3′-O-[2-cyanoethoxy(diisopropylamino)phosphino]-5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-N²-propyl-2′-deoxy-5-methylisocytidine | 1439607-72-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 3′-O-[2-cyanoethoxy(diisopropylamino)phosphino]-5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-N²-propyl-2′-deoxy-5-methylisocytidine
• 英文别名: 3-[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-[5-methyl-4-oxo-2-(propylamino)pyrimidin-1-yl]oxolan-3-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile
• CAS: 1439607-72-3；1439607-76-7
• 化学式: C₄₃H₅₆N₅O₇P
• 分子量: 785.921
• InChiKey: AJPASYWEYXPREG-GFZSHSHLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.6
• 重原子数：
  56
• 可旋转键数：
  20
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  127
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (1R,10R,11S)-11-羟基-4-甲基-8,13-二氧杂-2,6-二氮杂三环[8.2.1.02,7]十三-3,6-二烯-5-酮 在 吡啶 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 19.0h， 生成 3′-O-[2-cyanoethoxy(diisopropylamino)phosphino]-5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-N²-propyl-2′-deoxy-5-methylisocytidine
  参考文献：
  名称：

  N-（Guanidinoethyl）-2'-deoxy-5-methylisocytidine显示选择性识别CG中断位点以形成反平行三链体†

  摘要：

  用于形成含嘧啶-嘌呤倒位位点的三链体DNA的新型核苷类似物的开发一直是一个充满挑战的领域。在本文中，我们描述了非天然核苷类似物N-取代的2'-脱氧-5-甲基异胞苷衍生物的设计与合成，以及它们对三链体形成的评估。已经显示出N-（胍基乙基）-2'-脱氧-5-甲基异胞苷显示出对CG中断位点的选择性识别并增强了反平行三链体的形成。

  DOI：

  10.1039/c3ob40472b

文献信息

• N-(Guanidinoethyl)-2′-deoxy-5-methylisocytidine exhibits selective recognition of a CG interrupting site for the formation of anti-parallel triplexes
  作者：Hidenori Okamura、Yosuke Taniguchi、Shigeki Sasaki

  DOI：10.1039/c3ob40472b

  日期：——

  novel nucleoside analogues for the formation of triplex DNA containing pyrimidine–purine inversion sites has been a challenging field. In this paper, we describe the design and synthesis of non-natural nucleoside analogues, N-substituted-2′-deoxy-5-methylisocytidine derivatives, and their evaluation for triplex formation. It has been shown that N-(guanidinoethyl)-2′-deoxy-5-methylisocytidine exhibits

  用于形成含嘧啶-嘌呤倒位位点的三链体DNA的新型核苷类似物的开发一直是一个充满挑战的领域。在本文中，我们描述了非天然核苷类似物N-取代的2'-脱氧-5-甲基异胞苷衍生物的设计与合成，以及它们对三链体形成的评估。已经显示出N-（胍基乙基）-2'-脱氧-5-甲基异胞苷显示出对CG中断位点的选择性识别并增强了反平行三链体的形成。