Vibrational spectroscopic analysis, molecular dynamics simulations and molecular docking study of 5-nitro-2-phenoxymethyl benzimidazole
作者:Vidya V. Menon、Egemen Foto、Y. Sheena Mary、Esin Karatas、C. Yohannan Panicker、Gözde Yalcin、Stevan Armaković、Sanja J. Armaković、C. Van Alsenoy、Ilkay Yildiz
DOI:10.1016/j.molstruc.2016.09.059
日期:2017.2
theoretically and experimentally. The splitting of N H stretching mode in the IR spectrum with a red shift from the calculated value indicates the weakening of the NH bond. The theoretical calculations give the phenyl ring breathing modes at 999 cm−1 for mono substituted benzene ring and at 1040 cm−1 for tri-substituted benzene ring. The theoretical NMR chemical shifts are in agreement with the experimental
摘要 对5-硝基-2-苯氧基甲基苯并咪唑的FT-IR和FT-Raman光谱进行了理论和实验记录和分析。红外光谱中NH伸缩模式的分裂与计算值的红移表明NH键的弱化。理论计算给出了单取代苯环在 999 cm-1 处和三取代苯环在 1040 cm-1 处的苯环呼吸模式。理论 NMR 化学位移与实验化学位移一致。亲电和亲核攻击的反应性最强的位点是根据 MEP 分析预测的。π 性质的 HOMO 在整个分子上离域,而 LUMO 位于整个分子上,除了单取代的苯环和氧原子。标题分子的反应位点已在 ALIE 表面和 Fukui 函数的帮助下定位。为了确定易于自动氧化的位置和对开始降解感兴趣的位置,已经计算了所有单非环键的键解离能。为了确定与水具有显着相互作用的原子,我们计算了分子动力学模拟后获得的径向分布函数。计算出的标题化合物的第一超极化率是标准非线性光学材料尿素的 58.03 倍。通过分子对接研究报告了标题化合物与