tert-butyl (2-(2-(2-(4-(6-(pyrimidin-2-yl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)benzamido)ethoxy)ethoxy)ethyl)carbamate | 1616894-51-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: tert-butyl (2-(2-(2-(4-(6-(pyrimidin-2-yl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)benzamido)ethoxy)ethoxy)ethyl)carbamate
• 英文别名: tert-butyl (2-(2-(2-(4-(6-(pyrimidin-2-yl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)-benzamido)ethoxy)ethoxy)-ethyl)carbamate
• CAS: 1616894-51-9
• 化学式: C₂₄H₃₀N₈O₅
• 分子量: 510.553
• InChiKey: VCOIPKULNDRMKA-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.68
• 重原子数：
  37.0
• 可旋转键数：
  12.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  163.23
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl (2-(2-(2-(4-(6-(pyrimidin-2-yl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)benzamido)ethoxy)ethoxy)ethyl)carbamate 在 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 N-(2-(2-(2-(5-((3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamido)ethoxy)ethoxy)ethyl)-4-(6-(pyrimidin-2-yl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)benzamide
  参考文献：
  名称：

  适用于活细胞成像和基于亲和性的蛋白质标记的“极简”含环丙烯的光交联剂

  摘要：

  天然细胞环境中生物活性化合物的目标鉴定在生物医学研究和药物发现中很重要，但传统上是在体外进行的。目前关于此类分子如何与其内源性靶标（开启和关闭）相互作用的信息非常有限。一种理想的策略是在原位（例如，在活细胞中）重现蛋白质-小分子相互作用，同时使这些复合物能够富集以用于随后的蛋白质组范围内的目标识别。同样，基于小分子的成像方法越来越多地用于原位监测包括酶在内的各种蛋白质。然而，用于同时生物成像和靶向鉴定活哺乳动物细胞中非共价生物活性化合物的化学蛋白质组学策略，目前不可用。这是由于缺乏从其母体化合物中进行最少修饰的光亲和标签，但使用无铜生物正交化学进行化学处理。我们在此开发了包含烷基二氮杂环丙烷和环丙烯的新型极简接头。我们已经展示了由此类接头制成的化学探针（例如 BD-2）可用于通过快速、无铜、四嗪-环丙烯连接同时进行内源性 BRD-4（一种重要的表观遗传蛋白）的原位成像和共价标记反应 (k2

  DOI：

  10.1021/ja502780z
• 作为产物：
  描述：

  2-氰基嘧啶 在 吡啶 、 一水合肼 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 2.5h， 生成 tert-butyl (2-(2-(2-(4-(6-(pyrimidin-2-yl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)benzamido)ethoxy)ethoxy)ethyl)carbamate
  参考文献：
  名称：

  使用7-氧杂降冰片烯作为亲二烯体的电子逆Diels-Alder生物共轭反应。

  摘要：

  使掺入7-氧杂降冰片烯作为亲二烯体的寡核苷酸，肽和肽核酸与连接至肽，d-生物素，BODIPY或N-乙酰基-d-半乳糖胺的四嗪反应。在37°C下进行过夜的反电子需求Diels-Alder（IEDDA）环加成反应，在所有情况下均以良好的收率提供了目标偶联物。IEDDA与7-氧杂降冰片烯的反应产生的立体异构体数量少于IEDDA与其他亲二烯体的环加成反应。

  DOI：

  10.1021/acs.joc.0c00583

文献信息

• Combination of inverse electron-demand Diels–Alder reaction with highly efficient oxime ligation expands the toolbox of site-selective peptide conjugations
  作者：S. Hörner、C. Uth、O. Avrutina、H. Frauendorf、M. Wiessler、H. Kolmar

  DOI：10.1039/c5cc03434e

  日期：——

  A modular bioconjugation strategy based on stepwise oxime ligation and inverse electron-demand Diels–Alder reaction.

  一种基于逐步肟缀合和逆电子需求Diels-Alder反应的模块化生物共轭策略。
• Correction: Combination of inverse electron-demand Diels–Alder reaction with highly efficient oxime ligation expands the toolbox of site-selective peptide conjugations
  作者：S. Hörner、C. Uth、O. Avrutina、H. Frauendorf、M. Wiessler、H. Kolmar

  DOI：10.1039/c5cc90302e

  日期：——

  Correction for ‘Combination of inverse electron-demand Diels–Alder reaction with highly efficient oxime ligation expands the toolbox of site-selective peptide conjugations’ by S. Hörner, et al., Chem. Commun., 2015, DOI: 10.1039/c5cc03434e.

  “逆电需求Diels-Alder反应与高效肟缩合反应的组合扩展了位点选择性肽共轭工具箱”的文章作者为S. Hörner等人，该文章的修正已在2015年的《化学通讯》杂志上发表，DOI为10.1039/c5cc03434e。