(1S,3R,4S,7R)-3-(6-N-benzoyladenin-9-yl)-1-(4,4′-dimethoxytrityloxymethyl)-7-hydroxy-5-(pyren-1-yl)acetyl-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptane | 1513633-33-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: (1S,3R,4S,7R)-3-(6-N-benzoyladenin-9-yl)-1-(4,4′-dimethoxytrityloxymethyl)-7-hydroxy-5-(pyren-1-yl)acetyl-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptane
• CAS: 1513633-33-4
• 化学式: C₅₇H₄₆N₆O₇
• 分子量: 927.028
• InChiKey: WHEDHSQIDPMCSO-LXSASTEGSA-N

物化性质

• 密度：
  1.38±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.08
• 重原子数：
  70.0
• 可旋转键数：
  13.0
• 环数：
  12.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.18
• 拓扑面积：
  150.16
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (1S,3R,4S,7R)-3-(6-N-benzoyladenin-9-yl)-1-(4,4′-dimethoxytrityloxymethyl)-7-hydroxy-5-(pyren-1-yl)acetyl-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptane 、 2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 22.0h， 以71%的产率得到(1S,3R,4S,7R)-3-(6-N-benzoyladenin-9-yl)-7-[2-cyanoethoxy-(diisopropylamino)phosphinoxy]-1-(4,4′-dimethoxytrityloxymethyl)-5-(pyren-1-yl)acetyl-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  用 2'-氨基-α-l-LNA 腺嘌呤单体修饰的寡脱氧核糖核苷酸的合成和表征：单链 DNA 的高亲和力靶向

  摘要：

  由于在反义、反基因和其他基因靶向策略中的成功应用，构象受限核苷酸构建模块的开发继续吸引着相当大的兴趣。锁核酸 (LNA) 及其非对映异构体 α- 1- LNA 是其中两个有趣的例子。相对于未修饰的链，用这些单元修饰的寡核苷酸显示出对核酸靶标的极大增加的亲和力、改进的结合特异性和增强的酶稳定性。在这里，我们展示了用 2'-氨基-α - l - LNA 腺嘌呤单体W - Z修饰的寡脱氧核糖核苷酸 (ON) 的合成和生物物理表征。目标亚磷酰胺的合成1 –4从五呋喃糖5 开始，在 Vorbrüggen 糖基化、O2'-脱酰化、O2'-活化和 C2'-叠氮化物引入后产生核苷8。一锅串联施陶丁格/分子内亲核取代将8转化为 2'-氨基-α - l -LNA 腺嘌呤中间体9，经过一系列非平凡的保护基操作后提供关键中间体15。随后的化学选择性N2'官能化和O3'-亚磷酸化给予目标1 - 4在~1-3％的总收率从超过11个步骤5。用芘功能化的

  DOI：

  10.1021/jo4022937
• 作为产物：
  描述：

  9-[2-O-acetyl-3-O-benzyl-5-O-(methanesulfonyl)-4-C-[[(methanesulfonyl)oxy]methyl]-α-L-threo-pentofuranosyl]-6-N-benzoyladenine 在 吡啶 、 sodium azide 、 15-冠醚-5 、 sodium methylate 、 硝酸胍 、 三氯化硼 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 sodium hydroxide 、 三甲基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 正己烷 、 二氯甲烷 、 水 、 1,2-二氯乙烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 117.0h， 生成 (1S,3R,4S,7R)-3-(6-N-benzoyladenin-9-yl)-1-(4,4′-dimethoxytrityloxymethyl)-7-hydroxy-5-(pyren-1-yl)acetyl-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  用 2'-氨基-α-l-LNA 腺嘌呤单体修饰的寡脱氧核糖核苷酸的合成和表征：单链 DNA 的高亲和力靶向

  摘要：

  由于在反义、反基因和其他基因靶向策略中的成功应用，构象受限核苷酸构建模块的开发继续吸引着相当大的兴趣。锁核酸 (LNA) 及其非对映异构体 α- 1- LNA 是其中两个有趣的例子。相对于未修饰的链，用这些单元修饰的寡核苷酸显示出对核酸靶标的极大增加的亲和力、改进的结合特异性和增强的酶稳定性。在这里，我们展示了用 2'-氨基-α - l - LNA 腺嘌呤单体W - Z修饰的寡脱氧核糖核苷酸 (ON) 的合成和生物物理表征。目标亚磷酰胺的合成1 –4从五呋喃糖5 开始，在 Vorbrüggen 糖基化、O2'-脱酰化、O2'-活化和 C2'-叠氮化物引入后产生核苷8。一锅串联施陶丁格/分子内亲核取代将8转化为 2'-氨基-α - l -LNA 腺嘌呤中间体9，经过一系列非平凡的保护基操作后提供关键中间体15。随后的化学选择性N2'官能化和O3'-亚磷酸化给予目标1 - 4在~1-3％的总收率从超过11个步骤5。用芘功能化的

  DOI：

  10.1021/jo4022937