5-[3-{2-(2-phthalamidoethoxy)ethoxy}propyn-1-yl]-2',3'-dideoxycytidine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-[3-{2-(2-phthalamidoethoxy)ethoxy}propyn-1-yl]-2',3'-dideoxycytidine
• 英文别名: N-[2-[2-[3-[4-amino-1-[(2R,5S)-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-5-yl]prop-2-ynoxy]ethoxy]ethyl]-2-formylbenzamide
• 化学式: C₂₄H₂₈N₄O₇
• 分子量: 484.509
• InChiKey: OAEAGJZCDYBXBT-PZJWPPBQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.9
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  153
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-[3-{2-(2-phthalamidoethoxy)ethoxy}propyn-1-yl]-2',3'-dideoxycytidine 、 三氟乙酸甲酯 在 乙二胺 作用下， 以 乙醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以33.7%的产率得到5-[3-{2-(2-trifluoroacetamidoethoxy)ethoxy}propyn-1-yl]-2',3'-dideoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  Propargylethoxyamino nucleotides

  摘要：

  本发明披露了具有以下结构的丙炔乙氧氨基核苷：##STR1## 其中，R.sub.1和R.sub.2是--H，较低的烷基或标记；B是7-脱氮嘌呤，嘌呤或嘧啶核苷碱基；W.sub.1是--H或--OH；W.sub.2是--OH或使核苷酸无法在3'-位点形成磷二酸酯键的基团；W.sub.3是--PO.sub.4，--P.sub.2 O.sub.7，--P.sub.3 O.sub.10，磷酸盐类似物或--OH。此外，提供了一种使用上述丙炔乙氧氨基核苷的引物延伸方法。

  公开号：

  US05821356A1
• 作为产物：
  描述：

  2-(2-(2-(prop-2-yn-1-yloxy)ethoxy)ethyl)isoindoline-1,3-dione 、 5-iodo-2',3'-dideoxycytidine 在 四(三苯基膦)钯 、 碘化亚铜 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以71.3%的产率得到5-[3-{2-(2-phthalamidoethoxy)ethoxy}propyn-1-yl]-2',3'-dideoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  Propargylethoxyamino nucleotides

  摘要：

  本发明披露了具有以下结构的丙炔乙氧氨基核苷：##STR1## 其中，R.sub.1和R.sub.2是--H，较低的烷基或标记；B是7-脱氮嘌呤，嘌呤或嘧啶核苷碱基；W.sub.1是--H或--OH；W.sub.2是--OH或使核苷酸无法在3'-位点形成磷二酸酯键的基团；W.sub.3是--PO.sub.4，--P.sub.2 O.sub.7，--P.sub.3 O.sub.10，磷酸盐类似物或--OH。此外，提供了一种使用上述丙炔乙氧氨基核苷的引物延伸方法。

  公开号：

  US05821356A1

文献信息

• Propargylethoxyamino nucleotide primer extensions
  申请人：The Perkin-Elmer Corporation

  公开号：US20020045180A1

  公开（公告）日：2002-04-18

  Propargylethoxyamino nucleosides are disclosed having the structure 1 wherein R 1 and R 2 are —H, lower alkyl, or label; B is a 7-deazapurine, purine, or pyrimidine nucleoside base; W 1 is —H or —OH; W 2 is —OH or a moiety which renders the nucleoside incapable of forming a phosphodiester bond at the 3′-position; and W 3 is —PO 4 , —P 2 O 7 , —P 3 O 10 , phosphate analog, or —OH. Additionally, a primer extension method is provided employing the above propargylethoxyamino nucleosides.

  本文披露了具有以下结构的丙炔乙氧氨基核苷：其中R1和R2为—H、低碳基或标记；B为7-脱氮嘌呤、嘌呤或嘧啶核苷碱基；W1为—H或—OH；W2为—OH或一种使核苷酸无法在3'-位点形成磷酸二酯键的基团；W3为—PO4、—P2O7、—P3O10、磷酸盐类似物或—OH。此外，还提供了一种使用上述丙炔乙氧氨基核苷的引物延伸方法。
• PROPARGYLETHOXYAMINO NUCLEOTIDES
  申请人：Khan H. Shaheer

  公开号：US20060286561A1

  公开（公告）日：2006-12-21

  Propargylethoxyamino nucleosides are disclosed having the structure wherein R 1 and R 2 are —H lower alkyl, or label; B is a 7-deazapurine, purine, or pyrimidine nucleoside base; W 1 is —H or —H; W 2 is —H or a moiety which renders the nucleoside incapable of forming a phosphodiester bond at the 3′-position; and W 3 is —PO 4 , —P 2 O 7 , —P 3 O 10 , phosphate analog, or —OH. Additionaly, a primer extension method is provided employing the above propargylethoxyamino nucleosides.

  本文揭示了具有以下结构的丙炔基乙氧基氨基核苷： 其中R1和R2是—H低碳基或标记；B是7-去氮嘌呤，嘌呤或嘧啶核苷碱基；W1是—H或—H；W2是—H或使核苷酸在3'-位点无法形成磷酸二酯键的基团；W3是—PO4，—P2O7，—P3O10，磷酸盐类似物或—OH。此外，提供了一种使用上述丙炔基乙氧基氨基核苷的引物延伸方法。
• US6248568B1
  申请人：——

  公开号：US6248568B1

  公开（公告）日：2001-06-19
• US6504024B2
  申请人：——

  公开号：US6504024B2

  公开（公告）日：2003-01-07
• US7019128B2
  申请人：——

  公开号：US7019128B2

  公开（公告）日：2006-03-28