Structure and further fragmentation of significant [a<sub>3</sub> + Na − H]<sup>+</sup>ions from sodium-cationized peptides
作者:Huixin Wang、Bing Wang、Zhonglin Wei、Hao Zhang、Xinhua Guo
DOI:10.1002/jms.3520
日期:2015.1
understanding of gas-phase fragmentation chemistry of peptides is important for accurate protein identification. Additional product ions obtained by sodiated peptides can provide useful sequence information supplementary to protonated peptides and improve protein identification. In this work, we first demonstrate that the sodiated a3 ions are abundant in the tandem mass spectra of sodium-cationized peptides although
对肽的气相裂解化学的深入了解对于准确的蛋白质鉴定非常重要。通过磺化肽获得的其他产物离子可以提供对质子化肽有补充作用的有用序列信息,并改善蛋白质鉴定。在这项工作中,我们首先证明在钠阳离子化肽的串联质谱图中,钠化的a3离子含量很高,尽管在质子化肽中很少见到a3离子的观察结果。通过使用模型四肽GGAG,将量子化学计算与串联质谱相结合来研究此现象。我们的结果表明,最稳定的[a3 + Na-H](+)离子以双齿线性结构存在,其中钠阳离子与两个主链羰基氧原子配位。由于结构不灵活,[a3 + Na-H](+)离子的进一步断裂需要克服几个相对较高的能垒,以形成具有二酮哌嗪结构的[b2 + Na-H](+)离子。结果,在较高的碰撞能量下检测到[b2 + Na-H](+)离子的丰度低。此外,我们的计算数据还表明,不太可能从[a3 + Na-H](+)离子生成[b2 + Na-H](+)的常见恶唑酮途径。本工作