Exploitation of Conformational Dynamics in Imparting Selective Inhibition for Related Matrix Metalloproteinases
作者:Kiran V. Mahasenan、Maria Bastian、Ming Gao、Emma Frost、Derong Ding、Katerina Zorina-Lichtenwalter、John Jacobs、Mark A. Suckow、Valerie A. Schroeder、William R. Wolter、Mayland Chang、Shahriar Mobashery
DOI:10.1021/acsmedchemlett.7b00130
日期:2017.6.8
Matrix metalloproteinases (MMPs) have numerous physiological functions and share a highly similar catalytic domain. Differential dynamical information on the closely related human MMP-8, -13, and -14 was integrated onto the benzoxazinone molecular template. An in silico library of 28,099 benzoxazinones was generated and evaluated in the context of the molecular-dynamics information. This led to experimental
基质金属蛋白酶(MMP)具有多种生理功能,并具有高度相似的催化结构域。有关紧密相关的人类MMP-8,-13和-14的差异动力学信息被整合到苯并嗪酮分子模板中。在分子动力学信息的背景下,生成了一个包含28,099个苯并恶嗪酮的计算机电子文库,并对其进行了评估。这导致对19种合成化合物进行实验评估并鉴定选择性抑制剂,这些抑制剂在描述MMP的生理功能方面具有潜在的实用性。此外,该方法作为一个例子,说明如何利用紧密相关的活性位点的动力学来实现小分子的选择性抑制,并应在具有相似活性位点的其他酶家族中找到应用。