(2S,4S)-4-Acetylsulfanyl-1-((R)-2-{[(S)-1-((S)-2-chloro-propionyl)-pyrrolidine-2-carbonyl]-amino}-propionyl)-pyrrolidine-2-carboxylic acid methyl ester | 220061-78-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (2S,4S)-4-Acetylsulfanyl-1-((R)-2-{[(S)-1-((S)-2-chloro-propionyl)-pyrrolidine-2-carbonyl]-amino}-propionyl)-pyrrolidine-2-carboxylic acid methyl ester
• 英文别名: methyl (2S,4S)-4-acetylsulfanyl-1-[(2R)-2-[[(2S)-1-[(2S)-2-chloropropanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]propanoyl]pyrrolidine-2-carboxylate
• CAS: 220061-78-9
• 化学式: C₁₉H₂₈ClN₃O₆S
• 分子量: 461.967
• InChiKey: QRMDLHNJNJBXME-HZZBMVKVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.1
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.74
• 拓扑面积：
  138
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2S,4S)-4-Acetylsulfanyl-1-((R)-2-{[(S)-1-((S)-2-chloro-propionyl)-pyrrolidine-2-carbonyl]-amino}-propionyl)-pyrrolidine-2-carboxylic acid methyl ester 在 氢氧化钾 、 sodium hydroxide 、 水 、 双(2-氧代-3-恶唑烷基)次磷酰氯 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 25.33h， 生成 (1S,3R,9S,12R,15S)-3,12-Dimethyl-4,10,13-trioxo-2-thia-5,11,14-triaza-tricyclo[12.2.1.0^5,9]heptadecane-15-carboxylic acid [(S)-1-((S)-1-methylcarbamoyl-2-phenyl-ethylcarbamoyl)-ethyl]-amide
  参考文献：
  名称：

  设计用于起始α-螺旋的肽N-末端帽模板的设计，构建和性质。第3部分..衍生自N -[（2 S）-2-氯丙酰基]-（2 S）-Pro-（2 R）-Ala-（2 S，4 S）-4-thioPro-OMe的盖帽

  摘要：

  构建能够从无环N -[（2 S）-2-氯丙酰基]-（2 S）-Pro-（2 S）-Pro-（2 S， 4秒）-4-thioPro-OMe前体由于在过渡态中同时对齐羧酰胺偶极以进行环化的问题而受到严重阻碍。以前，我们提供了该系统的详细构象分析，并测试了两种将无环前体强制为螺旋引发所需的大环构象的方法。首先，用于环化的过渡态中不需要的构象不稳定，其次，通过引入氢键相互作用，稳定了有利的过渡态结构。两种策略均未成功。还测试了基于消除所有羰基偶极同时在过渡态下排列的要求的第三种策略，并在此处介绍了结果。严格约束的C的放松无环前体中Pro 3的α- N键扭转，通过取代（2 R）-丙氨酸残基，将第二个羧酰胺基团的运动与Cα - N键扭转有效地解耦，并允许第二个羧酰胺基团旋转。该旋转允许螺旋构象在向大环的过渡状态中发展，而无需对准所有羧酰胺偶极，并导致成功的环化以产生全反式（ ttt）形式的模板结构。通

  DOI：

  10.1039/a806032k
• 作为产物：
  描述：

  (2S,2'S)-N-(2'-Chloropropionyl)proline 、 [(2R)-1-[(2S,4S)-4-acetylsulfanyl-2-methoxycarbonylpyrrolidin-1-yl]-1-oxopropan-2-yl]azanium;2,2,2-trifluoroacetate 在 双(2-氧代-3-恶唑烷基)次磷酰氯 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 (2S,4S)-4-Acetylsulfanyl-1-((R)-2-{[(S)-1-((S)-2-chloro-propionyl)-pyrrolidine-2-carbonyl]-amino}-propionyl)-pyrrolidine-2-carboxylic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  N -[（2 S）-2-氯丙酰基]-（2 S）-Pro-（2 R）-Ala-（2 S，4 S）衍生的α-螺旋帽模板的设计，合成，结构和性质引发α-螺旋结构的-4-thioPro-OMe

  摘要：

  一种基于消除所有羰基偶极子在过渡状态下同时排列的要求的策略，从而导致N-[（2S）-2-氯丙酰基]-（2S）-Pro-（2R）-环化Zila-Bragg型α-螺旋肽启动子模板的Ala-（2S，4S）-4-thioPro-OMe成功。12-元大环模板的每个酰胺键都以反式-旋转异构体形式存在。通过扩展C端制备模板的衍生物，并通过NMR光谱和受限的模拟退火对其进行表征。在低温的氘代三氯甲烷溶液中，观察到分别具有两个附加的三烷基铵离子的硫醚大环的两个快速相互转化的螺旋构象异构体的NMR信号集。在水溶液中也观察到类似的时间平均构象。2-二氯甲烷的构象交换速率足够慢，以得到每种异构体的共振分配和NOE数据。在次要异构体（40％）中，模板的四个羰基氧氢键受体以α-螺旋构象排列，而在主要构象中，Pro 2羰基偶极与其他三个偶极反排列。因此，构象异构体在一个羰基的取向上不同。分子模型计算表明，三烷基铵盐和羰

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(98)00991-0

文献信息

• Design, construction and properties of peptide N-terminal cap templates devised to initiate α-helices. Part 3.† Caps derived from N-[(2S )-2-chloropropionyl]-(2S )-Pro-(2R)-Ala-(2S,4S )-4-thioPro-OMe
  作者：Arwel Lewis、Trevor J. Rutherford、John Wilkie、Thierry Jenn、David Gani

  DOI：10.1039/a806032k

  日期：——

  template capable of entraining attached peptides in helical conformations from acyclic N-[(2S)-2-chloropropionyl]-(2S)-Pro-(2S)-Pro-(2S,4S)-4-thioPro-OMe precursors has been severely hampered by the problem of simultaneously aligning carboxamide dipoles in the transition state for cyclisation. Previously we provided a detailed conformational analysis of the system and tested two methods for forcing the acyclic

  构建能够从无环N -[（2 S）-2-氯丙酰基]-（2 S）-Pro-（2 S）-Pro-（2 S， 4秒）-4-thioPro-OMe前体由于在过渡态中同时对齐羧酰胺偶极以进行环化的问题而受到严重阻碍。以前，我们提供了该系统的详细构象分析，并测试了两种将无环前体强制为螺旋引发所需的大环构象的方法。首先，用于环化的过渡态中不需要的构象不稳定，其次，通过引入氢键相互作用，稳定了有利的过渡态结构。两种策略均未成功。还测试了基于消除所有羰基偶极同时在过渡态下排列的要求的第三种策略，并在此处介绍了结果。严格约束的C的放松无环前体中Pro 3的α- N键扭转，通过取代（2 R）-丙氨酸残基，将第二个羧酰胺基团的运动与Cα - N键扭转有效地解耦，并允许第二个羧酰胺基团旋转。该旋转允许螺旋构象在向大环的过渡状态中发展，而无需对准所有羧酰胺偶极，并导致成功的环化以产生全反式（ ttt）形式的模板结构。通
• Design, synthesis, structure and properties of an α-helix cap template derived from N-[(2S)-2-chloropropionyl]-(2S)-Pro-(2R)-Ala-(2S,4S)-4-thioPro-OMe which initiates α-helical structures
  作者：David Gani、Arwel Lewis、Trevor Rutherford、John Wilkie、Iain Stirling、Thierry Jenn、Martin D. Ryan

  DOI：10.1016/s0040-4020(98)00991-0

  日期：1998.12

  were characterised by NMR spectroscopy and restrained simulated annealing. In deuterochloroform solution at low temperature, separate sets of NMR signals were observed for two rapidly interconverting helical conformational isomers of the thioether macrocycle which possessed an appended trialkylammonium ion. A similar time-averaged conformation was also observed in aqueous solution. At −80 °C in d2-dichloromethane

  一种基于消除所有羰基偶极子在过渡状态下同时排列的要求的策略，从而导致N-[（2S）-2-氯丙酰基]-（2S）-Pro-（2R）-环化Zila-Bragg型α-螺旋肽启动子模板的Ala-（2S，4S）-4-thioPro-OMe成功。12-元大环模板的每个酰胺键都以反式-旋转异构体形式存在。通过扩展C端制备模板的衍生物，并通过NMR光谱和受限的模拟退火对其进行表征。在低温的氘代三氯甲烷溶液中，观察到分别具有两个附加的三烷基铵离子的硫醚大环的两个快速相互转化的螺旋构象异构体的NMR信号集。在水溶液中也观察到类似的时间平均构象。2-二氯甲烷的构象交换速率足够慢，以得到每种异构体的共振分配和NOE数据。在次要异构体（40％）中，模板的四个羰基氧氢键受体以α-螺旋构象排列，而在主要构象中，Pro 2羰基偶极与其他三个偶极反排列。因此，构象异构体在一个羰基的取向上不同。分子模型计算表明，三烷基铵盐和羰