2-Imino-4-methylpentanoic acid | 68838-05-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: 2-Imino-4-methylpentanoic acid
• CAS: 68838-05-1
• 化学式: C₆H₁₁NO₂
• 分子量: 129.159
• InChiKey: ZVSNYUBKEFRHSF-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1
• 重原子数：
  9
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  61.2
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  D-亮氨酸 在 pseudomonas aeruginosa D-arginine dehydrogenase 、 5-甲基吩嗪硫酸甲酯 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 生成 2-Imino-4-methylpentanoic acid
  参考文献：
  名称：

  Importance of glutamate 87 and the substrate α-amine for the reaction catalyzed by d-arginine dehydrogenase

  摘要：

  Pseudomonas aeruginosa D-arginine dehydrogenaie (PaDADH) catalyzes the oxidation of b-arginine to iminoarginine, which is non-enzymatically hydrolyzed to 2-ketoarginine and ammonia. Here, sitedirected mutagenesis and pH effects were used to investigate binding and catalysis of zwitterionic and cationic substrates for the enzyme. An unprotonated group with apparent pK(a) value >= 7.9 is required for binding D-arginine or D-lysine, but not D-methionine or D-leucine. This group is E87, as suggested by its replacement with leucine. An unprotonated group with pK(a) of 9.5, which persists in the H48F and E87L variants, is required for amine oxidation with all substrates. Since Y53 and Y249 were previously ruled out, the pK(a) is assigned to the substrate alpha-NH3+ group, which previous QM/MM and K-d pH-profile demonstrated to be protonated for preferred binding to the enzyme. Lack of pH effects on the Dk(red) with D-leucine established 9.5 as the intrinsic pK(a), and D-leucine as a non-sticky substrate. D-Arginine, D-lysine and D-methionine and their corresponding iminoproducts were significantly stickier than D-leucine, as indicated by apparent pK(a) values <9.5 in both k(cat)/K-m and k(cat). Restricted proton movements in catalysis were established from hollowed k(cat) pH profiles in wild-type PaDADH with D-lysine and in the H48F and E87L enzymes with D-arginine. (C) 2015 Elsevier Inc. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.abb.2015.01.017

文献信息

• Insights on the Mechanism of Amine Oxidation Catalyzed by <scp>d</scp>-Arginine Dehydrogenase Through pH and Kinetic Isotope Effects
  作者：Hongling Yuan、Yao Xin、Donald Hamelberg、Giovanni Gadda

  DOI：10.1021/ja2082729

  日期：2011.11.23

  The mechanism of amine oxidation catalyzed by D-arginine dehydrogenase (DADH) has been investigated using steady-state and rapid reaction kinetics, with pH, substrate and solvent deuterium kinetic isotope effects (KIE) as mechanistic probes, and computational studies. Previous results showed that 85-90% of the flavin reduction reaction occurs in the mixing time of the stopped-flow spectrophotometer

  D-精氨酸脱氢酶 (DADH) 催化的胺氧化机制已经使用稳态和快速反应动力学进行了研究，pH、底物和溶剂氘动力学同位素效应 (KIE) 作为机制探针和计算研究。先前的结果表明，当精氨酸为底物时，85-90% 的黄素还原反应发生在停流分光光度计的混合时间，排除了机理研究。因此，具有较慢动力学的亮氨酸在这里被用作黄素还原底物。自由能计算和 K(d) 的 pH 值与优先结合底物的两性离子形式的酶一致。Michaelis 复合物的异构化，产生能够还原黄素的酶-底物复合物，由于 k(cat)/K(m) 对溶剂粘度的反双曲线依赖性而建立。胺去质子化触发氧化反应，底物 NH 和 CH 键以异步方式裂解，正如多氘 KIE 对黄素还原速率常数（k（红色））的暗示。9.6 的 pK(a) 表示促进非质子化形式的黄素还原的基团的电离。先前报道的 DADH 的亚氨基精氨酸和亚氨基组氨酸复合物的高分辨率晶体结构使我们能够提出
• Mikrobiologisch hergestellte N-Acetyl-2,3-didehydroleucin-Acylase, Verfahren zu ihrer Gewinnung und ihre Verwendung
  申请人：Degussa Aktiengesellschaft

  公开号：EP0381997A1

  公开（公告）日：1990-08-16

  Gegenstand der Erfindung ist eine mikrobiologisch hergestellte N-Acetyl-2,3-didehydroaminosäure-Acylase und ein Verfahren zu ihrer Gewinnung aus Zoogloea ramigera DSM 4306. Das neue Enzym kann in einem gekoppelten Enzymsystem mit einer L-Leucindehydrogenase zur enzymatischen Umwandlung von N-Acetyl-2,3-didehydroleucin zu L-Leucin über die Zwischenstufen 2-Imino-4-methyl-pentansäure bzw. 2-Keto-4-methyl-pentansäure verwendet werden. Weiterhin kann die Acylase zur Herstellung von D- oder L-Tryptophylglycin aus D- oder L-Tryptophanamid und Glycin sowie von anderen Tryptophyldipeptiden aus Tryptophanamid und einer freien Aminosäure als Aminokomponente eingesetzt werden.

  本发明的主题是一种微生物生产的 N-乙酰基-2,3-二脱氢氨基酸酰化酶，以及从 Zoogloea ramigera DSM 4306 中获得这种酶的工艺。这种新酶可用于与 L-亮氨酸脱氢酶耦合的酶系统中，通过中间产物 2-亚氨基-4-甲基戊酸或 2-酮基-4-甲基戊酸将 N-乙酰基-2,3-二脱氢亮氨酸酶促转化为 L-亮氨酸。此外，酰化酶还可用于从 D-或 L-色氨酰胺和甘氨酸生产 D-或 L-色氨酰甘氨酸，以及从色氨酰胺和游离氨基酸作为氨基成分生产其他色素二肽。
• US5134073A
  申请人：——

  公开号：US5134073A

  公开（公告）日：1992-07-28
• US5212069A
  申请人：——

  公开号：US5212069A

  公开（公告）日：1993-05-18
• [EN] COMPOSITIONS AND METHODS FOR TREATING NEURODEGENERATIVE DISEASES<br/>[FR] COMPOSITIONS ET MÉTHODES POUR TRAITER DES MALADIES NEURODÉGÉNÉRATIVES
  申请人：UNIV CALIFORNIA

  公开号：WO2019038655A1

  公开（公告）日：2019-02-28

  Disclosed herein are methods and compounds for treating neurodegenerative diseases and disorders with one or more neurodegenerative therapeutics and/or amino acid derivatives or analogs.