2-(prop-2-yn-1-yl thio)-4-(thiazol-2-ylthio)-6-(3,4,5-trimethoxyphenyl)pyrimidine-5-carbonitrile

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机硫化合物 - 硫醚类
• 英文名称: 2-(prop-2-yn-1-yl thio)-4-(thiazol-2-ylthio)-6-(3,4,5-trimethoxyphenyl)pyrimidine-5-carbonitrile
• 化学式: C₂₀H₁₆N₄O₃S₃
• 分子量: 456.6
• InChiKey: UMFGYTRZVQGWNF-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.2
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  169
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  3,4,5-三甲氧基苯甲醛 在 potassium carbonate 、 三氯氧磷 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 乙醇 为溶剂， 反应 11.0h， 生成 2-(prop-2-yn-1-yl thio)-4-(thiazol-2-ylthio)-6-(3,4,5-trimethoxyphenyl)pyrimidine-5-carbonitrile
  参考文献：
  名称：

  针对 DCN1-UBE2M 相互作用的强效 5-Cyano-6-phenyl-pyrimidin-based 衍生物。

  摘要：

  Cullin-RING E3 连接酶 (CRL) 的 Neddylation 调节大约 20% 的细胞蛋白的稳态。cullin neddylation 1 (DCN1) 缺陷作为一种 co-E3 连接酶，与 UBE2M 相互作用以增强 CRL 的激活，这种相互作用正在成为人类疾病的治疗靶点。在这里，我们提出了一系列针对 DCN1-UBE2M 相互作用的基于嘧啶的小分子抑制剂。在找到 IC50 = 1.2 μM 的新型抑制剂 DC-1 后，我们进行了一系列化学优化，最终发现了一种含有 5-氰基-6-苯基嘧啶基抑制剂 DC-2 (IC50 = 15) 的强效噻唑纳米）。接下来，使用蛋白质和细胞热位移分析、免疫共沉淀、分子对接和位点特异性突变实验，我们进一步证明 DC-2 在分子和细胞水平上特异性抑制 UBE2M 和 DCN1 的相互作用，导致 cullin3 的 neddylation 减少和其底物

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.9b00003

文献信息

• Potent 5-Cyano-6-phenyl-pyrimidin-Based Derivatives Targeting DCN1–UBE2M Interaction
  作者：Wenjuan Zhou、Liying Ma、Lina Ding、Qian Guo、Zhangxu He、Jing Yang、Hui Qiao、Lingyu Li、Jie Yang、Shimin Yu、Lili Zhao、Shaomeng Wang、Hong-Min Liu、Zhenhe Suo、Wen Zhao

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.9b00003

  日期：2019.6.13

  in cullin neddylation 1 (DCN1), as a co-E3 ligase, interacts with UBE2M to enhance the activation of CRLs, and this interaction is emerging as a therapeutic target for human diseases. Here, we present a series of pyrimidin-based small molecular inhibitors targeting DCN1-UBE2M interaction. After finding a novel inhibitor DC-1 with IC50 = 1.2 μM, we performed a series of chemical optimizations, which finally

  Cullin-RING E3 连接酶 (CRL) 的 Neddylation 调节大约 20% 的细胞蛋白的稳态。cullin neddylation 1 (DCN1) 缺陷作为一种 co-E3 连接酶，与 UBE2M 相互作用以增强 CRL 的激活，这种相互作用正在成为人类疾病的治疗靶点。在这里，我们提出了一系列针对 DCN1-UBE2M 相互作用的基于嘧啶的小分子抑制剂。在找到 IC50 = 1.2 μM 的新型抑制剂 DC-1 后，我们进行了一系列化学优化，最终发现了一种含有 5-氰基-6-苯基嘧啶基抑制剂 DC-2 (IC50 = 15) 的强效噻唑纳米）。接下来，使用蛋白质和细胞热位移分析、免疫共沉淀、分子对接和位点特异性突变实验，我们进一步证明 DC-2 在分子和细胞水平上特异性抑制 UBE2M 和 DCN1 的相互作用，导致 cullin3 的 neddylation 减少和其底物