(S)-6-acetamido-2-amino-N-(4-methyl-2-oxo-2H-chromen-7-yl)hexanamide 2,2,2-trifluoroacetate | 573719-42-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (S)-6-acetamido-2-amino-N-(4-methyl-2-oxo-2H-chromen-7-yl)hexanamide 2,2,2-trifluoroacetate
• CAS: 573719-42-3
• 化学式: C₂HF₃O₂*C₁₈H₂₃N₃O₄
• 分子量: 459.422
• InChiKey: USKVSAKSKOXBGR-RSAXXLAASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.31
• 重原子数：
  32.0
• 可旋转键数：
  7.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  151.73
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  6.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S)-6-acetamido-2-amino-N-(4-methyl-2-oxo-2H-chromen-7-yl)hexanamide 2,2,2-trifluoroacetate 、 (S)-13-isobutyl-2,2-dimethyl-4,11,14-trioxo-3-oxa-5,12,15-triazaheptadecan-17-oic acid 在 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 15.0h， 以85%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  Design and Synthesis of Simplified Largazole Analogues as Isoform-Selective Human Lysine Deacetylase Inhibitors

  摘要：

  Selective inhibition of KDAC isoforms while maintaining potency remains a challenge. Using the largazole macrocyclic depsipeptide structure as a starting point for developing new KDACIs with increased selectivity, a combination of four different simplified largazole analogue (SLA) scaffolds with diverse zinc-binding groups (for a total of 60 compounds) were designed, synthesized, and evaluated against class I KDACs 1, 3, and 8, and class II KDAC6. Experimental evidence as well as molecular docking poses converged to establish the cyclic tetrapeptides (CTPs) as the primary determinant of both potency and selectivity by influencing the correct alignment of the zinc-binding group in the KDAC active site, providing a further basis for developing new KDACIs of higher isoform selectivity and potency.

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.5b01632
• 作为产物：
  描述：

  7-氨基-4-甲基香豆素 在 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 27.0h， 生成 (S)-6-acetamido-2-amino-N-(4-methyl-2-oxo-2H-chromen-7-yl)hexanamide 2,2,2-trifluoroacetate
  参考文献：
  名称：

  [EN] ISOFORM-SELECTIVE LYSINE DEACETYLASE INHIBITORS
  [FR] INHIBITEURS DE LYSINE DÉSACÉTYLASE SÉLECTIFS ENVERS LES ISOFORMES

  摘要：

  描述了选择性异构体赖氨酸去乙酰化酶抑制剂。赖氨酸去乙酰化酶的抑制剂可用作抗肿瘤药物，治疗成瘾、哮喘、心血管疾病、免疫抑制、神经退行性疾病、败血症、镰刀细胞病、葡萄膜黑色素瘤以及终止病毒潜伏，尤其是HIV-1潜伏。

  公开号：

  WO2016179398A1

文献信息

• Substrates for Efficient Fluorometric Screening Employing the NAD-Dependent Sirtuin 5 Lysine Deacylase (KDAC) Enzyme
  作者：Andreas S. Madsen、Christian A. Olsen

  DOI：10.1021/jm300526r

  日期：2012.6.14

  employing sirtuin 5 (SIRT5). Furthermore, optimized protocols for facile kinetic investigations were developed, which should be valuable for enzyme kinetic investigations. Finally, these protocols were applied to a kinetic analysis of the inhibition of SIRT5 by suramin, a potent sirtuin inhibitor previously shown by X-ray crystallography to bind the substrate pocket of the human SIRT5 KDAC enzyme.

  III类赖氨酸脱酰基酶（KDAC），也称为sirtuins，已成为治疗多种疾病的有趣药物靶标。为了更深入地了解受沉默调节蛋白影响的过程，开发单个同工酶的选择性小分子调节剂一直是一个长期的目标。然而，对于新颖的调节剂的发现，必不可少的是针对所关注目标的良好筛选方案和机理见解。因此，我们评估了七种人类瑟土因水解酶对一组荧光底物的活性。评价了常用的市售底物和设计用于解决赖氨酸翻译后修饰领域的最新发展的新型化学型。含N-琥珀酰赖氨酸的底物，可使用瑟土因5（SIRT5）进行高效且酶经济的筛选。此外，开发了用于简便动力学研究的优化方案，这对于酶动力学研究应该是有价值的。最后，将这些方案应用于苏拉明对SIRT5抑制的动力学分析，苏拉明是一种有效的瑟土因抑制剂，先前已通过X射线晶体学显示与人SIRT5 KDAC酶的底物口袋结合。