Methyl 3-[[2-[6,20-bis(2-hydroxyethyl)-2,2-dimethyl-20-aza-6-azoniapentacyclo[12.8.0.03,12.05,10.016,21]docosa-1(14),3,5,10,12,15,21-heptaen-13-yl]benzoyl]-methylamino]propanoate | 1241912-53-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 蒽
• 英文名称: Methyl 3-[[2-[6,20-bis(2-hydroxyethyl)-2,2-dimethyl-20-aza-6-azoniapentacyclo[12.8.0.03,12.05,10.016,21]docosa-1(14),3,5,10,12,15,21-heptaen-13-yl]benzoyl]-methylamino]propanoate
• CAS: 1241912-53-7
• 化学式: C₃₈H₄₆N₃O₅
• 分子量: 624.8
• InChiKey: ZFMQBJBPUCTUNV-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3
• 重原子数：
  46
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  93.3
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Methyl 3-[[2-[6,20-bis(2-hydroxyethyl)-2,2-dimethyl-20-aza-6-azoniapentacyclo[12.8.0.03,12.05,10.016,21]docosa-1(14),3,5,10,12,15,21-heptaen-13-yl]benzoyl]-methylamino]propanoate 在 水 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 以81%的产率得到3-[[2-[6,20-Bis(2-hydroxyethyl)-2,2-dimethyl-20-aza-6-azoniapentacyclo[12.8.0.03,12.05,10.016,21]docosa-1(14),3,5,10,12,15,21-heptaen-13-yl]benzoyl]-methylamino]propanoate
  参考文献：
  名称：

  用于光学显微镜和纳米显微镜的发红碳吡喃染料的通用途径

  摘要：

  生物显微镜偏爱具有大荧光量子产率、低暗三重态种群、良好的生物相容性和近红外吸收和发射最大值的光稳定性荧光标记物，在该处细胞自发荧光被最小化。在本研究中，合成了在 640 nm 附近吸收并在 660 nm 附近发射、具有低系统间交叉率 (kisc ≈ 0.5 e6/s) 和优异的细胞成像特性的碳吡咯啉。介绍了在合成的最后步骤或在所得荧光染料中具有可变官能团的碳吡喃酮的一般合成路线。母体染料具有两个 2-甲氧基乙基，可溶于水和大多数有机溶剂。染料或其前体的去甲基化是直接、干净、并提供具有一个或两个 2-羟乙基基团的化合物，可用于进一步转化。含接头的羧基中的修饰也是可能的。描述了从简单的前体开始并利用单个临时保护基团的染料的多步合成。所提出的方法可以进一步应用于笼状碳吡喃酮的设计。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201000343
• 作为产物：
  描述：

  Methyl 3-[[2-[6,20-bis(2-methoxyethyl)-2,2-dimethyl-20-aza-6-azoniapentacyclo[12.8.0.03,12.05,10.016,21]docosa-1(14),3,5,10,12,15,21-heptaen-13-yl]benzoyl]-methylamino]propanoate;chloride 在 三溴化硼 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 以60%的产率得到Methyl 3-[[2-[6,20-bis(2-hydroxyethyl)-2,2-dimethyl-20-aza-6-azoniapentacyclo[12.8.0.03,12.05,10.016,21]docosa-1(14),3,5,10,12,15,21-heptaen-13-yl]benzoyl]-methylamino]propanoate
  参考文献：
  名称：

  用于光学显微镜和纳米显微镜的发红碳吡喃染料的通用途径

  摘要：

  生物显微镜偏爱具有大荧光量子产率、低暗三重态种群、良好的生物相容性和近红外吸收和发射最大值的光稳定性荧光标记物，在该处细胞自发荧光被最小化。在本研究中，合成了在 640 nm 附近吸收并在 660 nm 附近发射、具有低系统间交叉率 (kisc ≈ 0.5 e6/s) 和优异的细胞成像特性的碳吡咯啉。介绍了在合成的最后步骤或在所得荧光染料中具有可变官能团的碳吡喃酮的一般合成路线。母体染料具有两个 2-甲氧基乙基，可溶于水和大多数有机溶剂。染料或其前体的去甲基化是直接、干净、并提供具有一个或两个 2-羟乙基基团的化合物，可用于进一步转化。含接头的羧基中的修饰也是可能的。描述了从简单的前体开始并利用单个临时保护基团的染料的多步合成。所提出的方法可以进一步应用于笼状碳吡喃酮的设计。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201000343

文献信息

• A Versatile Route to Red-Emitting Carbopyronine Dyes for Optical Microscopy and Nanoscopy
  作者：Kirill Kolmakov、Vladimir N. Belov、Christian A. Wurm、Benjamin Harke、Marcel Leutenegger、Christian Eggeling、Stefan W. Hell

  DOI：10.1002/ejoc.201000343

  日期：2010.7

  photostable fluorescent markers with large fluorescence quantum yields, low dark triplet state population, good biocompatibility and absorption and emission maxima in the near-infrared, where cellular autofluorescence is minimized. In the present study, carbopyronines absorbing around 640 nm and emitting at around 660 nm, with a low intersystem crossing rate (kisc ≈ 0.5 e6/s) and excellent properties for

  生物显微镜偏爱具有大荧光量子产率、低暗三重态种群、良好的生物相容性和近红外吸收和发射最大值的光稳定性荧光标记物，在该处细胞自发荧光被最小化。在本研究中，合成了在 640 nm 附近吸收并在 660 nm 附近发射、具有低系统间交叉率 (kisc ≈ 0.5 e6/s) 和优异的细胞成像特性的碳吡咯啉。介绍了在合成的最后步骤或在所得荧光染料中具有可变官能团的碳吡喃酮的一般合成路线。母体染料具有两个 2-甲氧基乙基，可溶于水和大多数有机溶剂。染料或其前体的去甲基化是直接、干净、并提供具有一个或两个 2-羟乙基基团的化合物，可用于进一步转化。含接头的羧基中的修饰也是可能的。描述了从简单的前体开始并利用单个临时保护基团的染料的多步合成。所提出的方法可以进一步应用于笼状碳吡喃酮的设计。