Chemical scaffold recycling: Structure-guided conversion of an HIV integrase inhibitor into a potent influenza virus RNA-dependent RNA polymerase inhibitor designed to minimize resistance potential
作者:Peter J. Slavish、Maxime G. Cuypers、Mary Ashley Rimmer、Alireza Abdolvahabi、Trushar Jeevan、Gyanendra Kumar、Jamie A. Jarusiewicz、Sivaraja Vaithiyalingam、Jeremy C. Jones、John J. Bowling、Jeanine E. Price、Rebecca M. DuBois、Jaeki Min、Richard J. Webby、Zoran Rankovic、Stephen W. White
DOI:10.1016/j.ejmech.2022.115035
日期:2023.2
active site of the target endonuclease domain of the RNA-dependent-RNA polymerase renders the recent FDA approved compound ∼1000-fold less effective. Raltegravir is a first-in-class HIV inhibitor that shows modest activity to the endonuclease. Here, we have used structure-guided approaches to create rationally designed derivative molecules that efficiently engage the endonuclease active site. The design
流感是全球疾病相关死亡的主要原因之一。在过去的几十年中,已经实施了几种策略来阻碍流感病毒的复制周期,所有这些都导致了耐药病毒株的出现。最近的例子是 baloxavir marboxil,其中 RNA 依赖性 RNA 聚合酶的靶核酸内切酶结构域活性位点的单个突变使最近 FDA 批准的化合物的有效性降低了 1000 倍。Raltegravir 是一流的 HIV 抑制剂,对核酸内切酶显示出适度的活性。在这里,我们使用结构导向的方法来创建合理设计的衍生分子,这些分子可以有效地结合核酸内切酶活性位点。设计策略是由我们之前发表的核酸内切酶-底物复合物结构驱动的,这使我们能够针对功能保守的残基并降低抗性突变的可能性。我们成功地开发了野生型和耐巴洛沙韦核酸内切酶的低纳摩尔等效抑制剂。我们还开发了这些抑制剂的大环版本,它们以与“开放”对应物相同的方式参与活性位点,但亲和力降低。结构分析为如何增加这些环状化合