5'-thio-5'-deoxyuridine | 34308-24-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 5'-脱氧核糖核苷
• 英文名称: 5'-thio-5'-deoxyuridine
• 英文别名: 5'-thiouridine；5'-thio-uridine；thiouridine；5'-Thio-uridin；1-[(2R,3R,4S,5S)-3,4-dihydroxy-5-(sulfanylmethyl)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 34308-24-2
• 化学式: C₉H₁₂N₂O₅S
• 分子量: 260.271
• InChiKey: UQGKBMQZXQIGSG-XVFCMESISA-N

物化性质

• 熔点：
  173 °C(Solv: ethanol (64-17-5))
• 密度：
  1.603±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.6
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  100
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-deoxy-2'-methylidene-5-methyluridine 、 5'-thio-5'-deoxyuridine 在 安息香双甲醚 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 以75%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  C-2'-支化阿拉伯核苷的合成及抗癌和抗病毒活性。

  摘要：

  d-阿拉伯呋喃糖基-嘧啶和-嘌呤核苷类似物在 C2' 位置含有烷硫基-、乙酰硫基-或 1-硫代糖取代基，由相应的 3',5'-O-甲硅烷缩醛保护的核苷 2'-外亚甲基通过光引发制备，自由基介导的氢硫醇化反应。虽然氢硫醇化的立体化学结果取决于硫醇和呋喃糖苷配基的结构，但通常可以获得高 d-阿拉伯糖选择性。通过 MTT 法研究了阿拉伯糖核苷对肿瘤性 SCC（小鼠鳞状细胞）和永生化对照 HaCaT（人角质形成细胞）细胞系的细胞毒作用。三个含有 C2' 的嘧啶核苷 -丁基硫烷基甲基或-乙酰硫甲基基团在低微摩尔浓度下显示出有希望的细胞毒性，并且对肿瘤细胞具有良好的选择性。使用甲基 β-d-阿拉伯呋喃糖苷参考化合物的 SAR 分析表明，甲硅烷基保护基团、核碱基和相应的 C2' 取代基对细胞生长抑制活性至关重要。通过近红外活细胞成像研究了三种活性最强的核苷类似物对细胞毒性参数的影响，如细胞大小、分裂时间和细胞生成时间，结果表明

  DOI：

  10.3390/ijms232012566
• 作为产物：
  描述：

  5'-chloro-5'-deoxyuridine 在 吡咯 、 三苯基膦 、 四甲基胍 作用下， 以 溶剂黄146 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 5'-thio-5'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  9-(4-Methoxyphenyl)xanthen-9-thiol: A useful reagent for the preparation of thiols

  摘要：

  Treatment of 5' -chloro-5' -deoxynucleosides (5) with the conjugate base of 9-(4-methoxyphenyl)xanthen-9-thiol (3b), followed by acid-promoted removal of the 5'-s-[9-(4-methoxyphenyl)xanthen-9-yl] group in the presence of pyrrole gives the corresponding 5'-deoxy-5'-mercaptonucleosides (7) in good yields.

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)88523-8

文献信息

• [EN] NUCLEOTIDE AND NUCLEOSIDE COMPOSITIONS AND USES RELATED THERETO<br/>[FR] COMPOSITIONS À BASE DE NUCLÉOTIDE ET DE NUCLÉOSIDE ET UTILISATIONS CORRESPONDANTES
  申请人：UNIV EMORY

  公开号：WO2015038596A1

  公开（公告）日：2015-03-19

  This disclosure relates to nucleotide and nucleoside therapeutic compositions and uses in treating infectious diseases, viral infections, and cancer, where the base of the nucleotide or nucleoside contains at least one thiol, thione or thioether.

  这份披露涉及到核苷酸和核苷类治疗组合物，用于治疗传染病、病毒感染和癌症，在这些组合物中，核苷酸或核苷的碱基至少含有一个硫醇、硫酮或硫醚。
• [EN] DELIVERY OF TARGET SPECIFIC NUCLEASES<br/>[FR] ADMINISTRATION DE NUCLÉASES SPÉCIFIQUES À UNE CIBLE
  申请人：SANGAMO THERAPEUTICS INC

  公开号：WO2018107026A1

  公开（公告）日：2018-06-14

  Described herein are lipid nanoparticles comprising cationic lipids and other lipids and also comprising engineered nucleases facilitate transfer of nucleic acids to cells.

  本发明描述了包含阳离子脂质和其他脂质的脂质纳米颗粒，以及包含工程核酸酶以促进核酸向细胞的转移。
• [EN] NUCLEOTIDE AND NUCLEOSIDE THERAPEUTICS COMPOSITIONS AND USES RELATED THERETO<br/>[FR] COMPOSITIONS THÉRAPEUTIQUES RENFERMANT DES NUCLÉOTIDES ET DES NUCLÉOSIDES ET UTILISATIONS ASSOCIÉES
  申请人：UNIV EMORY

  公开号：WO2016145142A1

  公开（公告）日：2016-09-15

  This disclosure relates to nucleotide and nucleoside therapeutic compositions and uses in treating infectious diseases, viral infections, and cancer, where the base of the nucleotide or nucleoside contains at least one thiol, thione or thioether.

  这份披露涉及到核苷酸和核苷类治疗组合物，用于治疗传染病、病毒感染和癌症，其中核苷酸或核苷的碱基至少含有一个硫醇、硫醌或硫醚。
• 1',4'-THIO NUCLEOSIDES FOR THE TREATMENT OF HCV
  申请人：Idenix Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US20140364446A1

  公开（公告）日：2014-12-11

  Provided herein are compounds, compositions and methods for the treatment of Flaviviridae infections, including HCV infections. In certain embodiments, compounds and compositions of nucleoside derivatives are disclosed, which can be administered either alone or in combination with other anti-viral agents. In certain embodiments, the compounds are 1′,4′-thio nucleoside compounds which display remarkable efficacy and bioavailability for the treatment of, for example, HCV infection in a human. In certain embodiments, the compounds are of Formula 3001: or a pharmaceutically acceptable salt, solvate, stereoisomeric form, tautomeric form, or polymorphic form thereof; wherein Base, R A , R B , W, X, Y, and Z are as described herein.

  本文提供了用于治疗黄病毒科感染，包括HCV感染的化合物、组合物和方法。在某些实施例中，披露了核苷衍生物的化合物和组合物，可以单独或与其他抗病毒药物联合给药。在某些实施例中，这些化合物是1′,4′-硫代核苷化合物，对于例如人体中的HCV感染具有显著的疗效和生物利用度。在某些实施例中，这些化合物的化学式如下： 或其药用可接受的盐、溶剂化合物、立体异构体、互变异构体或多形式；其中Base、R A 、R B 、W、X、Y和Z如本文所述。
• Synthesis and Properties of Diuridine Phosphate Analogues Containing Thio and Amino Modifications
  作者：James B. Thomson、Bhisma K. Patel、Victor Jiménez、Klaus Eckart、Fritz Eckstein

  DOI：10.1021/jo960795l

  日期：1996.1.1

  pH 9, indicating that attack on the phosphorus by the 2'-oxo anion is rate-limiting in the hydrolysis mechanism. In contrast, the rate of uridylyl (3'-5') 5'-amino-5'-deoxyuridine (UpnU) hydrolysis fell from a value of 1802 x 10(-)(6) s(-)(1) at pH 5 to 140 x 10(-)(6) s(-)(1) at pH 7.5, where it remained constant up to pH 11.5, thus indicating an acid-catalyzed reaction. The analogue 2'-amino-2'-deoxyuridylyl

  为了研究为什么用2'-氨基取代2'-羟基会阻止水解，合成了磷酸二尿苷（UpU）的几种类似物。设计这些类似物以研究2'-取代基和5'-离去基团对水解速率的影响。所有类似物都比UpU对酸碱催化的水解更加不稳定。在6到9的pH范围内，尿嘧啶（3'-5'）5'-硫代5'-脱氧尿苷（UpsU）的水解速率以对数线性方式从5 x 10的值上升。 （-）（6）s（-）（1）在pH 6到3200 x 10（-）（6）s（-）（1）在pH 9时，表明2'-氧代阴离子对磷的攻击在水解机理中是限速的。相反，尿酸（3'-5'）5'-氨基-5'的比率 -脱氧尿苷（UpnU）水解从pH 5的1802 x 10（-）（6）s（-）（1）降至pH 7.5的140 x 10（-）（6）s（-）（1） ，在高达11.5的pH值下保持恒定，因此表明是酸催化的反应。与amUpT的水解稳定性相反，类似物2'-氨基-2'-脱氧尿苷（3