(S)-benzyl (5-amino-5-(5-(naphthalen-2-yl)-1H-imidazol-2-yl)pentyl)carbamate | 936367-36-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 萘
• 英文名称: (S)-benzyl (5-amino-5-(5-(naphthalen-2-yl)-1H-imidazol-2-yl)pentyl)carbamate
• 英文别名: benzyl N-[(5S)-5-amino-5-(5-naphthalen-2-yl-1H-imidazol-2-yl)pentyl]carbamate
• CAS: 936367-36-1
• 化学式: C₂₆H₂₈N₄O₂
• 分子量: 428.534
• InChiKey: SASBUBYQAKUKEH-QHCPKHFHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.2
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.23
• 拓扑面积：
  93
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S)-benzyl (5-amino-5-(5-(naphthalen-2-yl)-1H-imidazol-2-yl)pentyl)carbamate 在 氢溴酸 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 二氯甲烷 、 溶剂黄146 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 48.0h， 生成 (S)-N-(5-(2-fluoro-6-methoxybenzamido)-1-(5-(naphthalen-2-yl)-1H-imidazol-2-yl)pentyl)thiazole-5-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  发现基于 2-取代苯甲酰胺锌结合基团的高选择性和强效 HDAC3 抑制剂

  摘要：

  组蛋白去乙酰化酶抑制剂 (HDACis) 的选择性受锌结合基团的影响很大。为了寻找新的锌结合基团，我们应用平行药物化学 (PMC) 策略快速合成取代的苯甲酰胺文库。我们发现了一系列含有 2-取代苯甲酰胺作为锌结合基团的系列，它们提供了高度选择性和有效的 HDAC3 抑制剂，例如具有 2-甲硫基苯甲酰胺的化合物16。化合物16抑制 HDAC3 的 IC 50为 30 nM，并且比所有其他 HDAC 同种型具有 >300 倍的前所未有的选择性。有趣的是，2-甲硫的微妙的变化，以在一个2-羟基苯甲酰胺20保留 HDAC3 效力，但失去了对 HDAC 1 和 2 的所有选择性。这种选择性的显着差异是由 HDACis 16和20与 HDAC2 结合的 X 射线晶体结构合理化的，揭示了对催化锌离子的不同结合模式。这一系列 HDAC3 选择性抑制剂用作工具化合物，用于研究在 Jurkat 2C4 细胞模型中为

  DOI：

  10.1021/acsmedchemlett.0c00462
• 作为产物：
  描述：

  (S)-2-(naphthalen-2-yl)-2-oxoethyl 6-(((benzyloxy)carbonyl)amino)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)hexanoate 在 ammonium acetate 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 甲苯 为溶剂， 反应 20.0h， 生成 (S)-benzyl (5-amino-5-(5-(naphthalen-2-yl)-1H-imidazol-2-yl)pentyl)carbamate
  参考文献：
  名称：

  发现基于 2-取代苯甲酰胺锌结合基团的高选择性和强效 HDAC3 抑制剂

  摘要：

  组蛋白去乙酰化酶抑制剂 (HDACis) 的选择性受锌结合基团的影响很大。为了寻找新的锌结合基团，我们应用平行药物化学 (PMC) 策略快速合成取代的苯甲酰胺文库。我们发现了一系列含有 2-取代苯甲酰胺作为锌结合基团的系列，它们提供了高度选择性和有效的 HDAC3 抑制剂，例如具有 2-甲硫基苯甲酰胺的化合物16。化合物16抑制 HDAC3 的 IC 50为 30 nM，并且比所有其他 HDAC 同种型具有 >300 倍的前所未有的选择性。有趣的是，2-甲硫的微妙的变化，以在一个2-羟基苯甲酰胺20保留 HDAC3 效力，但失去了对 HDAC 1 和 2 的所有选择性。这种选择性的显着差异是由 HDACis 16和20与 HDAC2 结合的 X 射线晶体结构合理化的，揭示了对催化锌离子的不同结合模式。这一系列 HDAC3 选择性抑制剂用作工具化合物，用于研究在 Jurkat 2C4 细胞模型中为

  DOI：

  10.1021/acsmedchemlett.0c00462

文献信息

• [EN] INHIBITORS OF HISTONE DEACETYLASE-3 USEFUL FOR THE TREATMENT OF CANCER, INFLAMMATION, NEURODEGENERATION DISEASES AND DIABETES<br/>[FR] INHIBITEURS D'HISTONE DÉSACÉTYLASE -3 UTILES POUR LE TRAITEMENT DU CANCER, DE L'INFLAMMATION, DE MALADIES NEURODÉGÉNÉRATIVES ET DU DIABÈTE
  申请人：MERCK SHARP & DOHME

  公开号：WO2020205688A1

  公开（公告）日：2020-10-08

  The present invention relates to Compounds of Formula I: and pharmaceutically acceptable salts or prodrug thereof, wherein R1, R2, R3, A and B are as defined herein. The present invention also relates to compositions comprising at least one compound of Formula I, and methods of using the compounds of Formula I for treating or preventing cancer, inflammation, neurodegeneration disease and/or diabetes in a subject.

  本发明涉及式I的化合物：以及其药学上可接受的盐或前药，其中R1、R2、R3、A和B如本文所定义。本发明还涉及包含至少一种式I化合物的组合物，以及使用式I化合物治疗或预防癌症、炎症、神经退行性疾病和/或糖尿病的方法。
• Discovery of Highly Selective and Potent HDAC3 Inhibitors Based on a 2-Substituted Benzamide Zinc Binding Group
  作者：Jian Liu、Younong Yu、Joseph Kelly、Deyou Sha、Abdul-Basit Alhassan、Wensheng Yu、Milana M. Maletic、Joseph L. Duffy、Daniel J. Klein、M. Katharine Holloway、Steve Carroll、Bonnie J. Howell、Richard J. O. Barnard、Scott Wolkenberg、Joseph A. Kozlowski

  DOI：10.1021/acsmedchemlett.0c00462

  日期：2020.12.10

  selectivity of histone deacetylase inhibitors (HDACis) is greatly impacted by the zinc binding groups. In an effort to search for novel zinc binding groups, we applied a parallel medicinal chemistry (PMC) strategy to quickly synthesize substituted benzamide libraries. We discovered a series containing 2-substituted benzamides as the zinc binding group which afforded highly selective and potent HDAC3 inhibitors

  组蛋白去乙酰化酶抑制剂 (HDACis) 的选择性受锌结合基团的影响很大。为了寻找新的锌结合基团，我们应用平行药物化学 (PMC) 策略快速合成取代的苯甲酰胺文库。我们发现了一系列含有 2-取代苯甲酰胺作为锌结合基团的系列，它们提供了高度选择性和有效的 HDAC3 抑制剂，例如具有 2-甲硫基苯甲酰胺的化合物16。化合物16抑制 HDAC3 的 IC 50为 30 nM，并且比所有其他 HDAC 同种型具有 >300 倍的前所未有的选择性。有趣的是，2-甲硫的微妙的变化，以在一个2-羟基苯甲酰胺20保留 HDAC3 效力，但失去了对 HDAC 1 和 2 的所有选择性。这种选择性的显着差异是由 HDACis 16和20与 HDAC2 结合的 X 射线晶体结构合理化的，揭示了对催化锌离子的不同结合模式。这一系列 HDAC3 选择性抑制剂用作工具化合物，用于研究在 Jurkat 2C4 细胞模型中为