摘要:
靶标特异性评分方法更常用于在对接至目标靶标的化合物中鉴定小分子抑制剂。这些方法中出现的最佳候选物很少经过蛋白质家族的活性和特异性测试。在这项研究中,我们将化学文库停靠在CaMKIIδ(Ca2 + /钙调蛋白(CaM)依赖性蛋白激酶(CaMK)家族的成员)中,并使用支持向量机SPecific(SVMSP)重新评估了所得的蛋白质-化合物结构。我们之前开发的针对特定目标的方法。在35个候选候选人中,确定了3个匹配项,例如喹唑啉化合物1(KIN-1; N4- [7-氯-2-[(E)-苯乙烯基]喹唑啉-4-基] -N1,N1-二乙基戊烷- 1,4-二胺),发现在单位数微摩尔IC50时抑制CaMKIIδ激酶活性。通过分析1的类似物(KIN-236; N4- [7-氯-2-[(E)-2-(2-氯-4,5-二甲氧基苯基)乙烯基]喹唑啉- 4-基] -N1,N1-N1-二乙基戊烷-1,4-二胺)和命中化合物2的类似物(KIN-15;