(2S)-5-amino-2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S)-2,5-diamino-5-oxopentanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]-5-oxo(1,2-13C2)pentanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]-5-oxopentanoic acid | 1391760-52-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (2S)-5-amino-2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S)-2,5-diamino-5-oxopentanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]-5-oxo(1,2-13C2)pentanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]-5-oxopentanoic acid
• CAS: 1391760-52-3
• 化学式: C₄₀H₆₆N₁₆O₁₇
• 分子量: 1045.04
• InChiKey: ADSTZNWNVIDCHU-BWPTYBEFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -14.1
• 重原子数：
  73
• 可旋转键数：
  39
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  612
• 氢给体数：
  17
• 氢受体数：
  18

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  在 三氟乙酸 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 1.0h， 以16.7 mg的产率得到(2S)-5-amino-2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S)-2,5-diamino-5-oxopentanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]-5-oxo(1,2-13C2)pentanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]-5-oxopentanoic acid
  参考文献：
  名称：

  Short polyglutamine peptide forms a high-affinity binding site for thioflavin-T at the N-terminus

  摘要：

  硫黄素-T是最重要的淀粉样蛋白特异性染料之一，已使用超过50年；然而，其染色分子机制仍未被理解。化学合成的短多聚谷氨酰胺肽（Qn，n = 5–10）经过硫黄素-T（ThT）染色测定。发现能被ThT染色的最小Qn肽是Q6。在短多聚Q（n = 6–9）中观察到两种类型的ThT结合位点：高亲和力位点（kd1 = 0.1–0.17 μM）和低亲和力位点（kd2 = 5.7–7.4 μM）。进行13C{2H}REDOR NMR实验以通过对[3-Me-d3]ThT和自然丰度Q8或特定位点[1,2-13C2]标记的Q8之间的分子间偶极耦合观察，提取Q8肽聚集体中ThT结合位点的局部结构。[3-Me-d3]ThT/自然丰度Q8（1/9）复合物的13C{2H}REDOR差谱表明，谷氨酰胺残基的五个碳原子均参与了ThT结合位点的形成。[3-Me-d3]ThT/特定位点[1,2-13C2]标记的Q8（1/50）复合物的13C{2H}DQF–REDOR实验表明，在高亲和力ThT结合位点上，N末端谷氨酰胺残基与ThT分子直接接触。

  DOI：

  10.1039/c2ob07157f