N-((4,7,10-tris[(tert-butoxy)carbonyl]-1,4,7,10-tetraazacyclododecan-1-yl)acetyl)-glycyl-S-[(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)methyl]-L-cysteine methyl ester | 1309665-87-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-((4,7,10-tris[(tert-butoxy)carbonyl]-1,4,7,10-tetraazacyclododecan-1-yl)acetyl)-glycyl-S-[(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)methyl]-L-cysteine methyl ester
• CAS: 1309665-87-9
• 化学式: C₃₆H₆₀N₈O₁₂S
• 分子量: 828.985
• InChiKey: LAOAZAXOLOZFFA-VWLOTQADSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.1
• 重原子数：
  57.0
• 可旋转键数：
  10.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.72
• 拓扑面积：
  242.08
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  14.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-((4,7,10-tris[(tert-butoxy)carbonyl]-1,4,7,10-tetraazacyclododecan-1-yl)acetyl)-glycyl-S-[(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)methyl]-L-cysteine methyl ester 在 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 2.0h， 以93%的产率得到N-((4,7,10-tris[(tert-butoxy)carbonyl]-1,4,7,10-tetraazacyclododecan-1-yl)acetyl)-glycyl-S-[(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)methyl]-L-cysteine
  参考文献：
  名称：

  新型 PNA 结合 Cyclen 复合物的合成、DNA 结合和切割研究

  摘要：

  已经合成并表征了一种新型的附加香豆素的 PNA 结合循环衍生物配体 C1 及其铜 (II) 复合物 C2。这些化合物与 DNA 的相互作用通过吸收、荧光和粘度滴定以及 DNA 熔化和凝胶电泳实验进行了系统研究。DNA熔解和粘度滴定实验表明，C1的结合方式为沟结合，C2为多重结合方式，包括沟结合和静电结合。从吸收滴定数据，我们可以说 CT DNA 和两种化合物之间的主要相互作用可能是核碱基之间的 H 键。荧光研究表明，C1 与 d(A)9 的结合能力是其他寡脱氧核苷酸的两倍或三倍。

  DOI：

  10.1002/cbdv.201000084
• 作为产物：
  描述：

  methyl N-[(tert-butoxy)carbonyl]glycyl-S-[(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)methyl]-L-cysteinate 在 盐酸 、 1-羟基苯并三唑 、 三乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 N-((4,7,10-tris[(tert-butoxy)carbonyl]-1,4,7,10-tetraazacyclododecan-1-yl)acetyl)-glycyl-S-[(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)methyl]-L-cysteine methyl ester
  参考文献：
  名称：

  新型 PNA 结合 Cyclen 复合物的合成、DNA 结合和切割研究

  摘要：

  已经合成并表征了一种新型的附加香豆素的 PNA 结合循环衍生物配体 C1 及其铜 (II) 复合物 C2。这些化合物与 DNA 的相互作用通过吸收、荧光和粘度滴定以及 DNA 熔化和凝胶电泳实验进行了系统研究。DNA熔解和粘度滴定实验表明，C1的结合方式为沟结合，C2为多重结合方式，包括沟结合和静电结合。从吸收滴定数据，我们可以说 CT DNA 和两种化合物之间的主要相互作用可能是核碱基之间的 H 键。荧光研究表明，C1 与 d(A)9 的结合能力是其他寡脱氧核苷酸的两倍或三倍。

  DOI：

  10.1002/cbdv.201000084