KRpTIRR | 261159-34-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: KRpTIRR
• 英文别名: K-R-pT-I-R-R；(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S,3S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2,6-diaminohexanoyl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)pentanoyl]amino]-3-phosphonooxybutanoyl]amino]-3-methylpentanoyl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)pentanoyl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)pentanoic acid
• CAS: 261159-34-6
• 化学式: C₃₄H₆₉N₁₆O₁₁P
• 分子量: 908.996
• InChiKey: VMCXVRCMNDCTEY-KFGZADJESA-N

物化性质

• 密度：
  1.55±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -10.8
• 重原子数：
  62
• 可旋转键数：
  32
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.74
• 拓扑面积：
  495
• 氢给体数：
  16
• 氢受体数：
  16

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  KRpTIRR 、 4-isothiocyanatobenzenesulfonic acid 在 碳酸氢钠 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 0.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Simplifying Fragmentation Patterns of Multiply Charged Peptides by N-Terminal Derivatization and Electron Transfer Collision Activated Dissociation

  摘要：

  在对多电荷肽（包括主要在 LC-ESI-MS 实验中形成的多电荷肽）进行从头测序时，N 端肽衍生策略与串联质谱法结合使用以产生简化的碎片模式，但效果有限。多电荷肽在碰撞活化过程中会发生大量质子移动，从而形成 N 端和 C 端产物离子，而不是从头测序算法所喜欢的一系列 C 端离子。为了解决这个问题，多电荷 N 端衍生肽与荧蒽阴离子发生电子转移反应，产生单电荷自由基物种。在随后的 "软 "碰撞诱导解离（CID）过程中，几乎只形成了高含量的z型离子，从而产生了适合全新测序方法的简化碎片模式。此外，衍生化的多肽保留了可迁移的磷酸分子，而且对于不具有基本 C 端残基的多肽也观察到了增强的 z 离子集，这种类型的多肽对基于碰撞激活解离的传统简化方法构成了更大的挑战。这种改进的 LC-MSn 策略在多种多电荷模型肽和肌红蛋白胰蛋白酶消化物中得到了验证。

  DOI：

  10.1021/ac9000942