1H-嘧啶并[1,2-a]嘌呤-10-酮 | 103408-45-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 中文名称: 1H-嘧啶并[1,2-a]嘌呤-10-酮
• 英文名称: pyrimido[1,2-a]purin-10(3H)-one
• 英文别名: Pyrimido[1,2-a]purin-10(1H)-one；1H-pyrimido[1,2-a]purin-10-one
• CAS: 103408-45-3
• 化学式: C₈H₅N₅O
• mdl: MFCD03413766
• 分子量: 187.161
• InChiKey: ZREGNVKUSNORFO-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  >179°C (Dec.)
• 沸点：
  561.5±42.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.82±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  可溶于乙腈（少许）、DMSO（少许）、甲醇（少许）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.6
• 重原子数：
  14
• 可旋转键数：
  0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.0
• 拓扑面积：
  73.7
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1H-嘧啶并[1,2-a]嘌呤-10-酮 在 2-吗啉乙磺酸 、 trans-N-deoxyribosylase 作用下， 以 水 、 溶剂黄146 为溶剂， 反应 50.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  醛反应探针标记和液相色谱串联质谱法分析DNA中的M1G-dR。

  摘要：

  开发了一种测定嘧啶并[1,2-a]嘌呤-10（3H）one（M1G）的新方法。由于该病灶存在于闭环形式和开环醛形式之间的平衡中，因此混淆了分析M1G的先前方法。醛形式的检测灵敏度差可能是由于加合物在与胺或蛋白质的反应过程中分析过程中加合物的损失。我们利用醛反应探针（ARP）产生稳定的ARP-M1G-脱氧核糖（ARP-M1G-dR）共轭物，以最大程度地减少加合物损失。通过使用固相萃取，该结合物增加了疏水性，从而增强了ARP-M1G-dR从未修饰的DNA核苷中的分离。此外，通过[ARP-M1G-dR + H] +（635）的选择性反应监测（SRM）测量ARP-M1G-dR-> [M1G + H] +（188）跃迁相对于SRM对M1G-dR的测量将检测灵敏度提高了近一个数量级。为了进行准确的测量，使用了分析标准品（AS）DNA和内标（IS）DNA。从已在含有（15NH4）2SO4的最低盐培养基中

  DOI：

  10.1021/tx049853l
• 作为产物：
  描述：

  鸟嘌呤 、 tetraethoxypropane 以 盐酸 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 1H-嘧啶并[1,2-a]嘌呤-10-酮
  参考文献：
  名称：

  醛反应探针标记和液相色谱串联质谱法分析DNA中的M1G-dR。

  摘要：

  开发了一种测定嘧啶并[1,2-a]嘌呤-10（3H）one（M1G）的新方法。由于该病灶存在于闭环形式和开环醛形式之间的平衡中，因此混淆了分析M1G的先前方法。醛形式的检测灵敏度差可能是由于加合物在与胺或蛋白质的反应过程中分析过程中加合物的损失。我们利用醛反应探针（ARP）产生稳定的ARP-M1G-脱氧核糖（ARP-M1G-dR）共轭物，以最大程度地减少加合物损失。通过使用固相萃取，该结合物增加了疏水性，从而增强了ARP-M1G-dR从未修饰的DNA核苷中的分离。此外，通过[ARP-M1G-dR + H] +（635）的选择性反应监测（SRM）测量ARP-M1G-dR-> [M1G + H] +（188）跃迁相对于SRM对M1G-dR的测量将检测灵敏度提高了近一个数量级。为了进行准确的测量，使用了分析标准品（AS）DNA和内标（IS）DNA。从已在含有（15NH4）2SO4的最低盐培养基中

  DOI：

  10.1021/tx049853l

文献信息

• Reaction of Malonaldehyde with Nucleic Acid. II. Formation of Fluorescent Pyrimido[1,2-<i>a</i>]purin-10(3<i>H</i>)-one Mononucleotide
  作者：Hiroshi Seto、Tomoyuki Takesue、Tadashi Ikemura

  DOI：10.1246/bcsj.58.3431

  日期：1985.12

  The reaction of malonaldehyde under acidic conditions (pH 4.5) with guanosine 5′-monophosphate resulted in the formation of fluorescent 3-(β-d-ribofuranosyl)pyrimido[1,2-a]purin-10(3H)-one 5′-phosphate (3a). This adduct was also isolated from malonaldehyde-reacted RNA. The amount of 3a in the modified RNA was estimated to be 0.4 per cent by weight. The fluorescence spectrum of 3a (Ex max. 360 nm, Em max. 500 nm) was similar to that of guanine- and guanosine-malonaldehyde adducts which have the same type base structure. On the other hand, another type of fluorophore (Ex max. 390 nm, Em max. 460 nm) was also formed in the reaction of malonaldehyde with a nucleic acid polymer. Thus, at least two different types of fluorophores are present in malonaldehyde-reacted nucleic acid.

  在酸性条件下（pH 4.5），丙二醛与鸟苷酸单磷酸的反应导致了荧光化合物3-(β-d-核糖呋喃糖基)pyrimido[1,2-a]purin-10(3H)-酮5′-磷酸（3a）的形成。这个加成物也从与丙二醛反应的RNA中分离出来。修饰RNA中3a的含量估计为0.4%的重量比。3a的荧光光谱（激发最大波长360 nm，发射最大波长500 nm）与鸟嘌呤和鸟苷-丙二醛加成物的光谱相似，这些加成物具有相同类型的碱基结构。另一方面，在丙二醛与核酸聚合物的反应中，还形成了另一种类型的荧光团（激发最大波长390 nm，发射最大波长460 nm）。因此，在与丙二醛反应的核酸中至少存在两种不同类型的荧光团。
• Addition of Deoxyribose to Guanine and Modified DNA Bases by <i>Lactobacillus helveticus</i> <i>trans</i>-<i>N</i>-Deoxyribosylase
  作者：Michael Müller、Linda K. Hutchinson、F. Peter Guengerich

  DOI：10.1021/tx9600661

  日期：1996.1.1

  trans-N-deoxyribosylase was evaluated as an alternative method for deoxyribosylation in the synthesis of deoxyribonucleosides containing potentially mutagenic adducts. A crude enzyme preparation was isolated from Lactobacillus helveticus and compared to Escherichia coli purine nucleoside phosphorylase. trans-N-deoxyribosylase was more regioselective than purine nucleoside phosphorylase in the deoxyribosylation of

  细菌反式-N-脱氧核糖基化酶的使用已被评估为合成含潜在诱变加合物的脱氧核糖核苷的一种替代方法。从瑞士乳杆菌中分离出粗制酶制剂，并将其与大肠杆菌嘌呤核苷磷酸化酶进行比较。如产物的NMR分析所示，与N7相比，在N9原子处的Gua的脱氧核糖基化中，反式N-脱氧核糖基化酶比嘌呤核苷磷酸化酶具有更高的区域选择性。5,6,7,9-四氢-7-乙酰氧基-9-氧代咪唑并[1,2-a]嘌呤可被反式-N-脱氧核糖基化酶有效地脱氧核糖基化，而根本不被嘌呤核苷磷酸化酶完全脱氧。反式-N-脱氧核糖基化酶的其他底物是N2-（2-氧乙基）Gua，嘧啶并[1,2-a]嘌呤-10（3H）-one，1，N2-ε-Gua，N2,3-ε-Gua ，3，N4-ε-Cyt，1，N6-ε-Ade，C8-甲基瓜瓜和C8-氨基瓜瓜，其中大多数以良好的收率得到了所需的异构体（与瓜9中的N9对应的氮键）。N7-烷基嘌呤和C8-（芳基氨基）取代的
• Synthesis of Oligonucleotides Containing the Alkali-Labile Pyrimidopurinone Adduct, M₁G
  作者：Nathalie C. Schnetz-Boutaud、Hui Mao、Michael P. Stone、Lawrence J. Marnett

  DOI：10.1021/tx990141i

  日期：2000.2.1

  An improved method for the synthesis of oligodeoxyribonucleotides containing the endogenous adduct, pyrimido[1,2-a]purin-10(3H)-one (M(1)G), is reported. The key features of the methodology include improved synthesis of the deoxynucleoside of M(1)G by transribosylation with deoxycytidine catalyzed by nucleoside 2'-deoxyribosyltransferase and the use of commercially available 4-tert-butylphenoxyacetyl

  报道了一种改进的合成方法，该方法合成了含有内源性加合物嘧啶并[1,2-a]嘌呤-10（3H）-一（M（1）G）的寡脱氧核糖核苷酸。该方法学的关键特征包括通过核苷2'-脱氧核糖基转移酶催化的脱氧胞苷的反式核糖基转移反应来改进M（1）G脱氧核苷的合成，以及对正常核苷酸使用市售的4-叔丁基苯氧基乙酰基保护基。通过用碳酸钾的甲醇溶液处理，可以轻松地脱保护并从固相支持物中除去含M（1）G的低聚物。进行NMR研究以确定寡核苷酸在不同pH下的稳定性。
• Reaction of malondialdehyde with guanine nucleosides: formation of adducts containing oxadiazabicyclononene residues in the base-pairing region
  作者：Lawrence J. Marnett、Ashis K. Basu、Shawn M. O'Hara、Paul E. Weller、A. F. M. Maqsudur. Rahman、John P. Oliver

  DOI：10.1021/ja00266a065

  日期：1986.3
• Temperature-Dependent Formation of a Conjugate between Tris(hydroxymethyl)aminomethane Buffer and the Malondialdehyde−DNA Adduct Pyrimidopurinone
  作者：Laura J. Niedernhofer、Michael Riley、Nathalie Schnetz-Boutaud、Geeganage Sanduwaran、Ajai K. Chaudhary、G. Ramachandra Reddy、Lawrence J. Marnett

  DOI：10.1021/tx960191c

  日期：1997.5.1

  The stability of the major adduct formed between the endogenous product malondialdehyde (MDA) and deoxyguanosine, a pyrimidopurinone termed M(1)G-dR, was tested under a variety of conditions required for nucleic acid manipulation. M(1)G-dR was found to be stable at neutral pH and 37 degrees C but to be unstable when stored at -20 degrees C in the presence of Tris buffers. A new product with a characteristic absorption band at 350 nm was identified by H-1-NMR as an enamino-imine comprised of one molecule of Tris, one molecule of MDA, and deoxyguanosine. The formation of the conjugate was observed on reaction of Tris with M(1)G-dR or its ring-opened derivative N-2-(3-oxo-1-propenyl)deoxyguanosine. The Tris-M(1)G-dR conjugate was unstable in aqueous solutions at room temperature, undergoing hydrolysis. However, the Tris conjugate of M(1)G base remained stable at room temperature in organic solvent. The isolation and properties of a conjugate between M(1)G-dR and Tris suggest that cross-links may form by reaction of MDA with DNA but they are likely to be unstable to hydrolysis.