdl: MFCD12487433
• 分子量: 291.18
• InChiKey: PKAFRCRWMOCGDO-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.1
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.133
• 拓扑面积：
  17.8
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  1

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-2-chlorobenzyl-(2-chloromethyl)benzimidazole 在 一水合肼 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  新型苯并咪唑与苯肼基碳硫代杂化物的合成及其抗惊厥活性

  摘要：

  合成了一系列新的苯并咪唑衍生物（4a - p），并评估了白化病小鼠对两种最常用模型（即最大电击惊厥（MES）和皮下戊四氮（scPTZ）诱发的惊厥）的抗惊厥活性。还使用旋转试验对合成的化合物进行了可能的神经毒性筛选。在合成的化合物中，4p在MES和scPTZ筛选中显示出最有希望的活性，并进一步在大鼠中表现出口服活性。在30 mg / kg的剂量下，它在scPTZ筛选中显示出巨大的活性。化合物的急性毒性研究（LD 50）表明，只有两种受试化合物4f和4m在任何剂量水平下均未产生任何死亡率。标题化合物的分子特性和药代动力学参数也使用Lipinski的5法则确定。令人鼓舞的结果鼓舞了人们对该核的合理修饰以开发更好的化合物的进一步研究。

  DOI：

  10.1007/s00044-016-1570-6
• 作为产物：
  描述：

  邻氯氯苄 在 盐酸 、 potassium carbonate 作用下， 以 乙醇 、 水 为溶剂， 生成 N-2-chlorobenzyl-(2-chloromethyl)benzimidazole
  参考文献：
  名称：

  Design, Synthesis and Antimicrobial Evaluation of Novel Benzimidazoleincorporated Naphthalimide Derivatives as Salmonella typhimurium DNA Intercalators, and Combination Researches

  摘要：

  目标：设计并制备一系列新颖的苯并咪唑基那酰亚胺衍生物，以应对不断增加的抗生素耐药性。 方法：通过氨解反应、N烷基化等方法，从商业4-溴-1，8-萘酐和邻苯二胺合成目标的新型苯并咪唑基那酰亚胺衍生物。通过双倍稀释技术在体外评估合成化合物的抗菌活性。利用UV-Vis光谱方法研究化合物10g与伤寒沙门氏菌DNA的相互作用。 结果：在这一系列中，携带2,4-二氯苯甲基基团的化合物10g相对于其他化合物表现出最佳的抗菌活性；尤其是，在与参考药物诺氟沙星（MIC = 4 μg/mL）相比较时，它对伤寒沙门氏菌表现出可比较的活性。进一步研究表明，化合物10g能有效地插入到伤寒沙门氏菌DNA中形成10g-DNA复合物，这可能与其抑制活性相关。分子对接结果表明，那酰亚胺化合物10g能通过π-π堆积与DNA六聚体双链的碱基对相互作用。此外，强活性化合物与临床药物的组合展现出比单独使用它们更好的抗菌效果，剂量更小，抗菌谱更广。值得注意的是，这些组合系统对氟康唑不敏感的红色链霉菌更为敏感。 结论：这项工作为优化苯并咪唑基那酰亚胺衍生物的结构，使其成为有效的抗菌剂提供了一个有前途的起点。

  DOI：

  10.2174/1573406417666210712105922

文献信息

• Evaluation of Cytotoxic Activity of New Benzimidazole-Piperazine Hybrids Against Human MCF-7 and A549 Cancer Cells
  作者：Aysun Özdemir、Sümeyye Turanli、Burcu Çalişkan、Mustafa Arka、Erden Banoglu

  DOI：10.1007/s11094-020-02119-9

  日期：2020.2

  A series of benzimidazole-piperazine hybrids (14 – 37) were designed, synthesized and evaluated for their cytotoxic activity against human lung (A549) and breast (MCF-7) cancer cell lines. Preliminary evaluation revealed that most of these hybrid molecules (i.e., 16 – 25) exhibited noteworthy and preferential antiproliferative effect against human lung cancer (A549) with IC50 values of 2.8 – 7.8 μM. Among the synthesized molecules, compound 17 showed the most balanced cytotoxic effect against lung (A549) and breast (MCF-7) cancer cells with IC50 values of 5.4 and 4.2 μM, respectively. To explore the mechanistic aspects fundamental to the observed activity, further biological studies of compounds 16, 17 and 22 were carried out. In addition, these compounds induced PARP-1 cleavage and caspase 7 activation, caused morphological changes such as bleb formation in the treated cells, and significantly increased the nuclear fragmentation. Taken all together, our findings indicate that cytotoxic activities of newly synthesized benzimidazole-piperazine hybrids are mediated through the apoptotic cell death induction. These benzimidazole derivatives have the potential for further development as anticancer agents.

  一系列苯并咪唑-哌嗪杂化物（14-37）被设计、合成并评估其对人肺（A549）和乳腺（MCF-7）癌细胞系的细胞毒性活性。初步评估显示，大多数这些杂化分子（即16-25）对人肺癌（A549）表现出显著且优先的抗增殖效果，IC50值为2.8-7.8 μM。在合成的分子中，化合物17对肺（A549）和乳腺（MCF-7）癌细胞的细胞毒性效果最为均衡，IC50值分别为5.4和4.2 μM。为了探讨与观察到的活性相关的机制方面，进一步对化合物16、17和22进行了生物学研究。此外，这些化合物诱导了PARP-1裂解和凋亡酶7激活，造成处理细胞的形态变化，如气泡形成，并显著增加了核碎裂。综合来看，我们的研究结果表明，新合成的苯并咪唑-哌嗪杂化物的细胞毒性活性是通过诱导凋亡细胞死亡介导的。这些苯并咪唑衍生物具有进一步开发作为抗癌药物的潜力。
• Discovery of Benzimidazole-Quinolone Hybrids as New Cleaving Agents toward Drug-Resistant <i>Pseudomonas aeruginosa</i> DNA
  作者：Ya-Nan Wang、Rammohan R. Yadav Bheemanaboina、Wei-Wei Gao、Jie Kang、Gui-Xin Cai、Cheng-He Zhou

  DOI：10.1002/cmdc.201700739

  日期：2018.5.23

  new potential antimicrobial agents were designed and synthesized. Bioactive assays indicated that some of the prepared compounds exhibited potent antibacterial and antifungal activities. Notably, 2‐fluorobenzyl derivative 5 b (ethyl 7‐chloro‐6‐fluoro‐1‐[[1‐[(2‐fluorophenyl)methyl]benzimidazol‐2‐yl]methyl]‐4‐oxo‐quinoline‐3‐carboxylate) showed remarkable antimicrobial activity against resistant Pseudomonas

  设计并合成了一系列作为新型潜在抗菌剂的苯并咪唑-喹诺酮杂化物。生物活性测定表明，一些制备的化合物表现出有效的抗菌和抗真菌活性。值得注意的是，2-氟苄基衍生物5 b（乙基7-氯-6-氟-1-基[[1-[（（2-氟苯基）甲基]苯并咪唑-2-基]甲基] -4-氧-喹啉-3-羧酸酯）对分离自感染患者的铜绿假单胞菌和热带假丝酵母具有显着的抗菌活性。活性分子5b不仅可以迅速杀死测试的菌株，而且对Hep-2细胞的毒性低。触发铜绿假单胞菌细菌耐药性的发展更加困难与针对诺氟沙星的5b相比。分子对接表明5b可以与拓扑异构酶IV-DNA复合物有效结合，并且量子化学研究从理论上阐明了化合物5b的良好抗菌活性。初步的实验反应机理探索表明，衍生物5b不能插入从耐药铜绿假单胞菌分离的DNA中，但能够有效切割DNA，这可能进一步阻止DNA复制，从而发挥强大的生物活性。另外，化合物5b是具有膜破坏能力的有前途的抗菌剂。
• 喹诺酮苯并咪唑类化合物及其制备方法和应 用
  申请人：西南大学

  公开号：CN104974138B

  公开（公告）日：2018-01-05

  本发明公开了喹诺酮苯并咪唑类化合物及其制备方法和应用，结构如通式(I)所示，该化合物具有抗微生物活性，对革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌和真菌都有一定的抑制活性，用于制备抗细菌和/或抗真菌药物，还可以与药学上的辅料组合制成单方或复方制剂。并且本发明公开的化合物所涉及的制备原料商业化程度高、便宜易得，制备路线短、方法简便，生产成本低，为临床抗微生物治疗提供更多高效、安全的候选药物。通用分子式中R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7和X如权利要求书所定义。
• Design, Synthesis and Cytotoxicity Evalufation of Substituted Benzimidazole Conjugated 1,3,4-Oxadiazoles
  作者：Nguyen Phu Quy、Bui Thi Buu Hue、Kiep Minh Do、Ha Thi Kim Quy、Tran Quang De、Tran Thi Bich Phuong、Pham Cong Trang、Nguyen Cuong Quoc、Hiroyuki Morita

  DOI：10.1248/cpb.c22-00162

  日期：2022.6.1

  MCF-7); and 4d, 4i, 7c (HeLa, MCF-7, A549), with the IC50 ranging from 2.7 to 38 µM. Notably, compound 4b illustrated almost 5-fold activity against the MCF-7 while 4d, 4i were 9- and 8-fold (HeLa), 4.5- and 13-fold (MCF-7), 4.7- and 4-fold (A549) increase in activity compared to 5-FU, respectively, and were found as lead compounds. These findings suggest that compounds 4b, 4d and 4i merit further

  设计、合成了两个系列的 2-取代苯并咪唑共轭 1,3,4-恶二唑衍生物，并评估了它们对三种人类癌细胞系（宫颈癌 (HeLa)、乳腺癌 (MCF-7) 和肺癌）的细胞毒活性(A549))。结果表明，与对照 5-氟尿嘧啶 (5-FU) 相比，14 种化合物对包括4c (HeLa) 在内的测试细胞系具有更强的细胞毒性；4b , 4e , 4h , 7i – j , 7m – n , 7s (MCF-7); 7b (MCF-7, A549); 7h（海拉，MCF-7）；和4d ,4i、7c（HeLa、MCF-7、A549），IC 50范围为 2.7 至 38 µM。值得注意的是，化合物4b对 MCF-7 的活性几乎是 5 倍，而4d、4i分别是 9 倍和 8 倍（HeLa）、4.5 倍和 13 倍（MCF-7）、4.7 倍和 4 倍（A549 ) 分别与 5-FU 相比活性增加，并被发现是先导化合
• Discovery of membrane active benzimidazole quinolones-based topoisomerase inhibitors as potential DNA-binding antimicrobial agents
  作者：Ling Zhang、Dinesh Addla、Jeyakkumar Ponmani、Ao Wang、Dan Xie、Ya-Nan Wang、Shao-Lin Zhang、Rong-Xia Geng、Gui-Xin Cai、Shuo Li、Cheng-He Zhou

  DOI：10.1016/j.ejmech.2016.01.052

  日期：2016.3

  A series of novel benzimidazole quinolones as potential antimicrobial agents were designed and synthesized. Most of the prepared compounds exhibited good or even stronger antimicrobial activities in comparison with reference drugs. The most potent compound 15m was membrane active and did not trigger the development of resistance in bacteria. It not only inhibited the formation of biofilms but also disrupted the established Staphylococcus aureus and Escherichia coli biofilms. It was able to inhibit the relaxation activity of E. coli topoisomerase IV at 10 mu M concentration. Moreover, this compound also showed low toxicity against mammalian cells. Molecular modeling and experimental investigation of compound 15m with DNA suggested that this compound could effectively bind with DNA to form a steady 15m-DNA complex which might further block DNA replication to exert the powerful bioactivities. (C) 2016 Elsevier Masson SAS. All rights reserved.