(5R,6R,7S,8R)-6,8-bis(benzyloxy)-5-((benzyloxy)methyl)-5,6,7,8-tetrahydroimidazo[1,2-a]pyridin-7-ol

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并吡啶类
• 英文名称: (5R,6R,7S,8R)-6,8-bis(benzyloxy)-5-((benzyloxy)methyl)-5,6,7,8-tetrahydroimidazo[1,2-a]pyridin-7-ol
• 英文别名: (5R,6R,7S,8R)-6,8-bis(phenylmethoxy)-5-(phenylmethoxymethyl)-5,6,7,8-tetrahydroimidazo[1,2-a]pyridin-7-ol
• 化学式: C₂₉H₃₀N₂O₄
• 分子量: 470.568
• InChiKey: PJEWOKWXKDZJBC-GCFVYEKYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.1
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.28
• 拓扑面积：
  65.7
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (5R,6R,7S,8R)-6,8-bis(benzyloxy)-5-((benzyloxy)methyl)-5,6,7,8-tetrahydroimidazo[1,2-a]pyridin-7-ol 在 三氟甲磺酸 、 potassium carbonate 作用下， 以 甲醇 、 甲苯 为溶剂， 反应 8.17h， 生成 (5R,6R,7S,8R)-7-(3,4,6-tri-O-benzyl-α-D-mannopyranosyloxy)-6,8-bis(benzyloxy)-5-(benzyloxymethyl)-5,6,7,8-tetrahydroimidazo[1,2-a]pyridine
  参考文献：
  名称：

  GH99 家族内切-α-1,2-甘露聚糖酶基于机制的抑制剂设计策略的探索

  摘要：

  内切-α-1,2-甘露糖苷酶和-甘露聚糖酶是糖苷水解酶家族 99 (GH99) 的成员，可切割哺乳动物N连接聚糖和真菌 α- 内的 α-Glc/Man-1,3-α-Man-OR 结构分别是甘露聚糖。建议它们通过两步机制发挥作用，涉及包含两种保守催化羧酸酯的 1,2-脱水糖“环氧化物”中间体。在第一步中，一个羧酸盐充当通用碱，使与可裂变糖苷键相邻的2-羟基去质子化，另一个则为糖苷配基的离开提供通用酸帮助。我们在此报告了两种抑制剂的合成，旨在与通用碱（α-甘露糖基-1,3-（2-氨基脱氧甘露尻霉素），Man2NH 2 DMJ）或通用酸（α-甘露糖基-1,3-甘露咪唑，曼曼我）。观察到来自多形拟杆菌的内切-α-1,2-甘露聚糖酶具有适度的亲和力。结构研究表明，Man2NH 2 DMJ 与其他亚氨基糖抑制剂一样结合，这表明该化合物表现出的不良抑制作用并不是由于未能实现与一般碱基的预期相互作用，而是由于环内氮的碱度降低所致由

  DOI：

  10.1002/chem.201800435
• 作为产物：
  描述：

  (5R,6R,7S,8R)-7-(2-naphthylmethyl)-6,8-bis(benzyloxy)-5-(benzyloxy)methyl-5,6,7,8-tetrahydroimidazo1,2-apyridine 在 2,3-二氯-5,6-二氰基-1,4-苯醌 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 以67%的产率得到(5R,6R,7S,8R)-6,8-bis(benzyloxy)-5-((benzyloxy)methyl)-5,6,7,8-tetrahydroimidazo[1,2-a]pyridin-7-ol
  参考文献：
  名称：

  GH99 家族内切-α-1,2-甘露聚糖酶基于机制的抑制剂设计策略的探索

  摘要：

  内切-α-1,2-甘露糖苷酶和-甘露聚糖酶是糖苷水解酶家族 99 (GH99) 的成员，可切割哺乳动物N连接聚糖和真菌 α- 内的 α-Glc/Man-1,3-α-Man-OR 结构分别是甘露聚糖。建议它们通过两步机制发挥作用，涉及包含两种保守催化羧酸酯的 1,2-脱水糖“环氧化物”中间体。在第一步中，一个羧酸盐充当通用碱，使与可裂变糖苷键相邻的2-羟基去质子化，另一个则为糖苷配基的离开提供通用酸帮助。我们在此报告了两种抑制剂的合成，旨在与通用碱（α-甘露糖基-1,3-（2-氨基脱氧甘露尻霉素），Man2NH 2 DMJ）或通用酸（α-甘露糖基-1,3-甘露咪唑，曼曼我）。观察到来自多形拟杆菌的内切-α-1,2-甘露聚糖酶具有适度的亲和力。结构研究表明，Man2NH 2 DMJ 与其他亚氨基糖抑制剂一样结合，这表明该化合物表现出的不良抑制作用并不是由于未能实现与一般碱基的预期相互作用，而是由于环内氮的碱度降低所致由

  DOI：

  10.1002/chem.201800435

文献信息

• Synthesis and evaluation of 3-deoxy and 3-deoxy-3-fluoro derivatives of gluco- and manno-configured tetrahydropyridoimidazole glycosidase inhibitors
  作者：Cécile Ouairy、Thierry Cresteil、Bernard Delpech、David Crich

  DOI：10.1016/j.carres.2013.05.011

  日期：2013.8

  Three tetrahydropyridoimidazole-type glycosidase inhibitors have been synthesized with the 3-deoxy ribo-and arabino-, and 3-deoxy-3-fluoro gluco-configurations and two of them screened for activity against alpha- and beta-gluco-and mannosidase enzymes. Only one substance, the 3-deoxy-3-fluoro-derivative of the gluco-configured tetrahydropyridoimidazole was found to have any activity against a single enzyme, sweet almond beta-glucosidase, and even then at a level 100-fold lower than that of the corresponding simple gluco-configured tetrahydropyridoimidazole thereby underlining the importance of the 3-hydroxy group in the key substrate-enzyme interactions. (c) 2013 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Exploration of Strategies for Mechanism‐Based Inhibitor Design for Family GH99 <i>endo</i> ‐α‐1,2‐Mannanases
  作者：Pearl Z. Fernandes、Marija Petricevic、Lukasz Sobala、Gideon J. Davies、Spencer J. Williams

  DOI：10.1002/chem.201800435

  日期：2018.5.23

  herein the synthesis of two inhibitors designed to interact with either the general base (α‐mannosyl‐1,3‐(2‐aminodeoxymannojirimycin), Man2NH2DMJ) or the general acid (α‐mannosyl‐1,3‐mannoimidazole, ManManIm). Modest affinities were observed for an endo‐α‐1,2‐mannanase from Bacteroides thetaiotaomicron. Structural studies revealed that Man2NH2DMJ binds like other iminosugar inhibitors, which suggests that

  内切-α-1,2-甘露糖苷酶和-甘露聚糖酶是糖苷水解酶家族 99 (GH99) 的成员，可切割哺乳动物N连接聚糖和真菌 α- 内的 α-Glc/Man-1,3-α-Man-OR 结构分别是甘露聚糖。建议它们通过两步机制发挥作用，涉及包含两种保守催化羧酸酯的 1,2-脱水糖“环氧化物”中间体。在第一步中，一个羧酸盐充当通用碱，使与可裂变糖苷键相邻的2-羟基去质子化，另一个则为糖苷配基的离开提供通用酸帮助。我们在此报告了两种抑制剂的合成，旨在与通用碱（α-甘露糖基-1,3-（2-氨基脱氧甘露尻霉素），Man2NH 2 DMJ）或通用酸（α-甘露糖基-1,3-甘露咪唑，曼曼我）。观察到来自多形拟杆菌的内切-α-1,2-甘露聚糖酶具有适度的亲和力。结构研究表明，Man2NH 2 DMJ 与其他亚氨基糖抑制剂一样结合，这表明该化合物表现出的不良抑制作用并不是由于未能实现与一般碱基的预期相互作用，而是由于环内氮的碱度降低所致由