methyl 6-[3-[(2S,3S,4S,5S)-6-(4-amino-2-chloro-5-methoxyphenoxy)-2,3,4,5-tetrahydroxyhexoxy]-5-fluorophenyl]pyridine-3-carboxylate | 1417792-52-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡啶及其衍生物
• 英文名称: methyl 6-[3-[(2S,3S,4S,5S)-6-(4-amino-2-chloro-5-methoxyphenoxy)-2,3,4,5-tetrahydroxyhexoxy]-5-fluorophenyl]pyridine-3-carboxylate
• CAS: 1417792-52-9
• 化学式: C₂₆H₂₈ClFN₂O₉
• 分子量: 566.968
• InChiKey: FZADGJLSWIKPQC-NBMBROAQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.6
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  174
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 6-[3-[(2S,3S,4S,5S)-6-(4-amino-2-chloro-5-methoxyphenoxy)-2,3,4,5-tetrahydroxyhexoxy]-5-fluorophenyl]pyridine-3-carboxylate 在 水 、 potassium carbonate 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 反应 0.08h， 生成 6-[3-[(2S,3S,4S,5S)-6-[4-[[2-(5-carboxypyridin-2-yl)sulfanylacetyl]amino]-2-chloro-5-methoxyphenoxy]-2,3,4,5-tetrahydroxyhexoxy]-5-fluorophenyl]pyridine-3-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  片段的生长和连接导致新型纳摩尔乳酸脱氢酶抑制剂。

  摘要：

  乳酸脱氢酶A（LDH-A）催化糖酵解途径中乳酸和丙酮酸的相互转化。癌细胞严重依赖于糖酵解而不是氧化磷酸化来生成ATP，这种现象被称为Warburg效应。因此，对于潜在的癌症治疗而言，小分子对LDH-A的抑制作用是令人关注的。我们描述了通过基于片段的药物发现对LDH-A抑制剂的鉴定和优化。我们应用了基于配体的NMR筛选来鉴定与LDH-A结合的低亲和力片段。解离常数（K d）和酶抑制（IC 50分别通过表面等离振子共振（SPR）和酶法测定片段命中率。通过X射线晶体学研究所选片段的结合模式。片段的生长和连接，然后进行化学优化，产生了纳摩尔浓度的LDH-A抑制剂，该抑制剂表现出与LDH-A的化学计量结合。选择的分子抑制细胞中乳酸的产生，表明癌细胞系中靶标特异性抑制。

  DOI：

  10.1021/jm3014844
• 作为产物：
  描述：

  3-氟-5-羟基苯基硼酸 在 盐酸 、 四(三苯基膦)钯 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 potassium carbonate 、 氯化铵 、 三苯基膦 、 锌 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 丙酮 为溶剂， 反应 0.75h， 生成 methyl 6-[3-[(2S,3S,4S,5S)-6-(4-amino-2-chloro-5-methoxyphenoxy)-2,3,4,5-tetrahydroxyhexoxy]-5-fluorophenyl]pyridine-3-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  片段的生长和连接导致新型纳摩尔乳酸脱氢酶抑制剂。

  摘要：

  乳酸脱氢酶A（LDH-A）催化糖酵解途径中乳酸和丙酮酸的相互转化。癌细胞严重依赖于糖酵解而不是氧化磷酸化来生成ATP，这种现象被称为Warburg效应。因此，对于潜在的癌症治疗而言，小分子对LDH-A的抑制作用是令人关注的。我们描述了通过基于片段的药物发现对LDH-A抑制剂的鉴定和优化。我们应用了基于配体的NMR筛选来鉴定与LDH-A结合的低亲和力片段。解离常数（K d）和酶抑制（IC 50分别通过表面等离振子共振（SPR）和酶法测定片段命中率。通过X射线晶体学研究所选片段的结合模式。片段的生长和连接，然后进行化学优化，产生了纳摩尔浓度的LDH-A抑制剂，该抑制剂表现出与LDH-A的化学计量结合。选择的分子抑制细胞中乳酸的产生，表明癌细胞系中靶标特异性抑制。

  DOI：

  10.1021/jm3014844