CRM646-A

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 单宁
• 英文名称: CRM646-A
• 英文别名: (2S,3S,4S,5R,6S)-6-[4-(4-carboxy-3-hydroxy-5-methylphenoxy)carbonyl-3-hydroxy-5-pentadecylphenoxy]-3,4,5-trihydroxyoxane-2-carboxylic acid
• 化学式: C₃₆H₅₀O₁₃
• 分子量: 690.785
• InChiKey: PNRVAHOSWLWYPO-QJUVDKAYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.5
• 重原子数：
  49
• 可旋转键数：
  21
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  221
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2,4-二羟基-6-甲基苯甲酸 在 palladium on activated charcoal 盐酸 、 4-二甲氨基吡啶 、 氢氧化钾 、 氢气 、 potassium carbonate 、 potassium hydrogencarbonate 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 为溶剂， 20.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 59.0h， 生成 CRM646-A
  参考文献：
  名称：

  Total Synthesis of CRM646-A and -B, Two Fungal Glucuronides with Potent Heparinase Inhibition Activities

  摘要：

  CRM646-A (1) and -B (2), two fungal glucuronides with a dimeric 2,4-dihydroxy-6-alkylbenzoic acid (orcinolp-depside) aglycone showing significant heparinase and telomerase inhibition activities, were synthesized for the first time. The successful approach involved construction of the phenol glucuronidic linkage, via coupling of the orsellinate derivative 27 with glucuronate bromide 7, before assembly of the phenolic ester linkage in the depside aglycone. Attempts via direct glycosylation of the depside aglycone derivatives were not successful.

  DOI：

  10.1021/jo051384k

文献信息

• Lead identification of novel tetrahydroimidazo[1,2-a]pyridine-5-carboxylic acid derivative as a potent heparanase-1 inhibitor
  作者：Yudai Imai、Daisuke Wakasugi、Ryo Suzuki、Sota Kato、Mami Sugisaki、Masashi Mima、Hiroh Miyagawa、Mayumi Endo、Natsuko Fujimoto、Takuya Fukunaga、Sayaka Kato、Shoichi Kuroda、Teisuke Takahashi、Hiroyuki Kakinuma

  DOI：10.1016/j.bmcl.2022.129050

  日期：2023.1

  (GUSβ) inhibitor, was found to have a weak inhibitory activity against endo-β-d-glucuronidase HPSE1. A structure–activity relationship study using the X-ray co-crystal structure of 10 and HPSE1 resulted in 12a, which showed a more than 14-fold increase in HPSE1 inhibitory activity compared with that of 10. Compound 12a could be a novel lead compound for the development of a potent HPSE1 inhibitor.

  乙酰肝素酶 1 (HPSE1) 是一种内切-β- d - 葡萄糖醛酸酶，可将硫酸乙酰肝素蛋白多糖切割成短链硫酸乙酰肝素 (HS)。HPSE1 的抑制对肾病综合征等蛋白尿疾病具有治疗潜力，因为 HPSE1 表达增加与肾小球基底膜中 HS 的丢失有关，从而导致蛋白尿的发展。本研究检查了先导化合物的生成，重点关注具有糖基的化学结构，例如糖苷和糖类似物，同时考虑了它们的物理特性。化合物10是一种外切-β- d -葡萄糖醛酸酶 (GUSβ) 抑制剂，被发现对内切具有微弱的抑制活性-β- d -葡萄糖醛酸酶 HPSE1。使用10和 HPSE1的 X 射线共晶结构进行的构效关系研究产生了12a ，与10相比，其 HPSE1 抑制活性增加了 14 倍以上。化合物12a可能是开发强效 HPSE1 抑制剂的新型先导化合物。