gamma-hydroxymuconic semialdehyde | 924-98-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: gamma-hydroxymuconic semialdehyde
• 英文别名: 4-hydroxymuconic semialdehyde；γ-Hydroxymuconsaeuresemialdehyd
• CAS: 924-98-1
• 化学式: C₆H₆O₄
• 分子量: 142.111
• InChiKey: NJOJKLHNRGFVOS-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  314.3±42.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.365±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.27
• 重原子数：
  10.0
• 可旋转键数：
  3.0
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.0
• 拓扑面积：
  74.6
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  3.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  对苯二酚 在 bleomycin resistance dioxygenase 、 iron(II) sulfate 、 zinc(II) sulfate 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 反应 0.01h， 生成 gamma-hydroxymuconic semialdehyde
  参考文献：
  名称：

  新分离的烃降解博来霉素抗性双加氧酶的表达，纯化，鉴定和计算机分析。

  摘要：

  在本研究中，我们报告了一种新型的博来霉素抗性双加氧酶（BRPD）的克隆，表达，纯化和表征。使用Ni-NTA亲和层析将带有组氨酸标签的融合蛋白纯化至同质，从600 ml的大肠杆菌培养物中得到1.2 mg的BRPD，比活性为6.25 U mg-1。纯化的酶是二聚体，在SDS-PAGE中分子量约为26 kDa，在天然PAGE分析中分子量约为73 kDa。通过分光光度法对酶促反应进行表征，该蛋白在金属离子存在下催化了包括邻苯二酚和对苯二酚在内的烃类底物的分解。使用EMSA凝胶阻滞分析法证明了博来霉素结合，并通过计算机分析进一步确定了推定的博来霉素结合位点。分子动力学模拟表明，在存在Fe2 +离子的情况下，BRPD达到八面体构型，形成六个配位络合物以降解类似氢醌的分子。相反，在存在Zn 2+离子的情况下，BRPD采用四面体构型，从而能够降解儿茶酚样分子。

  DOI：

  10.1007/s11033-019-05159-x

文献信息

• Expression, purification, characterization and in silico analysis of newly isolated hydrocarbon degrading bleomycin resistance dioxygenase
  作者：Vinay Sharma、Rajender Kumar、Vishal Kumar Sharma、Ashok kumar Yadav、Marja Tiirola、Pushpender Kumar Sharma

  DOI：10.1007/s11033-019-05159-x

  日期：2020.1

  SDS-PAGE and ~ 73 kDa in native PAGE analysis. The protein catalyzed breakdown of hydrocarbon substrates, including catechol and hydroquinone, in the presence of metal ions, as characterized via spectrophotometric analysis of the enzymatic reactions. Bleomycin binding was proven using the EMSA gel retardation assay, and the putative bleomycin binding site was further determined by in silico analysis. Molecular

  在本研究中，我们报告了一种新型的博来霉素抗性双加氧酶（BRPD）的克隆，表达，纯化和表征。使用Ni-NTA亲和层析将带有组氨酸标签的融合蛋白纯化至同质，从600 ml的大肠杆菌培养物中得到1.2 mg的BRPD，比活性为6.25 U mg-1。纯化的酶是二聚体，在SDS-PAGE中分子量约为26 kDa，在天然PAGE分析中分子量约为73 kDa。通过分光光度法对酶促反应进行表征，该蛋白在金属离子存在下催化了包括邻苯二酚和对苯二酚在内的烃类底物的分解。使用EMSA凝胶阻滞分析法证明了博来霉素结合，并通过计算机分析进一步确定了推定的博来霉素结合位点。分子动力学模拟表明，在存在Fe2 +离子的情况下，BRPD达到八面体构型，形成六个配位络合物以降解类似氢醌的分子。相反，在存在Zn 2+离子的情况下，BRPD采用四面体构型，从而能够降解儿茶酚样分子。