基于结构的建模方法已被用于设计一系列对人端粒四链体 DNA 具有选择性的双取代三唑连接的吖啶化合物。使用点击化学制备了这些化合物的重点文库,并针对来自具有已知分子结构的 c-kit 基因的两个启动子四链体以及使用基于 FRET 的熔解方法的双链体 DNA 验证了选择性概念。发现先导化合物对 c-kit 四链体和双链体 DNA 结构的热稳定性的影响降低。通过一系列竞争实验进一步探索了这些影响,这些实验证实,即使在高双链体:端粒四链体比率下,与双链体 DNA 的结合也非常低。c-kit 四链体的选择性更复杂,有一些证据表明它们在超过人类端粒四链体 DNA 的情况下稳定。选择性取决于三唑-吖啶化合物的尺寸,特别是两个烷基-氨基端基的分离。与正常细胞系相比,这两种先导化合物还对癌细胞系的增殖具有选择性抑制作用,并且一种已被证明可以抑制端粒酶的活性,端粒酶在肿瘤细胞中选择性表达,在肿瘤细胞中发挥作用保持端粒完整性和细胞永生化。
基于结构的建模方法已被用于设计一系列对人端粒四链体 DNA 具有选择性的双取代三唑连接的吖啶化合物。使用点击化学制备了这些化合物的重点文库,并针对来自具有已知分子结构的 c-kit 基因的两个启动子四链体以及使用基于 FRET 的熔解方法的双链体 DNA 验证了选择性概念。发现先导化合物对 c-kit 四链体和双链体 DNA 结构的热稳定性的影响降低。通过一系列竞争实验进一步探索了这些影响,这些实验证实,即使在高双链体:端粒四链体比率下,与双链体 DNA 的结合也非常低。c-kit 四链体的选择性更复杂,有一些证据表明它们在超过人类端粒四链体 DNA 的情况下稳定。选择性取决于三唑-吖啶化合物的尺寸,特别是两个烷基-氨基端基的分离。与正常细胞系相比,这两种先导化合物还对癌细胞系的增殖具有选择性抑制作用,并且一种已被证明可以抑制端粒酶的活性,端粒酶在肿瘤细胞中选择性表达,在肿瘤细胞中发挥作用保持端粒完整性和细胞永生化。
Rational Design of Acridine-Based Ligands with Selectivity for Human Telomeric Quadruplexes
作者:Silvia Sparapani、Shozeb M. Haider、Filippo Doria、Mekala Gunaratnam、Stephen Neidle
DOI:10.1021/ja1003944
日期:2010.9.8
of the c-kit quadruplexes and duplex DNA structures. These effects were further explored with a series of competition experiments, which confirmed that binding to duplex DNA is very low even at high duplex:telomeric quadruplex ratios. Selectivity to the c-kit quadruplexes is more complex, with some evidence of their stabilization at increasing excess over humantelomeric quadruplex DNA. Selectivity
基于结构的建模方法已被用于设计一系列对人端粒四链体 DNA 具有选择性的双取代三唑连接的吖啶化合物。使用点击化学制备了这些化合物的重点文库,并针对来自具有已知分子结构的 c-kit 基因的两个启动子四链体以及使用基于 FRET 的熔解方法的双链体 DNA 验证了选择性概念。发现先导化合物对 c-kit 四链体和双链体 DNA 结构的热稳定性的影响降低。通过一系列竞争实验进一步探索了这些影响,这些实验证实,即使在高双链体:端粒四链体比率下,与双链体 DNA 的结合也非常低。c-kit 四链体的选择性更复杂,有一些证据表明它们在超过人类端粒四链体 DNA 的情况下稳定。选择性取决于三唑-吖啶化合物的尺寸,特别是两个烷基-氨基端基的分离。与正常细胞系相比,这两种先导化合物还对癌细胞系的增殖具有选择性抑制作用,并且一种已被证明可以抑制端粒酶的活性,端粒酶在肿瘤细胞中选择性表达,在肿瘤细胞中发挥作用保持端粒完整性和细胞永生化。