E-3,4-bis(5-amidino-2-benzimidazolyl)butene

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: E-3,4-bis(5-amidino-2-benzimidazolyl)butene
• 英文别名: 2-[(E)-3-(6-carbamimidoyl-1H-benzimidazol-2-yl)but-2-en-2-yl]-3H-benzimidazole-5-carboximidamide
• 化学式: C₂₀H₂₀N₈
• 分子量: 372.432
• InChiKey: HRPYHSLZGNRNBS-MDZDMXLPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.6
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.1
• 拓扑面积：
  157
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2,3-二甲基马来酸酐 、 4-(N-isopropylamidino)-1,2-phenylene diamine 在 PPA 作用下， 生成 E-3,4-bis(5-amidino-2-benzimidazolyl)butene
  参考文献：
  名称：

  烷基和芳基连接的双（ami基苯并咪唑）和双（ami基吲哚）的结构，DNA小沟结合和碱基对特异性。

  摘要：

  已经制备了一系列具有变化的连接链的双（ami基苯并咪唑）和双（ami基吲哚），所述连接链连接芳族基团并且对碱性a基进行了各种修饰。小牛胸腺（CT）DNA和核酸均聚物[poly（dA）.poly（dT），poly（dA-dT）.poly-（dA-dT）和poly（dG-dC）.poly（dG-dC） ）]已经通过热变性（ΔTm）和粘度研究了这些化合物的结合性能。该化合物对poly（dA）.poly（dT）和poly（dA-dT）.poly（dA-dT）的亲和力大于对poly（dG-dC）.poly（dG-dC）的亲和力。粘度滴定表明该化合物不通过嵌入结合。分子模型研究和生物物理数据表明，分子与CT DNA和均聚物的小沟结合。分子形状的分析与这种核酸结合模式一致。与苯并咪唑环相连的亚甲基数量为偶数的化合物比亚甲基数量为奇数的化合物对DNA的亲和力更高。确定分子中四个定义的基团的曲率半径的分子模

  DOI：

  10.1021/jm00064a008

文献信息

• Structure, DNA minor groove binding, and base pair specificity of alkyl- and aryl-linked bis(amidinobenzimidazoles) and bis(amidinoindoles)
  作者：Terri A. Fairley、Richard R. Tidwell、Isaac Donkor、Noreen A. Naiman、Kwasi A. Ohemeng、Richard J. Lombardy、James A. Bentley、Michael Cory

  DOI：10.1021/jm00064a008

  日期：1993.6

  A series of bis(amidinobenzimidazoles) and bis(amidinoindoles) with varied linking chains connecting the aromatic groups and various modifications to the basic amidino groups have been prepared. The calf thymus (CT) DNA and nucleic acid homopolymer [poly(dA).poly(dT),poly(dA-dT).poly-(dA-dT), and poly(dG-dC).poly(dG-dC)] binding properties of these compounds have been studied by thermal denaturation

  已经制备了一系列具有变化的连接链的双（ami基苯并咪唑）和双（ami基吲哚），所述连接链连接芳族基团并且对碱性a基进行了各种修饰。小牛胸腺（CT）DNA和核酸均聚物[poly（dA）.poly（dT），poly（dA-dT）.poly-（dA-dT）和poly（dG-dC）.poly（dG-dC） ）]已经通过热变性（ΔTm）和粘度研究了这些化合物的结合性能。该化合物对poly（dA）.poly（dT）和poly（dA-dT）.poly（dA-dT）的亲和力大于对poly（dG-dC）.poly（dG-dC）的亲和力。粘度滴定表明该化合物不通过嵌入结合。分子模型研究和生物物理数据表明，分子与CT DNA和均聚物的小沟结合。分子形状的分析与这种核酸结合模式一致。与苯并咪唑环相连的亚甲基数量为偶数的化合物比亚甲基数量为奇数的化合物对DNA的亲和力更高。确定分子中四个定义的基团的曲率半径的分子模