Fragment-Linking Approach Using <sup>19</sup>F NMR Spectroscopy To Obtain Highly Potent and Selective Inhibitors of β-Secretase
作者:John B. Jordan、Douglas A. Whittington、Michael D. Bartberger、E. Allen Sickmier、Kui Chen、Yuan Cheng、Ted Judd
DOI:10.1021/acs.jmedchem.5b01917
日期:2016.4.28
and/or two-dimensional methods. Here, we demonstrate the utility and power of 19F-based fragment screening by detailing the identification of a second-site fragment through 19F NMR screening that binds to a specific pocket of the aspartic acid protease, β-secretase (BACE-1). The identification of this second-site fragment allowed the undertaking of a fragment-linking approach, which ultimately yielded
基于片段的药物发现(FBDD)已成为小分子药物发现工作中广泛使用的工具。检测片段弱结合的最常用生物物理方法之一是核磁共振(NMR)光谱。特别地,已经显示了使用基于19 F NMR的方法进行的FBDD与使用传统磁化转移和/或二维方法的1 H NMR相比具有多个优点。在这里,我们通过详细介绍通过19识别第二个位点的片段,展示了基于19 F的片段筛选的效用和功能与天冬氨酸蛋白酶β-分泌酶(BACE-1)的特定口袋结合的F NMR筛选。此第二个位点片段的鉴定允许采用片段连接方法,该方法最终产生了一种分子,其分子效力提高了360倍以上,同时保持了合理的配体效率,并获得了优于组织蛋白酶D(CatD)的选择性。分子的X射线晶体学研究表明,连接的片段表现出与从靶向筛选方法,空间核磁共振数据和分子模型预测的结合模式一致的结合模式。