Fmoc-Asp-ODmab

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Fmoc-Asp-ODmab
• 英文别名: (3S)-4-[[4-[[1-(4,4-dimethyl-2,6-dioxocyclohexylidene)-3-methylbutyl]amino]phenyl]methoxy]-3-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-4-oxobutanoic acid
• 化学式: C₃₉H₄₂N₂O₈
• 分子量: 666.771
• InChiKey: QPTKEHUFSCXXEH-YTTGMZPUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.78
• 重原子数：
  49.0
• 可旋转键数：
  12.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  148.1
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-氟脲嘧啶 、 Fmoc-Asp-ODmab 在 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 22.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Conjugates for cancer therapy and diagnosis

  摘要：

  本发明涉及药物与氨基酸或氨基酸衍生物或类似物的结合物、包括该结合物的药物组合物以及使用方法。具体来说，本发明涉及抗增殖药物与天冬氨酸、谷氨酸及其类似物的结合物作为治疗癌症的组合物，以及影像剂载体与氨基酸的结合物用于肿瘤和转移瘤的诊断。

  公开号：

  US20070072800A1

文献信息

• A Cyclic Peptide Inhibitor of the iNOS–SPSB Protein–Protein Interaction as a Potential Anti-Infective Agent
  作者：Maiada M. Sadek、Nicholas Barlow、Eleanor W. W. Leung、Billy J. Williams-Noonan、Beow Keat Yap、Fairolniza Mohd Shariff、Tom T. Caradoc-Davies、Sandra E. Nicholson、David K. Chalmers、Philip E. Thompson、Ruby H. P. Law、Raymond S. Norton

  DOI：10.1021/acschembio.8b00561

  日期：2018.10.19

  targeted for degradation. Inhibition of this interaction increases iNOS levels, and consequently cellular nitric oxide (NO) concentrations, and has been proposed as a potential strategy for killing intracellular pathogens. We previously described two DINNN-containing cyclic peptides (CP1 and CP2) as potent inhibitors of the murine SPSB–iNOS interaction. In this study, we report the crystal structures

  包含SPRY域和SOCS框的蛋白质SPSB1，SPSB2和SPSB4与诱导型一氧化氮合酶（iNOS）相互作用，导致iNOS被多泛素化并靶向降解。抑制这种相互作用会增加iNOS的水平，从而增加细胞中一氧化氮（NO）的浓度，因此，有人提出将其作为杀死细胞内病原体的潜在策略。我们先前描述了两种含DINNN的环肽（CP1和CP2）作为鼠SPSB–iNOS相互作用的有效抑制剂。在这项研究中，我们报告人SPSB4绑定到CP1和CP2的晶体结构和人SPSB2绑定到CP2的晶体结构。然后，我们使用这些结构设计了一种新的抑制剂，其中分子内的氢键被烃键取代，从而形成了一个较小的大环，同时保持了晶体结构中观察到的CP2的结合几何形状。这种产生的五肽SPSB–iNOS抑制剂（CP3）具有减小的大环环大小，较少的非结合残基，并包括其他构象约束。CP3对SBSB2的亲和力更大（K D = 7 nM，由表面等离振子共振
• Identification of a new p53/MDM2 inhibitor motif inspired by studies of chlorofusin
  作者：Marco M.D. Cominetti、Sarah A. Goffin、Ewan Raffel、Kerrie D. Turner、Jordann C. Ramoutar、Maria A. O’Connell、Lesley A. Howell、Mark Searcey

  DOI：10.1016/j.bmcl.2015.06.014

  日期：2015.11

  Previous studies on the natural product chlorofusin have shown that the full peptide and azaphilone structure are required for inhibition of the interaction between MDM2 and p53. In the current work, we utilized the cyclic peptide as a template and introduced an azidonorvaline amino acid in place of the ornithine/azaphilone of the natural product and carried out click chemistry with the resulting peptide. From this small library the first ever non-azaphilone containing chlorofusin analog with MDM2/p53 activity was identified. Further studies then suggested that the simple structure of the Fmoc-norvaline amino acid that had undergone a click reaction was also able to inhibit MDM2/p53 interaction. This is an example where studies of a natural product have led to the serendipitous identification of a new small molecule inhibitor of a protein-protein interaction. (C) 2015 Elsevier Ltd. All rights reserved.