[(1S,5R,9R,16S,20S,24R,28R,35S)-22-hydroxy-3-tridecacyclo[22.14.1.15,20.19,16.128,35.02,23.04,21.06,19.08,17.010,15.025,38.027,36.029,34]dotetraconta-2,4(21),6(19),7,10,12,14,17,22,25(38),26,29,31,33,36-pentadecaenyl] dimethyl phosphate | 1427323-49-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 蒽
• 英文名称: [(1S,5R,9R,16S,20S,24R,28R,35S)-22-hydroxy-3-tridecacyclo[22.14.1.15,20.19,16.128,35.02,23.04,21.06,19.08,17.010,15.025,38.027,36.029,34]dotetraconta-2,4(21),6(19),7,10,12,14,17,22,25(38),26,29,31,33,36-pentadecaenyl] dimethyl phosphate
• CAS: 1427323-49-6
• 化学式: C₄₄H₃₅O₅P
• 分子量: 674.733
• InChiKey: AMUSCAIWDDOCSL-OFHRGMLRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.3
• 重原子数：
  50
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  13.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  65
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(1S,5R,9R,16S,20S,24R,28R,35S)-22-hydroxy-3-tridecacyclo[22.14.1.15,20.19,16.128,35.02,23.04,21.06,19.08,17.010,15.025,38.027,36.029,34]dotetraconta-2,4(21),6(19),7,10,12,14,17,22,25(38),26,29,31,33,36-pentadecaenyl] dimethyl phosphate 在 sodium hydroxide monohydrate 、 三甲基溴硅烷 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 27.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  双位精氨酸-天冬氨酸结合剂识别 RGD 环

  摘要：

  开发了一种合成策略，用于构建具有额外羧酸盐结合位点的不对称精氨酸镊子。双位受体分子 2 和 3 使用两个臂来结合精氨酸-甘氨酸-天冬氨酸 (RGD) 肽。然而，与分子力学模拟的预期相反，镊子腔仍然是空的，精氨酸通过简单的胍/磷酸盐离子对形成结合。另一方面，胍基吡咯部分对羧酸盐的识别非常有效，导致线性和环状 RGD 肽中的离子氨基酸在缓冲水溶液（Kd = 20-30 μM）中以低微摩尔范围的浓度复合。整个胍基吡咯臂的截断导致了简单的不对称单磷酸盐镊子 1，它缺乏天冬氨酸结合剂，但恢复精氨酸内含物。镊子 1 对环状 RGD 肽显示出显着的亲和力和选择性，这可能是由于精氨酸包含和其酚 OH 基团与肽主链之间的额外协同氢键的组合（NMR 证据，Kd = 15-30 μM）。与对称二磷酸盐镊子 1a 和 2-4 的比较表明，在不对称镊子中，间隔基团必须保证空腔开放。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201201052
• 作为产物：
  描述：

  8,19-Diacetoxy-5,7,9,11,16,18,20,22-octahydro-5,22:7,20:9,18:11,16-tetramethanononacene 在 三乙胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 水 为溶剂， 反应 32.5h， 生成 [(1S,5R,9R,16S,20S,24R,28R,35S)-22-hydroxy-3-tridecacyclo[22.14.1.15,20.19,16.128,35.02,23.04,21.06,19.08,17.010,15.025,38.027,36.029,34]dotetraconta-2,4(21),6(19),7,10,12,14,17,22,25(38),26,29,31,33,36-pentadecaenyl] dimethyl phosphate
  参考文献：
  名称：

  双位精氨酸-天冬氨酸结合剂识别 RGD 环

  摘要：

  开发了一种合成策略，用于构建具有额外羧酸盐结合位点的不对称精氨酸镊子。双位受体分子 2 和 3 使用两个臂来结合精氨酸-甘氨酸-天冬氨酸 (RGD) 肽。然而，与分子力学模拟的预期相反，镊子腔仍然是空的，精氨酸通过简单的胍/磷酸盐离子对形成结合。另一方面，胍基吡咯部分对羧酸盐的识别非常有效，导致线性和环状 RGD 肽中的离子氨基酸在缓冲水溶液（Kd = 20-30 μM）中以低微摩尔范围的浓度复合。整个胍基吡咯臂的截断导致了简单的不对称单磷酸盐镊子 1，它缺乏天冬氨酸结合剂，但恢复精氨酸内含物。镊子 1 对环状 RGD 肽显示出显着的亲和力和选择性，这可能是由于精氨酸包含和其酚 OH 基团与肽主链之间的额外协同氢键的组合（NMR 证据，Kd = 15-30 μM）。与对称二磷酸盐镊子 1a 和 2-4 的比较表明，在不对称镊子中，间隔基团必须保证空腔开放。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201201052

文献信息

• Linker Effects on Amino Acid and Peptide Recognition by Molecular Tweezers
  作者：Som Dutt、Constanze Wilch、Thomas Gersthagen、Christoph Wölper、Andrea Anna Sowislok、Frank-Gerrit Klärner、Thomas Schrader

  DOI：10.1002/ejoc.201301211

  日期：2013.12

  basic amino acids by competing self-inclusion. As a general trend, affinities for linkers with ester and carboxylate moieties were substantially higher than those for tethers with ethers and alcohols, likely because the electron-rich carbonyl group keeps the cavity open. Additional hydrogen bonds between the linker unit and suitable amino acid or peptide guests greatly support the complexation process;

  当通用的、强大的但非特异性的受体分子转化为特定的双位宿主时，经常发生从单位对称到双位不对称分子识别的转变。尤其是在水中，这一努力伴随着巨大的挑战，其中包括主客体定向、正交识别模式和连接单元的性质。这项工作提供了一个关于碱性氨基酸和肽的强大通用宿主的案例研究。对称分子镊子骨架被系统地去对称化并用各种常见的连接器单元进行修饰，并通过核磁共振光谱、荧光滴定、X 射线晶体学和分子模拟详细研究了这些变化对分子识别谱的深远影响。揭示了可归因于不同接头的化学性质的多种不同影响。一般而言，长烷基系链通过范德华力与其入口周围的 CH 基团接触来堵塞镊子的空腔；烷氧基烷基系链同样通过竞争性自包含降低了对碱性氨基酸的镊子亲和力。作为一般趋势，具有酯和羧酸盐部分的接头的亲和力显着高于具有醚和醇的连接物的亲和力，这可能是因为富含电子的羰基使空腔保持打开状态。接头单元和合适的氨基酸或肽客体之间的额外氢键极大地支持了复
• [EN] NEW MOLECULAR TWEEZERS AGAINST NEUROLOGICAL DISORDERS AND VIRAL INFECTIONS<br/>[FR] NOUVELLES PINCES MOLÉCULAIRES CONTRE DES TROUBLES NEUROLOGIQUES ET DES INFECTIONS VIRALES
  申请人：UNIV CALIFORNIA

  公开号：WO2020006489A1

  公开（公告）日：2020-01-02

  In various embodiments new molecular tweezers compounds are provided. The compounds described herein (e.g., molecular tweezers) are believed to be useful for inhibiting protein aggregation (or disaggregating aggregated proteins). In certain embodiments the compounds described herein (e.g., molecular tweezers) are believed to be useful in the treatment of pathologies characterized by protein aggregation (e.g., amyloidopathies), and/or in the treatment of brain or spinal cord damage associated with acute trauma, stroke, and the like, and/or in the treatment of lysosomal storage diseases, and/or in the treatment of lipofuscin-related disorders, and in various viral infections.

  在各种实施方式中，提供了新的分子钳化合物。本文所描述的化合物（例如分子钳）被认为有用于抑制蛋白质聚集（或使已聚集的蛋白质解聚）的作用。在某些实施方式中，本文所描述的化合物（例如分子钳）被认为有用于治疗由蛋白质聚集（例如淀粉样病变）所特征的病理状况，和/或用于治疗与急性创伤、中风等相关的脑或脊髓损伤，和/或用于治疗溶酶体贮积病，和/或用于治疗脂褐质相关疾病，以及各种病毒感染的作用。
• Ditopic Arginine-Aspartate Binders Recognize RGD Loops
  作者：Thomas Gersthagen、Johannes Hofmann、Frank-Gerrit Klärner、Carsten Schmuck、Thomas Schrader

  DOI：10.1002/ejoc.201201052

  日期：2013.2

  both linear and cyclic RGD peptides with concentrations in the low micromolar range in a buffered aqueous solution (Kd = 20–30 μM). Truncation of the whole guanidiniopyrrole arm leads to the simple unsymmetrical monophosphate tweezer 1, which lacks the aspartate binder, but restores the arginine inclusion. Tweezer 1 displays a remarkable affinity and selectivity towards cyclic RGD peptides, presumably

  开发了一种合成策略，用于构建具有额外羧酸盐结合位点的不对称精氨酸镊子。双位受体分子 2 和 3 使用两个臂来结合精氨酸-甘氨酸-天冬氨酸 (RGD) 肽。然而，与分子力学模拟的预期相反，镊子腔仍然是空的，精氨酸通过简单的胍/磷酸盐离子对形成结合。另一方面，胍基吡咯部分对羧酸盐的识别非常有效，导致线性和环状 RGD 肽中的离子氨基酸在缓冲水溶液（Kd = 20-30 μM）中以低微摩尔范围的浓度复合。整个胍基吡咯臂的截断导致了简单的不对称单磷酸盐镊子 1，它缺乏天冬氨酸结合剂，但恢复精氨酸内含物。镊子 1 对环状 RGD 肽显示出显着的亲和力和选择性，这可能是由于精氨酸包含和其酚 OH 基团与肽主链之间的额外协同氢键的组合（NMR 证据，Kd = 15-30 μM）。与对称二磷酸盐镊子 1a 和 2-4 的比较表明，在不对称镊子中，间隔基团必须保证空腔开放。