Discovery and Characterization of a Chemical Probe Targeting the Zinc-Finger Ubiquitin-Binding Domain of HDAC6
作者:Rachel J. Harding、Ivan Franzoni、Mandeep K. Mann、Magdalena M. Szewczyk、Bijan Mirabi、Renato Ferreira de Freitas、Dominic D. G. Owens、Suzanne Ackloo、Alexej Scheremetjew、Kevin A. Juarez-Ornelas、Randy Sanichar、Rachel J. Baker、Christian Dank、Peter J. Brown、Dalia Barsyte-Lovejoy、Vijayaratnam Santhakumar、Matthieu Schapira、Mark Lautens、Cheryl H. Arrowsmith
DOI:10.1021/acs.jmedchem.3c00314
日期:2023.8.10
an important role in autophagy and aggresome assembly. However, targeting this domain with small molecule antagonists remains an underdeveloped avenue of HDAC6-focused drug discovery. We report SGC-UBD253 (25), a chemical probe potently targeting HDAC6-UBD in vitro with selectivity over nine other UBDs, except for weak USP16 binding. In cells, 25 is an effective antagonist of HDAC6-UBD at 1 μM, with
组蛋白脱乙酰酶 6 (HDAC6) 抑制是治疗多种癌症的一种有吸引力的策略,HDAC6 催化抑制剂目前正在进行临床试验。HDAC6 锌指泛素结合结构域 (UBD) 结合非锚定泛素聚合物链和蛋白质聚集体的游离 C 端二甘氨酸基序,在自噬和聚集体组装中发挥重要作用。然而,用小分子拮抗剂靶向该结构域仍然是以 HDAC6 为重点的药物发现的不成熟途径。我们报告了SGC-UBD253 ( 25 ),这是一种在体外有效靶向 HDAC6-UBD 的化学探针,其选择性超过其他 9 个 UBD,但 USP16 结合较弱。在细胞中, 1 μM 25是 HDAC6-UBD 的有效拮抗剂,具有显着的蛋白质组范围选择性。我们鉴定了SGC-UBD253N ( 32 ),它是25的甲基化衍生物,其活性低 300 倍,用作阴性对照。25和32一起可以进一步探索 HDAC6-UBD 的生物学功能,并研究针对该结构域的治疗潜力。