N-Benzyloxy-5-(formyl-methyl-amino)-1-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-hydroxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-1H-imidazole-4-carboxamidine | 76227-22-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: N-Benzyloxy-5-(formyl-methyl-amino)-1-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-hydroxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-1H-imidazole-4-carboxamidine
• 英文别名: N-[3-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-[(Z)-N'-phenylmethoxycarbamimidoyl]imidazol-4-yl]-N-methylformamide
• CAS: 76227-22-0
• 化学式: C₁₈H₂₃N₅O₅
• 分子量: 389.411
• InChiKey: ULDQUTOWMGICRN-RRFJBIMHSA-N

物化性质

• 熔点：
  141-142 °C
• 沸点：
  692.1±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.45±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.05
• 重原子数：
  28.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.39
• 拓扑面积：
  135.43
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-Benzyloxy-5-(formyl-methyl-amino)-1-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-hydroxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-1H-imidazole-4-carboxamidine 在 盐酸 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 3.5h， 生成 N⁶-benzyloxy-3-methyladenine
  参考文献：
  名称：

  3-甲基-2'-脱氧腺苷的合成，开环和糖苷键裂解

  摘要：

  的甲基化Ñ ' -苄氧基-1-（2-脱氧β - d呋喃核糖基）-5- formamidoimidazole -4-甲脒（2A随后的氢解）ñ -苄氧基的基团和环化'制作的迄今未知的3-甲基2'-脱氧腺苷（5a），在pH⩽7·0的H 2）O中容易水解为3-甲基腺嘌呤（6），并在（6）和咪唑-（2-脱氧）核糖苷（4a）中水解在pH 8·98下。

  DOI：

  10.1039/c39800000758
• 作为产物：
  描述：

  5-(1-hydroxy-6-iminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol 在 Amberlite IRA-402 (HCO₃^-) 、 sodium perchlorate 、 水 、 potassium carbonate 作用下， 以 N,N-二甲基乙酰胺 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 192.0h， 生成 N-Benzyloxy-5-(formyl-methyl-amino)-1-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-hydroxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-1H-imidazole-4-carboxamidine
  参考文献：
  名称：

  3-甲基-2'-脱氧腺苷的合成，开环和糖苷键裂解

  摘要：

  的甲基化Ñ ' -苄氧基-1-（2-脱氧β - d呋喃核糖基）-5- formamidoimidazole -4-甲脒（2A随后的氢解）ñ -苄氧基的基团和环化'制作的迄今未知的3-甲基2'-脱氧腺苷（5a），在pH⩽7·0的H 2）O中容易水解为3-甲基腺嘌呤（6），并在（6）和咪唑-（2-脱氧）核糖苷（4a）中水解在pH 8·98下。

  DOI：

  10.1039/c39800000758

文献信息

• Purines. XXXIV. 3-Methyladenosine and 3-methyl-2'-deoxyadenosine. Their synthesis, glycosidic hydrolysis, and ring fission.
  作者：Tozo FUJII、Tohru SAITO、Tsuyoshi NAKASAKA

  DOI：10.1248/cpb.37.2601

  日期：——

  The first syntheses of 3-methyladenosine (3a) and 3-methyl-2'-deoxyadenosine (3b), both in the form of the p-toluenesulfonate salt, have been achieved through two parallel 6-step routes starting from adenosine (5a) and 2'-deoxyadenosine (5b), which are based on the "fission and reclosure" technology for modification of the adenine ring. These 3-methyladenine nucleosides (3a, b·TsOH) were very unstable under not only acidic but also alkaline conditions. At pH 1 and 25°C, 3a·TsOH (half-life 17 min) underwent glycosidic hydrolysis (depurinylation) some thousand times faster than did adenosine (5a) itself. At pH 3.34 and 25°C, the 2-deoxyribosyl analogue 3b·TsOH (half-life 2.7 min) was depurinylated 370 times more rapidly than the ribosyl analogue 3a·TsOH (half-life 1010 min). The glycosidic bond of the imidazole 2-deoxyriboside 11b, an intermediate for the present synthesis of 3b·TsOH, was also hydrolyzed easily at pH 1 and room temperature. In H2O at pH 8.32 and 25°C, 3a·TsOH readily underwent ring opening in the pyrimidine moiety and came to equilibrium with the (N-methylformamido)imidazole derivative 10a, which was further deformylated under more alkaline conditions. The ring opening was ca. 30 times as fast as that of 1-methyladenosine (17). In H2O at pH 8.98 and 25°C, the 2-deoxyribosyl analogue 3b·TsOH underwent not only similar ring opening but also glycosidic hydrolysis competitively. The possible factors responsible for the high reactivity of 3a·TsOH are discussed on the basis of its X-ray crystal structure.

  以腺苷（5a）和 2'-脱氧腺苷（5b）为起点，通过两条平行的 6 步路线，首次合成了对甲苯磺酸盐形式的 3-甲基腺苷（3a）和 3-甲基-2'-脱氧腺苷（3b），它们都是基于 "裂变和再封闭 "技术来修饰腺嘌呤环的。这些 3-甲基腺嘌呤核苷（3a、b-TsOH）在酸性和碱性条件下都非常不稳定。在 pH 值为 1 和 25°C 的条件下，3a-TsOH（半衰期为 17 分钟）发生糖苷水解（去嘌呤化）的速度比腺苷（5a）本身快数千倍。在 pH 值为 3.34 和 25°C 的条件下，2-脱氧核糖基类似物 3b-TsOH（半衰期为 2.7 分钟）的去嘌呤化速度是核糖基类似物 3a-TsOH（半衰期为 1010 分钟）的 370 倍。本次合成 3b-TsOH 的中间体咪唑 2-脱氧核苷 11b 的糖苷键在 pH 值为 1 和室温条件下也很容易水解。在 pH 值为 8.32、温度为 25°C 的 H2O 中，3a-TsOH 很容易在嘧啶分子中发生开环反应，并与（N-甲基甲酰氨基）咪唑衍生物 10a 达到平衡，后者在碱性更强的条件下进一步发生变形。开环速度约为 1-甲基腺苷（17）的 30 倍。在 pH 值为 8.98、温度为 25°C 的 中，2-脱氧核糖基类似物 3b-TsOH 不仅发生了类似的开环反应，而且还发生了糖苷水解竞争反应。本文以 3a-TsOH 的 X 射线晶体结构为基础，讨论了导致其高活性的可能因素。
• FUJII, TOZO;SAITO, TOHRU;NAKASAKA, TSUYOSHI, CHEM. AND PHARM. BULL., 37,(1989) N0, C. 2601-2609
  作者：FUJII, TOZO、SAITO, TOHRU、NAKASAKA, TSUYOSHI

  DOI：——

  日期：——