利用羟基自由基结合质谱分析蛋白质足迹已成为一种功能强大的技术,可绘制蛋白质可接触溶剂的表面并检查溶液中蛋白质与蛋白质的相互作用。通过辐射分解或
化学方法产生的羟基自由基可与许多
氨基酸残基侧链有效反应,包括芳香族和含
硫残基以及脯
氨酸和亮
氨酸,可生成稳定的氧化产物,这些氧化产物对于检测蛋白质结构非常有用。在这项研究中,我们检查了组
氨酸,赖
氨酸和精
氨酸的放射氧化
化学,以与它们的
金属催化氧化产物进行比较。使用来自同步加速器X射线源或
铯137γ射线源的白光照射含有精
氨酸,组
氨酸和赖
氨酸的模型肽。氧化和辐射分解产物的速率主要通过包括串联质谱在内的电喷雾质谱来表征。精
氨酸对辐射氧化非常敏感,由于
胍基的损失和转化为γ-谷
氨酰胺基半醛而导致的特征产物质量降低了43 Da,这与以前的
金属催化氧化研究一致。组
氨酸被氧化以产生具有特征性质量变化的产物混合物,主要涉及
咪唑环的断裂和添加。通过放射分解将赖
氨酸转化为羟赖