N²-propyl-2′-deoxy-5-methylisocytidine | 1439607-69-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: N²-propyl-2′-deoxy-5-methylisocytidine
• 英文别名: 1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methyl-2-(propylamino)pyrimidin-4-one
• CAS: 1439607-69-8
• 化学式: C₁₃H₂₁N₃O₄
• 分子量: 283.327
• InChiKey: XSROEQTVSBMNLX-HBNTYKKESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.69
• 拓扑面积：
  94.4
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N²-propyl-2′-deoxy-5-methylisocytidine 在 吡啶 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 3′-O-[2-cyanoethoxy(diisopropylamino)phosphino]-5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-N²-propyl-2′-deoxy-5-methylisocytidine
  参考文献：
  名称：

  N-（Guanidinoethyl）-2'-deoxy-5-methylisocytidine显示选择性识别CG中断位点以形成反平行三链体†

  摘要：

  用于形成含嘧啶-嘌呤倒位位点的三链体DNA的新型核苷类似物的开发一直是一个充满挑战的领域。在本文中，我们描述了非天然核苷类似物N-取代的2'-脱氧-5-甲基异胞苷衍生物的设计与合成，以及它们对三链体形成的评估。已经显示出N-（胍基乙基）-2'-脱氧-5-甲基异胞苷显示出对CG中断位点的选择性识别并增强了反平行三链体的形成。

  DOI：

  10.1039/c3ob40472b
• 作为产物：
  描述：

  正丙胺 、 (1R,10R,11S)-11-羟基-4-甲基-8,13-二氧杂-2,6-二氮杂三环[8.2.1.02,7]十三-3,6-二烯-5-酮 反应 15.0h， 以97%的产率得到N²-propyl-2′-deoxy-5-methylisocytidine
  参考文献：
  名称：

  N-（Guanidinoethyl）-2'-deoxy-5-methylisocytidine显示选择性识别CG中断位点以形成反平行三链体†

  摘要：

  用于形成含嘧啶-嘌呤倒位位点的三链体DNA的新型核苷类似物的开发一直是一个充满挑战的领域。在本文中，我们描述了非天然核苷类似物N-取代的2'-脱氧-5-甲基异胞苷衍生物的设计与合成，以及它们对三链体形成的评估。已经显示出N-（胍基乙基）-2'-脱氧-5-甲基异胞苷显示出对CG中断位点的选择性识别并增强了反平行三链体的形成。

  DOI：

  10.1039/c3ob40472b

文献信息

• N-(Guanidinoethyl)-2′-deoxy-5-methylisocytidine exhibits selective recognition of a CG interrupting site for the formation of anti-parallel triplexes
  作者：Hidenori Okamura、Yosuke Taniguchi、Shigeki Sasaki

  DOI：10.1039/c3ob40472b

  日期：——

  novel nucleoside analogues for the formation of triplex DNA containing pyrimidine–purine inversion sites has been a challenging field. In this paper, we describe the design and synthesis of non-natural nucleoside analogues, N-substituted-2′-deoxy-5-methylisocytidine derivatives, and their evaluation for triplex formation. It has been shown that N-(guanidinoethyl)-2′-deoxy-5-methylisocytidine exhibits

  用于形成含嘧啶-嘌呤倒位位点的三链体DNA的新型核苷类似物的开发一直是一个充满挑战的领域。在本文中，我们描述了非天然核苷类似物N-取代的2'-脱氧-5-甲基异胞苷衍生物的设计与合成，以及它们对三链体形成的评估。已经显示出N-（胍基乙基）-2'-脱氧-5-甲基异胞苷显示出对CG中断位点的选择性识别并增强了反平行三链体的形成。