Aza-SAHA Derivatives Are Selective Histone Deacetylase 10 Chemical Probes That Inhibit Polyamine Deacetylation and Phenocopy HDAC10 Knockout
作者:Raphael R. Steimbach、Corey J. Herbst-Gervasoni、Severin Lechner、Tracy Murray Stewart、Glynis Klinke、Johannes Ridinger、Magalie N. E. Géraldy、Gergely Tihanyi、Jackson R. Foley、Ulrike Uhrig、Bernhard Kuster、Gernot Poschet、Robert A. Casero、Guillaume Médard、Ina Oehme、David W. Christianson、Nikolas Gunkel、Aubry K. Miller
DOI:10.1021/jacs.2c05030
日期:2022.10.19
transformed SAHA from an unselective pan-HDAC inhibitor into a specific HDAC10 inhibitor. Optimization of the aza-SAHA structure yielded the HDAC10 chemical probe DKFZ-748, with potency and selectivity demonstrated by cellular and biochemical target engagement, as well as thermal shift assays. Cocrystal structures of our aza-SAHA derivatives with HDAC10 provide a structural rationale for potency, and
我们报告了第一个充分表征的组蛋白脱乙酰酶 10 (HDAC10) 选择性化学探针,与其他 HDAC 同工酶相比具有前所未有的选择性。HDAC10 使多胺去乙酰化并具有独特的底物特异性,使其在 11 种锌依赖性 HDAC 水解酶中独一无二。从 HDAC10 多胺底物中汲取灵感,我们系统地将一个氨基(“aza-scan”)插入到获批药物 Vorinostat (SAHA) 的己基连接部分中。这种单原子置换 (C→N) 将 SAHA 从非选择性泛 HDAC 抑制剂转化为特异性 HDAC10 抑制剂。aza-SAHA 结构的优化产生了 HDAC10 化学探针DKFZ-748, 具有通过细胞和生化目标参与以及热转移分析证明的效力和选择性。我们的 aza-SAHA 衍生物与 HDAC10 的共晶结构提供了效力的结构原理,并且化学蛋白质组学分析证实了DKFZ-748在 HDAC 药物靶标景观中具有出色的细胞