[[5-[4-Amino-2-oxo-5-[2-[4-[2-[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]ethoxy]phenyl]ethynyl]pyrimidin-1-yl]oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] imidazole-1-carboxylate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯酚醚
• 英文名称: [[5-[4-Amino-2-oxo-5-[2-[4-[2-[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]ethoxy]phenyl]ethynyl]pyrimidin-1-yl]oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] imidazole-1-carboxylate
• 化学式: C₂₅H₂₄F₃N₆O₉P
• 分子量: 640.5
• InChiKey: JONJSUNLVMQIHH-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.9
• 重原子数：
  44
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  197
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  13

文献信息

• Nucleotide Compounds including a rigid linker
  申请人：Applied Biosystems, LLC

  公开号：EP2202238A1

  公开（公告）日：2010-06-30

  A nucleoside/tide compound having the structure: NUC-L-S-LB/LG, is described wherein NUC is a nucleoside/tide having a nucleobase portion B, L is a rigid linkage, S is a spacer; and LB/LG is a member of a linkage pair or a label. NUC is attached to L through B such that when B is a purine, L is attached to the 8-position of the purine, when B is 7-deazapurine, L is attached to the 7-position of the 7-deazapurine, and when B is pyrimidine, L is attached to the 5-position of the pyrimidine. In an important aspect of the invention, L has the structure (a) wherein each of n, o and p are integers ranging from 0 to 3, and the sum of n, o and p is at least 2, and each of W, X, Y and Z is selected from the group consisting of carbon and nitrogen. The invention further includes polynucleotide compounds comprising the nucleoside/tide, and primer extension methods utilizing the nucleoside/tide, particularly when used in combination with certain mutant polymerase enzymes.

  描述了一种具有以下结构的核苷/苷酸化合物：NUC-L-S-LB/LG：其中 NUC 是具有核碱基部分 B 的核苷/苷酸，L 是刚性连接，S 是间隔物；LB/LG 是连接对的成员或标签。NUC 通过 B 连接到 L 上，当 B 是嘌呤时，L 连接到嘌呤的 8 位；当 B 是 7-脱氮嘌呤时，L 连接到 7-脱氮嘌呤的 7 位；当 B 是嘧啶时，L 连接到嘧啶的 5 位。在本发明的一个重要方面，L 具有结构（a），其中 n、o 和 p 各为 0 至 3 的整数，且 n、o 和 p 之和至少为 2，W、X、Y 和 Z 各选自碳和氮组成的组。本发明还包括包含该核苷/苷的多核苷酸化合物，以及利用该核苷/苷的引物延伸方法，特别是与某些突变聚合酶结合使用时。