7-[2-(benzo[d][1,3]dioxol-5-yl)-2-oxoethyl]-8-bromo-3,7-dihydro-3-methyl-1H-purine-2,6-dione | 1192215-73-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: 7-[2-(benzo[d][1,3]dioxol-5-yl)-2-oxoethyl]-8-bromo-3,7-dihydro-3-methyl-1H-purine-2,6-dione
• 英文别名: 7-[2-(1,3-Benzodioxol-5-yl)-2-oxoethyl]-8-bromo-3-methylpurine-2,6-dione
• CAS: 1192215-73-8
• 化学式: C₁₅H₁₁BrN₄O₅
• 分子量: 407.18
• InChiKey: XOMJVQZRYKJLLR-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.7
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  103
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-氨基-1-丁醇 、 7-[2-(benzo[d][1,3]dioxol-5-yl)-2-oxoethyl]-8-bromo-3,7-dihydro-3-methyl-1H-purine-2,6-dione 以 乙醇 为溶剂， 反应 12.0h， 以12%的产率得到7-(benzo[d][1,3]dioxol-5-yl)-8-(4-hydroxybutyl)-1-methyl-1H-imidazo[1,2-f]purine-2,4(3H,8H)-dione
  参考文献：
  名称：

  酪氨酸激酶促红细胞生成素产生人肝细胞癌受体B4（EphB4）的有效和选择性抑制剂的基于结构的优化。

  摘要：

  酪氨酸激酶EphB4由于在癌症相关血管生成中的公认作用而成为药物设计的诱人靶标。最近，通过基于高通量片段的对接进入激酶域的ATP结合位点，一系列可商购的黄嘌呤衍生物被鉴定为EphB4的微摩尔抑制剂。在这里，我们利用通过自动对接获得的结合模式来通过化学合成优化这些EphB4抑制剂。仅将两个重原子，甲基和羟基加到化合物4中，产生了一位数的纳摩尔抑制剂66，配体效率从0.26kcal /（mol /非氢原子摩尔）显着提高。化合物66对苏氨酸作为看门者残基（Abl，Lck和Src）的其他酪氨酸激酶具有很高的亲和力。另一方面，它对具有较大网守的激酶具有选择性。EphB4和化合物66的复合物的45 ns分子动力学（MD）模拟提供了通过基于片段的对接获得的结合模式的进一步验证。

  DOI：

  10.1021/jm9009444
• 作为产物：
  描述：

  1-(1,3-苯并氧)2-溴乙酮 、 8-溴-3-甲基-3,7-二氢-嘌呤-2,6-二酮 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.08h， 以61%的产率得到7-[2-(benzo[d][1,3]dioxol-5-yl)-2-oxoethyl]-8-bromo-3,7-dihydro-3-methyl-1H-purine-2,6-dione
  参考文献：
  名称：

  酪氨酸激酶促红细胞生成素产生人肝细胞癌受体B4（EphB4）的有效和选择性抑制剂的基于结构的优化。

  摘要：

  酪氨酸激酶EphB4由于在癌症相关血管生成中的公认作用而成为药物设计的诱人靶标。最近，通过基于高通量片段的对接进入激酶域的ATP结合位点，一系列可商购的黄嘌呤衍生物被鉴定为EphB4的微摩尔抑制剂。在这里，我们利用通过自动对接获得的结合模式来通过化学合成优化这些EphB4抑制剂。仅将两个重原子，甲基和羟基加到化合物4中，产生了一位数的纳摩尔抑制剂66，配体效率从0.26kcal /（mol /非氢原子摩尔）显着提高。化合物66对苏氨酸作为看门者残基（Abl，Lck和Src）的其他酪氨酸激酶具有很高的亲和力。另一方面，它对具有较大网守的激酶具有选择性。EphB4和化合物66的复合物的45 ns分子动力学（MD）模拟提供了通过基于片段的对接获得的结合模式的进一步验证。

  DOI：

  10.1021/jm9009444

文献信息

• Structure-Based Optimization of Potent and Selective Inhibitors of the Tyrosine Kinase Erythropoietin Producing Human Hepatocellular Carcinoma Receptor B4 (EphB4)
  作者：Karine Lafleur、Danzhi Huang、Ting Zhou、Amedeo Caflisch、Cristina Nevado

  DOI：10.1021/jm9009444

  日期：2009.10.22

  hydroxyl groups, to compound 4 has yielded the single-digit nanomolar inhibitor 66, with a remarkable improvement of the ligand efficiency from 0.26 to 0.37 kcal/(mol per non-hydrogen atom). Compound 66 shows very high affinity for a few other tyrosine kinases with threonine as gatekeeper residue (Abl, Lck, and Src). On the other hand, it is selective against kinases with a larger gatekeeper. A 45 ns molecular

  酪氨酸激酶EphB4由于在癌症相关血管生成中的公认作用而成为药物设计的诱人靶标。最近，通过基于高通量片段的对接进入激酶域的ATP结合位点，一系列可商购的黄嘌呤衍生物被鉴定为EphB4的微摩尔抑制剂。在这里，我们利用通过自动对接获得的结合模式来通过化学合成优化这些EphB4抑制剂。仅将两个重原子，甲基和羟基加到化合物4中，产生了一位数的纳摩尔抑制剂66，配体效率从0.26kcal /（mol /非氢原子摩尔）显着提高。化合物66对苏氨酸作为看门者残基（Abl，Lck和Src）的其他酪氨酸激酶具有很高的亲和力。另一方面，它对具有较大网守的激酶具有选择性。EphB4和化合物66的复合物的45 ns分子动力学（MD）模拟提供了通过基于片段的对接获得的结合模式的进一步验证。