5-bromo-N-(3-pyrrolidin-1-ylpropyl)pyridine-3-carboxamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡啶及其衍生物
• 英文名称: 5-bromo-N-(3-pyrrolidin-1-ylpropyl)pyridine-3-carboxamide
• 英文别名: 5-bromo-N-(3-(pyrrolidin-1-yl)propyl)nicotinamide
• 化学式: C₁₃H₁₈BrN₃O
• mdl: MFCD13199780
• 分子量: 312.209
• InChiKey: DGCQYMXAZWFABT-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.7
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.538
• 拓扑面积：
  45.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-bromo-N-(3-pyrrolidin-1-ylpropyl)pyridine-3-carboxamide 在 四(三苯基膦)钯 、 sodium carbonate 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 氯仿 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 15.67h， 生成 5-(2-(octylcarbamoyl)phenyl)-N-(3-(pyrrolidin-1-yl)propyl)nicotinamide
  参考文献：
  名称：

  作为SMYD2抑制剂的LLY-507类似物的合成及其构效关系研究

  摘要：

  据报道，含有SET和MYND结构域的蛋白质2（SMYD2）是赖氨酸甲基转移酶，可催化组蛋白和非组蛋白蛋白质上赖氨酸残基的甲基化。作为癌症治疗的潜在靶标，有几种SMYD2抑制剂被报道，作为细胞活性抑制剂的LLY-507在几种癌细胞系中对SMYD2表现出亚微摩尔的效力。为了知道LLY-507的哪个结构片段适合化学修饰，选择了三个位点用于结构-活性关系研究（SAR）。在我们的重点文库中，化合物43和44 在位点C具有酰胺键的化合物显示了合理改善的效力，表明对该片段的修饰更加灵活，并且在该位置引入亲电子战斗部可能为SMYD2提供了靶向赖氨酸的共价抑制剂。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2020.127598
• 作为产物：
  描述：

  5-溴烟酸 、 1-(3-氨基丙基)吡咯烷 在 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 8.0h， 以73%的产率得到5-bromo-N-(3-pyrrolidin-1-ylpropyl)pyridine-3-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  作为SMYD2抑制剂的LLY-507类似物的合成及其构效关系研究

  摘要：

  据报道，含有SET和MYND结构域的蛋白质2（SMYD2）是赖氨酸甲基转移酶，可催化组蛋白和非组蛋白蛋白质上赖氨酸残基的甲基化。作为癌症治疗的潜在靶标，有几种SMYD2抑制剂被报道，作为细胞活性抑制剂的LLY-507在几种癌细胞系中对SMYD2表现出亚微摩尔的效力。为了知道LLY-507的哪个结构片段适合化学修饰，选择了三个位点用于结构-活性关系研究（SAR）。在我们的重点文库中，化合物43和44 在位点C具有酰胺键的化合物显示了合理改善的效力，表明对该片段的修饰更加灵活，并且在该位置引入亲电子战斗部可能为SMYD2提供了靶向赖氨酸的共价抑制剂。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2020.127598

文献信息

• Design, Synthesis, and Biological Activity of Substrate Competitive SMYD2 Inhibitors
  作者：Scott D. Cowen、Daniel Russell、Leslie A. Dakin、Huawei Chen、Nicholas A. Larsen、Robert Godin、Scott Throner、Xiaolan Zheng、Audrey Molina、Jiaquan Wu、Tony Cheung、Tina Howard、Renee Garcia-Arenas、Nicholas Keen、Christopher S. Pendleton、Jennifer A. Pietenpol、Andrew D. Ferguson

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.6b01303

  日期：2016.12.22

  methyltransferase that represses the functional activity of the tumor suppressor proteins p53 and RB. HTS screening led to identification of five distinct substrate-competitive chemical series. Determination of liganded crystal structures of SMYD2 contributed significantly to “hit-to-lead” design efforts, culminating in the creation of potent and selective inhibitors that were used to understand the functional

  蛋白质赖氨酸甲基转移酶（KMT）已成为表观遗传信号的重要调节剂。这些酶催化供体甲基从辅因子S-腺苷甲硫氨酸转移到组蛋白上的特定受体赖氨酸残基上，从而导致染色质结构和转录调控的改变。这些酶还使一系列非组蛋白蛋白甲基化，表明它们影响细胞生理的其他机制。据报道，SMYD2是一种致癌甲基转移酶，可抑制肿瘤抑制蛋白p53和RB的功能活性。HTS筛选导致鉴定出五个不同的底物竞争性化学系列。SMYD2配体晶体结构的确定显着有助于“铅中毒”设计工作，最终创造出了有效的和选择性的抑制剂，这些抑制剂用于了解SMYD2抑制的功能后果。综上所述，这些结果对于针对KMT的抑制剂设计具有广泛的意义，并清楚地证明了开发针对这些酶的新型疗法的潜力。