2-氨基-6-氧代-己酸 | 1962-83-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: 2-氨基-6-氧代-己酸
• 中文别名: 6-氧-DL-己氨酸；阿離胺酸
• 英文名称: α-aminoadipate semialdehyde
• 英文别名: allysine；2-Azaniumyl-6-oxohexanoate
• CAS: 1962-83-0
• 化学式: C₆H₁₁NO₃
• 分子量: 145.158
• InChiKey: GFXYTQPNNXGICT-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  295.2±35.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.174±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.2
• 重原子数：
  10
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  80.4
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-氨基-6-氧代-己酸 在 wild type aldehyde dehydrogenase 7A₁ 、 nicotinamide adenine dinucleotide 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 反应 0.08h， 生成 α-aminoadipate
  参考文献：
  名称：

  Structural and biochemical consequences of pyridoxine‐dependent epilepsy mutations that target the aldehyde binding site of aldehyde dehydrogenase ALDH 7A1

  摘要：

  In humans, certain mutations in the gene encoding aldehyde dehydrogenase 7A1 are associated with pyridoxine‐dependent epilepsy (PDE). Understanding the impact of PDE‐causing mutations on the structure and activity of ALDH7A1 could allow for the prediction of symptom‐severity and aid the development of patient‐specific medical treatments. Herein, we investigate the biochemical and structural consequences of PDE missense mutations targeting residues in the aldehyde substrate binding site: N167S, P169S, A171V, G174V, and W175G. All but G174V could be purified for biochemical and X‐ray crystallographic analysis. W175G has a relatively mild kinetic defect, exhibiting a fivefold decrease in kcat with no change in Km. P169S and N167S have moderate defects, characterized by catalytic efficiencies of 20‐ and 100‐times lower than wild‐type, respectively. A171V has a profound functional defect, with catalytic efficiency 2000‐times lower than wild‐type. The crystal structures of the variants are the first for any PDE‐associated mutant of ALDH7A1. The structures show that missense mutations that decrease the steric bulk of the side chain tend to create a cavity in the active site. The protein responds by relaxing into the vacant space, and this structural perturbation appears to cause misalignment of the aldehyde substrate in W175G and N167S. The P169S structure is nearly identical to that of the wild‐type enzyme; however, analysis of B‐factors suggests the catalytic defect may result from altered protein dynamics. The A171V structure suggests that the potential for steric clash with Val171 prevents Glu121 from ion pairing with the amino group of the aldehyde substrate.EnzymesAldehyde dehydrogenase 7A1 (EC1.2.1.31).DatabasesCoordinates have been deposited in the Protein Data Bank under the following accession codes: 6O4B, 6O4C, 6O4D, 6O4E, 6O4F, 6O4G, 6O4H.

  DOI：

  10.1111/febs.14997
• 作为产物：
  描述：

  α-aminoadipate semialdehyde ethyleneacetal 在 盐酸 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 2-氨基-6-氧代-己酸
  参考文献：
  名称：

  Role and structural characterization of plant aldehyde dehydrogenases from family 2 and family 7

  摘要：

  醛脱氢酶（ALDHs）负责生物醛中间产物的氧化以及脂质过氧化过程中产生的醛的细胞解毒。迄今为止，植物中已描述了 13 个 ALDH 家族。在本研究中，我们通过分析玉米和豌豆的 ALDH7（ZmALDH7 和 PsALDH7）以及四种玉米细胞质 ALDH（cALDH）2 异构体 RF2C、RF2D、RF2E 和 RF2F，对植物 ALDH2 和 ALDH7 家族进行了详细的生化鉴定[发现的第一个玉米 ALDH2 是一种生育力恢复剂（RF2A）]。我们报告了 ZmALDH7、RF2C 和 RF2F 的高分辨率晶体结构。ZmALDH7 的结构表明，ALDH7 家族中的三个保守残基 Glu120、Arg300 和 Thr302 位于底物结合位点，并且是该家族所特有的。我们的动力学分析表明，α-氨基己二酸半醛是赖氨酸分解代谢的中间产物，是植物 ALDH7 的首选底物。相比之下，芳香醛（包括苯甲醛、茴香醛、肉桂醛、针叶醛和山奈醛）是 cALDH2 的最佳底物。与这些结果相一致，RF2C 和 RF2F 的晶体结构显示，它们的底物结合位点相似，都是由一个主要由苯丙氨酸残基和几个非极性残基组成的芳香族簇构成。基因表达研究表明，RF2C 基因在所有器官中都有很强的表达，似乎是必不可少的，这表明该酶的关键作用肯定与以苯丙醛途径中的醛为底物形成细胞壁有关。最后，植物的 ALDH7 可能对渗透保护有重大贡献，因为它能氧化多种氨基醛，产生被称为渗透溶质的产物。

  DOI：

  10.1042/bj20150009

文献信息

• [EN] LOX INHIBITORS<br/>[FR] INHIBITEURS DE LOX
  申请人：THE INSTITUTE OF CANCER RES ROYAL CANCER HOSPITAL

  公开号：WO2020099886A1

  公开（公告）日：2020-05-22

  The disclosure relates to compounds of Formula I, or pharmaceutically acceptable salts thereof, Formula (I) as defined herein. Compounds according to Formula I are pharmacologically effective as lysyl oxidase (LOX) inhibitors and are believed to be useful in the treatment of, for instance, cancer.

  该披露涉及到公式I的化合物，或其药用盐，公式(I)如本文所定义。根据公式I的化合物在药理学上作为赖氨酸氧化酶（LOX）抑制剂具有药效，并被认为在癌症治疗中是有用的。
• [EN] METHYLAMINE DERIVATIVES AS LYSYSL OXIDASE INHIBITORS FOR THE TREATMENT OF CANCER<br/>[FR] DÉRIVÉS DE LA MÉTHYLAMINE COMME INHIBITEURS DE LA LYSYL OXIDASE POUR LE TRAITEMENT DU CANCER
  申请人：THE INST OF CANCER RESEARCH: ROYAL CANCER HOSPITAL

  公开号：WO2017141049A1

  公开（公告）日：2017-08-24

  Provided are compounds of the Formula (I), or a pharmaceutically acceptable salt thereof, wherein W, X, Y, Z, x, R1, R2, R3, x and n are defined in the specification. The compounds are inhibitors of lysyl oxidase (LOX) and lysyl oxidase-like (LOXL) family members (LOXL1, LOXL2, LOXL3, LOXL4) and are useful in therapy, particularly in the treatment of cancer. Also disclosed are LOX inhibitors for use in the treatment of a cancer associated with EGFR and biomarkers that predict responsiveness to a LOX inhibitor.

  提供的是Formula (I)的化合物，或其药用可接受的盐，其中W、X、Y、Z、x、R1、R2、R3、x和n在规范中有定义。这些化合物是赖氨酸氧化酶（LOX）和赖氨酸氧化酶样（LOXL）家族成员（LOXL1、LOXL2、LOXL3、LOXL4）的抑制剂，并且在治疗中很有用，特别是在癌症治疗中。还披露了用于治疗与EGFR相关的癌症的LOX抑制剂，以及预测对LOX抑制剂响应性的生物标志物。
• [EN] MOLECULAR IMAGING PROBES<br/>[FR] SONDES D'IMAGERIE MOLÉCULAIRE
  申请人：GEN HOSPITAL CORP

  公开号：WO2015085005A1

  公开（公告）日：2015-06-11

  This disclosure relates to compounds of formula (I) shown below: [formula (I)], or a pharmaceutically acceptable salt thereof. These compounds can be used as imaging probes, e.g., for diagnosis of fibrosis or fibrogenesis.

  这份披露涉及到如下所示的化合物(I)的公式：[公式(I)]，或其药用可接受的盐。这些化合物可用作成像探针，例如，用于纤维化或纤维生成的诊断。
• Identification of Polyphenol-Specific Innate Epitopes That Originated from a Resveratrol Analogue
  作者：Mai Furuhashi、Yukinori Hatasa、Sae Kawamura、Takahiro Shibata、Mitsugu Akagawa、Koji Uchida

  DOI：10.1021/acs.biochem.7b00409

  日期：2017.9.5

  oxidation of a lysine residue by piceatannol followed by a Schiff base reaction with the ε-amino group of an unoxidized lysine residue. The results of this study established a novel mechanism for the formation of innate epitopes by small dietary molecules and support the notion that many of the beneficial effects of polyphenols could be attributed, at least in part, to their lysyl oxidase-like activity

  多酚由于其独特的化学和生物学特性而在疾病预防中受到了广泛的关注。但是，尚不清楚其有益作用的潜在分子机制。现在，我们已经确定了多酚是天然IgM中检测到的先天表位的来源，并通过蛋白质的聚合作用在多酚形成先天表位的过程中建立了独特的功能增强机制。在生理条件下与牛血清白蛋白（BSA）孵育后，几种多酚将蛋白质转化为IgM Abs识别的先天表位。有趣的是，piceatannol（一种红酒多酚的天然羟基化类似物白藜芦醇）介导了BSA的修饰，其聚合形式被IgM特异性识别。皮卡季诺醇介导的蛋白质聚合与赖氨酸衍生的交联脱氢赖氨酸正亮氨酸的形成有关。此外，检测到氧化脱氨基产物α-氨基己二酸半醛是在皮卡季诺醇处理的BSA中交联的潜在前体，这表明蛋白质的聚合可能是由皮卡季诺醇对赖氨酸残基的氧化介导的。然后与未氧化赖氨酸残基的ε-氨基进行席夫碱反应。这项研究的结果建立了一种新的机制，可以通过饮食中的小分子形成先天表位
• [EN] LYSYL OXIDASE INHIBITORS<br/>[FR] INHIBITEURS DE LA LYSYLE OXYDASE
  申请人：THE INSTITUTE OF CANCER RES ROYAL CANCER HOSPITAL

  公开号：WO2019073251A1

  公开（公告）日：2019-04-18

  This invention relates to compounds useful as lysyl oxidase (LOX) and lysyl oxidase-like (LOXL) family member (LOXL1, LOXL2, LOXL3, LOXL4) inhibitors. In addition there are contemplated pharmaceutical compositions comprising the compounds and the use of the compounds in the treatment of conditions mediated by LOX and LOXL, for example cancer. In particular a LOX inhibitor such as the present compounds may be for use in the treatment of a cancer associated with EGFR. The present invention also contemplates the identification of biomarkers that predict responsiveness to a LOX inhibitor.

  这项发明涉及作为赖氨酸氧化酶（LOX）和赖氨酸氧化酶类（LOXL）家族成员（LOXL1、LOXL2、LOXL3、LOXL4）抑制剂有用的化合物。此外，还考虑了包括这些化合物的药物组合物以及利用这些化合物治疗由LOX和LOXL介导的疾病，例如癌症。特别是像目前的这些化合物这样的LOX抑制剂可能用于治疗与EGFR相关的癌症。本发明还考虑了预测对LOX抑制剂响应性的生物标志物的鉴定。