抗菌肽POLYBIA-MP1 | 872043-01-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机聚合物 - 多肽
• 中文名称: 抗菌肽POLYBIA-MP1
• 英文名称: IDWKKLLDAAKQIL-NH2
• 英文别名: polybia MPI；H-Ile-Asp-Trp-Lys-Lys-Leu-Leu-Asp-Ala-Ala-Lys-Gln-Ile-Leu-NH2；(3S)-4-[[(2S)-1-[[(2S)-1-[[(2S)-6-amino-1-[[(2S)-5-amino-1-[[(2S,3S)-1-[[(2S)-1-amino-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-1,5-dioxopentan-2-yl]amino]-1-oxohexan-2-yl]amino]-1-oxopropan-2-yl]amino]-1-oxopropan-2-yl]amino]-3-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-6-amino-2-[[(2S)-6-amino-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S,3S)-2-amino-3-methylpentanoyl]amino]-3-carboxypropanoyl]amino]-3-(1H-indol-3-yl)propanoyl]amino]hexanoyl]amino]hexanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]-4-oxobutanoic acid
• CAS: 872043-01-1
• 化学式: C₇₈H₁₃₂N₂₀O₁₉
• 分子量: 1654.03
• InChiKey: WQWSKHPVGKVCQT-KXOXSZQSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.5
• 重原子数：
  117
• 可旋转键数：
  58
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.68
• 拓扑面积：
  659
• 氢给体数：
  22
• 氢受体数：
  23

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  Fmoc-L-亮氨酸 、 Fmoc-L-丙氨酸 、 Fmoc-L-天冬氨酸 beta-叔丁酯 、 Fmoc-L-异亮氨酸 、 Fmoc-L-色氨酸 、 N-alpha-芴甲氧羰基-N-epsilon-叔丁氧羰基-L-赖氨酸 、 Fmoc-L-谷氨酰胺 在 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 哌啶 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.89h， 以5%的产率得到抗菌肽POLYBIA-MP1
  参考文献：
  名称：

  简化的脂质II结合抗菌肽：乳链菌肽环A和B与成孔肽的生物结合物的设计，合成和抗菌活性

  摘要：

  迫切需要新的抗菌肽设计，以应对近期对抗生素耐药性增加带来的威胁。在本文中，我们基于羊毛硫抗生素乳链菌肽的关键结构特征，提出了一系列新的抗菌肽。我们通过将乳链菌肽N末端的脂质II结合基序缀合到一系列具有已知抗菌作用和成孔特性的阳离子肽和类肽，简化了乳链菌肽的结构。使用亲水性PEG4接头的杂合肽对黄褐微球菌显示出良好的抗菌活性。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2018.10.015

文献信息

• Effect of substituting glutamine with lysine on structural and biological properties of antimicrobial peptide Polybia-MP1
  作者：Hai Bui Thi Phuong、Van Anh Tran、Khoa Nguyen Ngoc、Viet Nguyen Huu、Hang Ngo Thu、Mao Can Van、Hue Pham Thi、Minh Nguyen Hong、Hiep Tuan Tran、Huy Luong Xuan

  DOI：10.1007/s00726-023-03276-3

  日期：2023.7
• Simplified lipid II-binding antimicrobial peptides: Design, synthesis and antimicrobial activity of bioconjugates of nisin rings A and B with pore-forming peptides
  作者：Serena A. Mitchell、Fiona Truscott、Rachael Dickman、John Ward、Alethea B. Tabor

  DOI：10.1016/j.bmc.2018.10.015

  日期：2018.11

  antimicrobial peptides are urgently needed in order to combat the threat posed by the recent increase of resistance to antibiotics. In this paper, we present a new series of antimicrobial peptides, based on the key structural features of the lantibiotic nisin. We have simplified the structure of nisin by conjugating the lipid II-binding motif at the N-terminus of nisin to a series of cationic peptides and peptoids

  迫切需要新的抗菌肽设计，以应对近期对抗生素耐药性增加带来的威胁。在本文中，我们基于羊毛硫抗生素乳链菌肽的关键结构特征，提出了一系列新的抗菌肽。我们通过将乳链菌肽N末端的脂质II结合基序缀合到一系列具有已知抗菌作用和成孔特性的阳离子肽和类肽，简化了乳链菌肽的结构。使用亲水性PEG4接头的杂合肽对黄褐微球菌显示出良好的抗菌活性。