N,2-dibenzyl-3-(hydroxyamino)-3-oxopropanamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: N,2-dibenzyl-3-(hydroxyamino)-3-oxopropanamide
• 英文别名: N1,2-dibenzyl-N3-hydroxymalonamide；N,2-dibenzyl-N'-hydroxypropanediamide
• 化学式: C₁₇H₁₈N₂O₃
• 分子量: 298.342
• InChiKey: WKIMWNKNDQXNCK-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.18
• 拓扑面积：
  78.4
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-苄基丙二酸乙酯 在 氢氧化钾 、 草酰氯 、 三(三氟乙酸)硼烷 、 水 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 bromo-tris(1-pyrrolidinyl)phosphonium hexafluorophosphate 、 三氟乙酸 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 3.01h， 生成 N,2-dibenzyl-3-(hydroxyamino)-3-oxopropanamide
  参考文献：
  名称：

  针对金属蛋白酶家族的新型异羟肟酸文库：设计，平行合成和筛选。

  摘要：

  我们在此报告基于丙二酸-异羟肟酸模板的217种化合物的设计和平行合成。这些化合物是通过两步溶液阶段法获得的。所使用的各种不同的构建基组使该策略适合于寻找各种金属蛋白酶的抑制剂，并适合于研究新的金属蛋白酶的生物学作用。作为概念证明，我们在中性氨基肽酶（APN； EC 3.4.11.2）（M1家族的原型酶）上筛选了该文库。鉴定了几种亚微摩尔抑制剂。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2006.10.010

文献信息

• A library of novel hydroxamic acids targeting the metallo-protease family: Design, parallel synthesis and screening
  作者：Marion Flipo、Terence Beghyn、Julie Charton、Virginie A. Leroux、Benoit P. Deprez、Rebecca F. Deprez-Poulain

  DOI：10.1016/j.bmc.2006.10.010

  日期：2007.1.1

  We report here the design and parallel synthesis of 217 compounds based on a malonic-hydroxamic acid template. These compounds are obtained via a two-step solution-phase procedure. The set of diverse building-blocks used makes this strategy suitable for the search of inhibitors of various metallo-proteases and for the investigation of the biological role of new metallo-proteases. As a proof of concept

  我们在此报告基于丙二酸-异羟肟酸模板的217种化合物的设计和平行合成。这些化合物是通过两步溶液阶段法获得的。所使用的各种不同的构建基组使该策略适合于寻找各种金属蛋白酶的抑制剂，并适合于研究新的金属蛋白酶的生物学作用。作为概念证明，我们在中性氨基肽酶（APN； EC 3.4.11.2）（M1家族的原型酶）上筛选了该文库。鉴定了几种亚微摩尔抑制剂。
• Design and Synthesis of Malonic Acid-Based Inhibitors of Human Neutrophil Collagenase (MMP8)
  作者：Erich Graf von Roedern、Frank Grams、Hans Brandstetter、Luis Moroder

  DOI：10.1021/jm9706426

  日期：1998.1.1

  For most of the known synthetic inhibitors of matrix metalloproteinases (MMPs), a substrate-like binding mode was postulated on the basis of X-ray crystallographic structures of MMP/inhibitor complexes. Conversely, the malonic acid-based inhibitor (2R,S)-HONH-CO-CH(i-Bu)-CO-Ala-Gly-NH2 was found to bind in a surprisingly different manner. Using this compound as a new lead structure, the interaction sites with human neutrophil collagenase (MMP8) were optimized with a series of iteratively designed analogues and with the help of X-ray structural analysis of selected inhibitors to finally produce low molecular weight nonpeptidic compounds of 500-1000-fold improved inhibitory potency.
• Novel Selective Inhibitors of the Zinc Plasmodial Aminopeptidase PfA-M1 as Potential Antimalarial Agents
  作者：Marion Flipo、Terence Beghyn、Virginie Leroux、Isabelle Florent、Benoit P. Deprez、Rebecca F. Deprez-Poulain

  DOI：10.1021/jm061169b

  日期：2007.3.1

  Proteases that are expressed during the erythocytic stage of Plasmodium falciparum are newly explored drug targets for the treatment of malaria. We report here the discovery of potent inhibitors of PfA-M1, a metallo-aminopeptidase of the parasite. These compounds are based on a malonic hydroxamic template and present a very good selectivity toward neutral aminopeptidase (APN-CD13), a related protease in mammals. Structure-activity relationships in these series are described. Further optimization of the best inhibitor yielded a nanomolar, selective inhibitor of PfA-M1. This inhibitor displays good physicochemical and pharmacokinetic properties and a promising antimalarial activity.
• Controlling Plasma Stability of Hydroxamic Acids: A MedChem Toolbox
  作者：Paul Hermant、Damien Bosc、Catherine Piveteau、Ronan Gealageas、BaoVy Lam、Cyril Ronco、Matthieu Roignant、Hasina Tolojanahary、Ludovic Jean、Pierre-Yves Renard、Mohamed Lemdani、Marilyne Bourotte、Adrien Herledan、Corentin Bedart、Alexandre Biela、Florence Leroux、Benoit Deprez、Rebecca Deprez-Poulain

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.7b01444

  日期：2017.11.9

  Hydroxamic acids are outstanding zinc chelating groups that can be used to design potent and selective metalloenzyme inhibitors in various therapeutic areas. Some hydroxamic acids display a high plasma clearance resulting in poor in vivo activity, though they may be very potent compounds in vitro. We designed a 57-member library of hydroxamic acids to explore the structure–plasma stability relationships

  异羟肟酸是杰出的锌螯合基团，可用于设计各种治疗领域中的有效和选择性金属酶抑制剂。一些异羟肟酸显示出较高的血浆清除率，导致体内活性差，尽管它们在体外可能是非常有效的化合物。我们设计了一个由57名成员组成的异羟肟酸文库，以探索这些系列中结构与血浆的稳定性关系，并确定哪些酶和哪些药效团对血浆稳定性至关重要。芳基酯酶和羧酸酯酶被确定为异羟肟酸的主要代谢酶。最后，我们建议引入或删除结构特征以提高稳定性。因此，这项工作提供了第一个药物化学工具箱（实验程序和结构指导），用于评估和控制异羟肟酸的血浆稳定性，并充分发挥其作为体内药理探针和治疗剂的潜力。这项研究与临床前开发特别相关，因为它允许获得在人和啮齿动物模型中同样稳定的化合物。