N-[4-chloro-5-(4-chlorobenzyl)-6-methyl-5H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-2-yl]-2,2-dimethylpropanamide | 1005326-36-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡咯并嘧啶类
• 英文名称: N-[4-chloro-5-(4-chlorobenzyl)-6-methyl-5H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-2-yl]-2,2-dimethylpropanamide
• 英文别名: MMV688704；N-[4-chloro-5-[(4-chlorophenyl)methyl]-6-methylpyrrolo[3,2-d]pyrimidin-2-yl]-2,2-dimethylpropanamide
• CAS: 1005326-36-2
• 化学式: C₁₉H₂₀Cl₂N₄O
• 分子量: 391.3
• InChiKey: POUOXYLEQJMXSY-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.9
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  59.8
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-[4-chloro-5-(4-chlorobenzyl)-6-methyl-5H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-2-yl]-2,2-dimethylpropanamide 在 sodium hydroxide 作用下， 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 24.0h， 以74%的产率得到2-amino-5-[(4-chlorophenyl)methyl]-6-methyl-3H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-4-one
  参考文献：
  名称：

  作为双胸苷酸合酶和二氢叶酸还原酶抑制剂的经典和非经典 2-氨基-4-氧代-5-取代-6-甲基吡咯并[3,2-d]嘧啶的设计、合成和生物学评价。

  摘要：

  我们设计并合成了一种经典的抗叶酸剂 N-{4-[(2-amino-6-methyl-4-oxo-3,4-dihydro-5 H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-5-yl)methyl ]苯甲酰基}-l-谷氨酸 4 和 11 个非经典类似物 5-15 作为潜在的双胸苷酸合酶 (TS) 和二氢叶酸还原酶 (DHFR) 抑制剂。合成的关键中间体是 N-(4-chloro-6-methyl-5H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-2-yl)-2,2-二甲基丙酰胺, 29, 其中各种 5-benzyl连接了取代基。对于经典类似物 4，从 N-苄基化反应中获得的酯被脱保护并与 l-谷氨酸二乙酯偶联，然后进行皂化。化合物 4 是人 TS（IC 50 = 46 nM，比培美曲塞强约 206 倍）和 DHFR（IC 50 = 120 nM，比培美曲塞强约 55 倍）的有效双重抑制剂。

  DOI：

  10.1021/jm701052u
• 作为产物：
  描述：

  methyl (6-methyl-4-oxo-4,5-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-2-yl)carbamate 在 4-二甲氨基吡啶 、 sodium hydride 、 三乙胺 、 sodium hydroxide 、 三氯氧磷 作用下， 以 1,2-二氯乙烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 9.33h， 生成 N-[4-chloro-5-(4-chlorobenzyl)-6-methyl-5H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-2-yl]-2,2-dimethylpropanamide
  参考文献：
  名称：

  具有抗疟疾功效的恶性疟原虫 UCHL3 共价片段抑制剂的鉴定

  摘要：

  疟疾仍然是全球卫生的主要负担，2021 年造成 619,000 人死亡。疟疾的病原体是真核寄生虫疟原虫。目前疟疾的一线治疗方法——基于青蒿素的联合疗法 （ACTs） 的耐药性已经出现在亚洲、南美洲和最近的非洲，那里 >90% 的疟疾相关死亡发生在非洲。这需要鉴定和研究作为抗疟靶点的新型寄生虫蛋白和途径，包括泛素蛋白酶体系统的组成部分。在这里，我们研究了恶性疟原虫脱泛素酶泛素素 C 末端水解酶 L3 （PfUCHL3） 作为这样的靶标。我们对共价片段进行了高通量筛选，并鉴定了 7 个选择性抑制质细胞 UCHL3 的支架，但不抑制人 UCHL3 或密切相关的人 UCHL1。在评估了人类细胞的毒性后，我们确定了四个有前途的命中，并证明了它们对无性恶性疟原虫血液阶段和 P. berghei 子孢子阶段的疗效。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2023.129458

文献信息

• Design, Synthesis, and Biological Evaluation of Classical and Nonclassical 2-Amino-4-oxo-5-substituted-6-methylpyrrolo[3,2-<i>d</i>]pyrimidines as Dual Thymidylate Synthase and Dihydrofolate Reductase Inhibitors
  作者：Aleem Gangjee、Wei Li、Jie Yang、Roy L. Kisliuk

  DOI：10.1021/jm701052u

  日期：2008.1.1

  and synthesized a classical antifolate N-4-[(2-amino-6-methyl-4-oxo-3,4-dihydro-5 H-pyrrolo[3,2- d]pyrimidin-5-yl)methyl]benzoyl}- l-glutamic acid 4 and 11 nonclassical analogues 5- 15 as potential dual thymidylate synthase (TS) and dihydrofolate reductase (DHFR) inhibitors. The key intermediate in the synthesis was N-(4-chloro-6-methyl-5 H-pyrrolo[3,2- d]pyrimidin-2-yl)-2,2-dimethylpropanamide, 29,

  我们设计并合成了一种经典的抗叶酸剂 N-4-[(2-amino-6-methyl-4-oxo-3,4-dihydro-5 H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-5-yl)methyl ]苯甲酰基}-l-谷氨酸 4 和 11 个非经典类似物 5-15 作为潜在的双胸苷酸合酶 (TS) 和二氢叶酸还原酶 (DHFR) 抑制剂。合成的关键中间体是 N-(4-chloro-6-methyl-5H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-2-yl)-2,2-二甲基丙酰胺, 29, 其中各种 5-benzyl连接了取代基。对于经典类似物 4，从 N-苄基化反应中获得的酯被脱保护并与 l-谷氨酸二乙酯偶联，然后进行皂化。化合物 4 是人 TS（IC 50 = 46 nM，比培美曲塞强约 206 倍）和 DHFR（IC 50 = 120 nM，比培美曲塞强约 55 倍）的有效双重抑制剂。
• Identification of covalent fragment inhibitors for Plasmodium falciparum UCHL3 with anti-malarial efficacy
  作者：Ryan D. Imhoff、Melissa R. Rosenthal、Kutub Ashraf、Purnima Bhanot、Caroline L. Ng、Daniel P. Flaherty

  DOI：10.1016/j.bmcl.2023.129458

  日期：2023.10

  novel parasite proteins and pathways as antimalarial targets, including components of the ubiquitin proteasome system. Here, we investigate Plasmodium falciparum deubiquitinase ubiquitin C-terminal hydrolase L3 (PfUCHL3) as one such target. We carried out a high-throughput screen with covalent fragments and identified seven scaffolds that selectively inhibit the plasmodial UCHL3, but not human UCHL3

  疟疾仍然是全球卫生的主要负担，2021 年造成 619,000 人死亡。疟疾的病原体是真核寄生虫疟原虫。目前疟疾的一线治疗方法——基于青蒿素的联合疗法 （ACTs） 的耐药性已经出现在亚洲、南美洲和最近的非洲，那里 >90% 的疟疾相关死亡发生在非洲。这需要鉴定和研究作为抗疟靶点的新型寄生虫蛋白和途径，包括泛素蛋白酶体系统的组成部分。在这里，我们研究了恶性疟原虫脱泛素酶泛素素 C 末端水解酶 L3 （PfUCHL3） 作为这样的靶标。我们对共价片段进行了高通量筛选，并鉴定了 7 个选择性抑制质细胞 UCHL3 的支架，但不抑制人 UCHL3 或密切相关的人 UCHL1。在评估了人类细胞的毒性后，我们确定了四个有前途的命中，并证明了它们对无性恶性疟原虫血液阶段和 P. berghei 子孢子阶段的疗效。