[(S)-2,5-Bis-(4,5-dimethoxy-2-nitro-benzyloxy)-tetrahydro-furan-3-yloxy]-tert-butyl-dimethyl-silane | 870295-85-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: [(S)-2,5-Bis-(4,5-dimethoxy-2-nitro-benzyloxy)-tetrahydro-furan-3-yloxy]-tert-butyl-dimethyl-silane
• 英文别名: [(3S)-2,5-bis[(4,5-dimethoxy-2-nitrophenyl)methoxy]oxolan-3-yl]oxy-tert-butyl-dimethylsilane
• CAS: 870295-85-5
• 化学式: C₂₈H₄₀N₂O₁₂Si
• 分子量: 624.717
• InChiKey: XDKYNKJXHJWHCK-JRFCFUNGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.73
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.57
• 拓扑面积：
  166
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(S)-2,5-Bis-(4,5-dimethoxy-2-nitro-benzyloxy)-tetrahydro-furan-3-yloxy]-tert-butyl-dimethyl-silane 在 四丁基氟化铵 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 Diisopropyl-phosphoramidous acid (S)-2,5-bis-(4,5-dimethoxy-2-nitro-benzyloxy)-tetrahydro-furan-3-yl ester 2-cyano-ethyl ester
  参考文献：
  名称：

  C5'-氧化引起的含病变寡核苷酸的制备与分析

  摘要：

  从DNA中核苷酸的C5'位置提取氢原子会导致直接链断裂。切割的DNA的新形成的5'末端由氧化核苷酸的碱不稳定片段组成。一个末端含有5'-醛，作为否则未损坏的核苷酸（T-al）的一部分。C4'-C5'碳-碳键的断裂导致第二个结构更独特的产品，其收率较低。1，4-二氧代-2-磷酰基丁烷（DOB）是烷基化剂丁-2-烯-1,4-丁二酸酯的前体。为了促进对这些病变的研究，合成了包含DOB或T-al的寡脱氧核苷酸的方法在他们的5'端被开发出来。确定了这些损伤对双链体DNA的UV融解温度的影响及其裂解能力。T-al裂解非常慢（t 1/2 = 100.7 h），而DOB在37°C（pH 7.2）下的半衰期少于11 h。另外，DOB与Tris非常有效地形成了稳定的加合物，从而保护了无碱基位点不被裂解。

  DOI：

  10.1021/jo051666k
• 作为产物：
  描述：

  2-[(S)-2-(tert-Butyl-dimethyl-silanyloxy)-3-triethylsilanyloxy-propyl]-[1,3]dithiane 在 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 potassium carbonate 、 戴斯-马丁氧化剂 、 溶剂黄146 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 3.5h， 生成 [(S)-2,5-Bis-(4,5-dimethoxy-2-nitro-benzyloxy)-tetrahydro-furan-3-yloxy]-tert-butyl-dimethyl-silane
  参考文献：
  名称：

  C5'-氧化引起的含病变寡核苷酸的制备与分析

  摘要：

  从DNA中核苷酸的C5'位置提取氢原子会导致直接链断裂。切割的DNA的新形成的5'末端由氧化核苷酸的碱不稳定片段组成。一个末端含有5'-醛，作为否则未损坏的核苷酸（T-al）的一部分。C4'-C5'碳-碳键的断裂导致第二个结构更独特的产品，其收率较低。1，4-二氧代-2-磷酰基丁烷（DOB）是烷基化剂丁-2-烯-1,4-丁二酸酯的前体。为了促进对这些病变的研究，合成了包含DOB或T-al的寡脱氧核苷酸的方法在他们的5'端被开发出来。确定了这些损伤对双链体DNA的UV融解温度的影响及其裂解能力。T-al裂解非常慢（t 1/2 = 100.7 h），而DOB在37°C（pH 7.2）下的半衰期少于11 h。另外，DOB与Tris非常有效地形成了稳定的加合物，从而保护了无碱基位点不被裂解。

  DOI：

  10.1021/jo051666k

文献信息

• Preparation and Analysis of Oligonucleotides Containing Lesions Resulting from C5‘-Oxidation
  作者：Tetsuya Kodama、Marc M. Greenberg

  DOI：10.1021/jo051666k

  日期：2005.11.1

  Hydrogen atom abstraction from the C5‘-position of nucleotides in DNA results in direct strand scission. The newly formed 5‘-termini of the cleaved DNA consists of alkali-labile fragments of the oxidized nucleotide. One terminus contains a 5‘-aldehyde as part of an otherwise undamaged nucleotide (T-al). A second more structurally distinct product that is produced in lower yields results from cleavage of the

  从DNA中核苷酸的C5'位置提取氢原子会导致直接链断裂。切割的DNA的新形成的5'末端由氧化核苷酸的碱不稳定片段组成。一个末端含有5'-醛，作为否则未损坏的核苷酸（T-al）的一部分。C4'-C5'碳-碳键的断裂导致第二个结构更独特的产品，其收率较低。1，4-二氧代-2-磷酰基丁烷（DOB）是烷基化剂丁-2-烯-1,4-丁二酸酯的前体。为了促进对这些病变的研究，合成了包含DOB或T-al的寡脱氧核苷酸的方法在他们的5'端被开发出来。确定了这些损伤对双链体DNA的UV融解温度的影响及其裂解能力。T-al裂解非常慢（t 1/2 = 100.7 h），而DOB在37°C（pH 7.2）下的半衰期少于11 h。另外，DOB与Tris非常有效地形成了稳定的加合物，从而保护了无碱基位点不被裂解。