(2R,4S,5R,6R)-5-acetamido-2-(((((2R,3S,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)methoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-4-hydroxy-6-((1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl)tetrahydro-2H-pyran-2-carboxylic-3,3-d2 acid | 283614-58-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: (2R,4S,5R,6R)-5-acetamido-2-(((((2R,3S,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)methoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-4-hydroxy-6-((1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl)tetrahydro-2H-pyran-2-carboxylic-3,3-d2 acid
• CAS: 283614-58-4
• 化学式: C₂₀H₃₁N₄O₁₆P
• 分子量: 616.441
• InChiKey: TXCIAUNLDRJGJZ-AIAKHZRBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -5.27
• 重原子数：
  41.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.7
• 拓扑面积：
  322.91
• 氢给体数：
  10.0
• 氢受体数：
  17.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,4S,5R,6R)-5-acetamido-2-(((((2R,3S,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)methoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-4-hydroxy-6-((1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl)tetrahydro-2H-pyran-2-carboxylic-3,3-d2 acid 在 α-2,6-sialyl transferase 、 micromonospora veridifaciens sialidase 、 水 、 bovine serum albumin 作用下， 生成
  参考文献：
  名称：

  绿色小单孢菌唾液酸酶催化水解的去糖基化会限制周转率：Michaelis 复合物的构象意义

  摘要：

  基于核心结构 7-(5-acetamido-3,5-dideoxy-d-glycero-α-d-galacto-non-2-ulopyranosylonic acid)-(2→6) 的一组七种同位素取代的唾液酸苷天然底物类似物)-β-D-吡喃半乳糖氧基)-8-氟-4-甲基香豆素 (1, Neu5Acα2,6GalβFMU) 已被合成并用于探测 M. viridifaciens 唾液酸酶转换的限速步骤。环氧 ((18)V)、离去基团氧 ((18)V)、异头碳 ((13)V)、C3-碳 ((13) V)、C3-R 氘 ((D)V(R))、C3-S 氘 ((D)V(S)) 和 C3-双氘 ((D)(2)V) 为 0.986 ± 0.003、1.003分别为 ± 0.005、1.021 ± 0.006、1.001 ± 0.008、1.029 ± 0.007、0.891 ± 0.008 和 0.890

  DOI：

  10.1021/ja109199p
• 作为产物：
  描述：

  、 cytidine 5′-triphosphate disodium salt 在 CMP-Neu₅Ac synthase 、 三羟甲基氨基甲烷 、 magnesium chloride 、 1,4-二巯基-2,3-丁二醇 作用下， 生成 (2R,4S,5R,6R)-5-acetamido-2-(((((2R,3S,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)methoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-4-hydroxy-6-((1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl)tetrahydro-2H-pyran-2-carboxylic-3,3-d2 acid
  参考文献：
  名称：

  绿色小单孢菌唾液酸酶催化水解的去糖基化会限制周转率：Michaelis 复合物的构象意义

  摘要：

  基于核心结构 7-(5-acetamido-3,5-dideoxy-d-glycero-α-d-galacto-non-2-ulopyranosylonic acid)-(2→6) 的一组七种同位素取代的唾液酸苷天然底物类似物)-β-D-吡喃半乳糖氧基)-8-氟-4-甲基香豆素 (1, Neu5Acα2,6GalβFMU) 已被合成并用于探测 M. viridifaciens 唾液酸酶转换的限速步骤。环氧 ((18)V)、离去基团氧 ((18)V)、异头碳 ((13)V)、C3-碳 ((13) V)、C3-R 氘 ((D)V(R))、C3-S 氘 ((D)V(S)) 和 C3-双氘 ((D)(2)V) 为 0.986 ± 0.003、1.003分别为 ± 0.005、1.021 ± 0.006、1.001 ± 0.008、1.029 ± 0.007、0.891 ± 0.008 和 0.890

  DOI：

  10.1021/ja109199p