作者:Sai Pradeep Velagapudi、Matthew G. Costales、Balayeshwanth R. Vummidi、Yoshio Nakai、Alicia J. Angelbello、Tuan Tran、Hafeez S. Haniff、Yasumasa Matsumoto、Zi Fu Wang、Arnab K. Chatterjee、Jessica L. Childs-Disney、Matthew D. Disney
DOI:10.1016/j.chembiol.2018.05.015
日期:2018.9
Potential RNA drug targets for small molecules are found throughout the human transcriptome, yet small molecules known to elicit a pharmacological response by directly targeting RNA are limited to antibacterials. Herein, we describe AbsorbArray, a small molecule microarray-based approach that allows for unmodified compounds, including FDA-approved drugs, to be probed for binding to RNA motif libraries
在整个人类转录组中都发现了小分子的潜在RNA药物靶标,但是已知通过直接靶向RNA引起药理反应的小分子仅限于抗菌剂。在本文中,我们描述了AbsorbArray,这是一种基于小分子微阵列的方法,允许以未经修饰的化合物(包括FDA批准的药物)以大规模平行形式与RNA基序文库结合进行探测。几种药物结合RNA,包括激酶和拓扑异构酶抑制剂。后者与致癌microRNA(miR)-21的Dicer位点中发现的基序紧密结合,并在体外和细胞中均抑制了其加工。最有效的化合物可抑制下游蛋白质靶标并抑制miR-21介导的侵袭性表型。该化合物的活性在pre-miR-21过表达时被消除。