5'-azido-5'-deoxyadenosin-8-yl-thio-N-[(5'-amino-8-bromo-5'-deoxyadenosine)methyl]acetamide | 1383468-10-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 5'-脱氧核糖核苷
• 英文名称: 5'-azido-5'-deoxyadenosin-8-yl-thio-N-[(5'-amino-8-bromo-5'-deoxyadenosine)methyl]acetamide
• CAS: 1383468-10-7
• 化学式: C₂₂H₂₅BrN₁₄O₇S
• 分子量: 709.5
• InChiKey: WFFKQQMGOXMIGR-ZOUOOXKVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.65
• 重原子数：
  45.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  316.48
• 氢给体数：
  7.0
• 氢受体数：
  19.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-azido-5'-deoxyadenosin-8-yl-thio-N-[(5'-amino-8-bromo-5'-deoxyadenosine)methyl]acetamide 在 吡啶 、 三苯基膦 、 氨 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 2.0h， 以40%的产率得到5'-amino-5'-deoxyadenosin-8-yl-thio-N-[(5'-amino-8-bromo-5'-deoxyadenosine)methyl]acetamide
  参考文献：
  名称：

  [EN] NOVEL ANTIBACTERIAL COMPOUNDS
  [FR] NOUVEAUX COMPOSÉS ANTIBACTÉRIENS

  摘要：

  本发明涉及以下化合物的公式(I)：其中R1、R2、R3、R4、X1、X2、X3和Z的定义如权利要求1所述。这些化合物在预防和/或治疗细菌感染方面具有用途。

  公开号：

  WO2012090136A1
• 作为产物：
  描述：

  5'-O-(苄基磺酰基)-2',3'-O-异亚丙基腺苷 在 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 sodium azide 、 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 sodium hydride 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 mineral oil 为溶剂， 反应 6.17h， 生成 5'-azido-5'-deoxyadenosin-8-yl-thio-N-[(5'-amino-8-bromo-5'-deoxyadenosine)methyl]acetamide
  参考文献：
  名称：

  [EN] NOVEL ANTIBACTERIAL COMPOUNDS
  [FR] NOUVEAUX COMPOSÉS ANTIBACTÉRIENS

  摘要：

  本发明涉及以下化合物的公式(I)：其中R1、R2、R3、R4、X1、X2、X3和Z的定义如权利要求1所述。这些化合物在预防和/或治疗细菌感染方面具有用途。

  公开号：

  WO2012090136A1

文献信息

• Screening and In Situ Synthesis Using Crystals of a NAD Kinase Lead to a Potent Antistaphylococcal Compound
  作者：Muriel Gelin、Guillaume Poncet-Montange、Liliane Assairi、Laurence Morellato、Valérie Huteau、Laurence Dugué、Olivier Dussurget、Sylvie Pochet、Gilles Labesse

  DOI：10.1016/j.str.2012.03.024

  日期：2012.6

  Making new ligands for a given protein by in situ ligation of building blocks (or fragments) is an attractive method. However, it suffers from inherent limitations, such as the limited number of available chemical reactions and the low information content of usual chemical library deconvolution. Here, we describe a focused screening of adenosine derivatives using X-ray crystallography. We discovered an unexpected and biocompatible chemical reactivity and have simultaneously identified the mode of binding of the resulting products. We observed that the NAD kinase from Listeria monocytogenes (LmNADK1) can promote amide formation between 5'-amino-5'-deoxyadenosine and carboxylic acid groups. This unexpected reactivity allowed us to bridge in situ two adenosine derivatives to fully occupy the active NAD site. This guided the design of a close analog showing micromolar inhibition of two human pathogenic NAD kinases and potent bactericidal activity against Staphylococcus aureus in vitro.