1,3-bis[6-(3,6-dimethyl-2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-1-yl)hexyl]-5-methyl-1,2,3,4-tetrahydropyrimidine-2,4-dione

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 1,3-bis[6-(3,6-dimethyl-2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-1-yl)hexyl]-5-methyl-1,2,3,4-tetrahydropyrimidine-2,4-dione
• 英文别名: 1,3-bis[6-(3,6-dimethyluracil-1-yl)hexyl]thymine；1,3-Bis[6-(3,6-dimethyl-2,4-dioxo-1,2,3,4-tetra-hydropyrimidin-1-yl)hexyl]-5-methyl-1,2,3,4-tetra-hydropyrimidine-2,4-dione；1-[6-[3-[6-(3,6-dimethyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)hexyl]-5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl]hexyl]-3,6-dimethylpyrimidine-2,4-dione
• 化学式: C₂₉H₄₂N₆O₆
• 分子量: 570.689
• InChiKey: ZENZMQHLNNMBQW-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.7
• 重原子数：
  41
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.59
• 拓扑面积：
  122
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1,3-bis[6-(3,6-dimethyl-2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-1-yl)hexyl]-5-methyl-1,2,3,4-tetrahydropyrimidine-2,4-dione 、 聚合甲醛 在 盐酸 、 copper(l) chloride 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 35.0h， 以30%的产率得到10,16,27,30,31-pentamethyl-1,8,10,16,18,25-hexaazatetracyclo[23.3.1.1^8,12.1^14,18]hentriaconta-12(30),14(31),25(28)-triene-9,11,15,17,25,29-hexaone
  参考文献：
  名称：

  三尿嘧啶 – 1,3-双[ω-(N-甲基尿嘧啶-1-基)烷基]胸腺嘧啶及其 5,5'-环状对应物

  摘要：

  研究了一系列无环化合物，其中两个 3,6-二甲基尿嘧啶或 3-甲基尿嘧啶单元通过聚亚甲基或二甲苯间隔物连接到胸腺嘧啶或异氰脲酸酯片段。在氯化铜 (I) 存在下，在 HCl 水溶液中与多聚甲醛发生闭环反应得到嘧啶并烷，它可以被认为是无环三尿嘧啶的大环对应物。通过 X 射线衍射数据，固态大环的结构以尿嘧啶单元的紧密排列为特征，但它们之间没有 π-π 接触。相反，大环三尿嘧啶与其无环对应物相比显着减色表明在氯仿和 H2O 溶液中胸腺嘧啶和 3,6-二甲基尿嘧啶单元之间存在堆积。溶液中无环和大环化合物的构象行为已通过 NMR、UV 和计算方法确定。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2007)

  DOI：

  10.1002/ejoc.200700162
• 作为产物：
  描述：

  thymine disodium salt 、 1-(6-bromohex-1-y)-3,6-dimethyluracil 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以67%的产率得到1,3-bis[6-(3,6-dimethyl-2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-1-yl)hexyl]-5-methyl-1,2,3,4-tetrahydropyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  三尿嘧啶 – 1,3-双[ω-(N-甲基尿嘧啶-1-基)烷基]胸腺嘧啶及其 5,5'-环状对应物

  摘要：

  研究了一系列无环化合物，其中两个 3,6-二甲基尿嘧啶或 3-甲基尿嘧啶单元通过聚亚甲基或二甲苯间隔物连接到胸腺嘧啶或异氰脲酸酯片段。在氯化铜 (I) 存在下，在 HCl 水溶液中与多聚甲醛发生闭环反应得到嘧啶并烷，它可以被认为是无环三尿嘧啶的大环对应物。通过 X 射线衍射数据，固态大环的结构以尿嘧啶单元的紧密排列为特征，但它们之间没有 π-π 接触。相反，大环三尿嘧啶与其无环对应物相比显着减色表明在氯仿和 H2O 溶液中胸腺嘧啶和 3,6-二甲基尿嘧啶单元之间存在堆积。溶液中无环和大环化合物的构象行为已通过 NMR、UV 和计算方法确定。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2007)

  DOI：

  10.1002/ejoc.200700162

文献信息

• Synthesis of acyclic and macrocyclic analogs of Di-, Tri-, and tetranucleotides
  作者：V. E. Semenov、V. D. Akamsin、V. S. Reznik

  DOI：10.1134/s1070363207080233

  日期：2007.8

  Compounds consisting of two or three uracil fragments were synthesized by reaction of methyl-substituted uracil sodium salts with 1-(6-bromohexyl)-3,6-dimethyluracil or 1,6-dibromohexane. Treatment of these compounds with paraformaldehyde gave the corresponding pyrimidinophanes and acyclic compounds in which the uracil fragments are linked through methylene bridges. Uracil derivatives having no substituent on N-3 were synthesized by reactions of silylated uracils with 1,3-bis(6-bromohexyl)uracil or 4,4'-(6-bromohexyloxy)diphenylmethane. The acyclic compound was converted into pyrimidinophane containing uracil fragments with (NH)-H-3 groups. A trinucleotide analog including uracil and two adenine fragments was synthesized from 1,3-bis(6-bromohexyl)uracil.