组蛋白脱乙酰酶 6 (H
DAC6) 是肿瘤和非肿瘤疾病的重要药物靶点。大多数可用的 H
DAC6
抑制剂 (H
DAC6i) 利用异羟
肟酸作为
锌结合基团,由于其潜在的遗传毒性,这限制了治疗机会。最近,据报道,二
氟甲基-1,3,4-恶二唑 (DFMOs) 是有效的选择性 H
DAC6i,但它们的抑制模式仍然是个谜。在此,我们报道了 DFMO 充当基于机制且基本上不可逆的 H
DAC6i。生化数据证实,DFMO 6 是一种紧密结合的 H
DAC6i,能够通过两步慢结合机制抑制 H
DAC6。晶体学和机理实验表明,
锌结合
水在最靠近二
氟甲基部分的 sp2 碳处侵蚀 6,随后恶二唑开环,产生去质子化的二
氟乙酰酰
肼 13 作为活性物质。13 的强阴离子
锌配位和 P571 口袋中二
氟甲基部分的结合最终导致对 H
DAC6 的基本上不可逆的抑制。