2'-deoxy-2'-C-α-[( α, α, α-trifluoroacetyl)aminomethyl]uridine | 1394848-51-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 2'-deoxy-2'-C-α-[( α, α, α-trifluoroacetyl)aminomethyl]uridine
• 英文别名: N-[[(2R,3R,4S,5R)-2-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]methyl]-2,2,2-trifluoroacetamide
• CAS: 1394848-51-1
• 化学式: C₁₂H₁₄F₃N₃O₆
• 分子量: 353.255
• InChiKey: HINSETALYORJES-MTSNSDSCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  128
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-deoxy-2'-C-α-[( α, α, α-trifluoroacetyl)aminomethyl]uridine 在 正丁胺 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 60.0h， 以81%的产率得到2'-C-α-aminomethyl-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  2'-C-α-氨基甲基-2'-脱氧核苷有效合成。

  摘要：

  从甲基3,5-二-O-苄基-2-酮基的α-d呋喃核糖苷，会聚开始，六步合成进行显影，得到有效地所有四个2'-C-α-氨基甲基-2'-脱氧核苷（U，C，A，G）在38％，42％，分别为12％，产率12％。收敛通过全硅烷化的核碱基的糖基化与甲基2-α-苯二甲酰呋喃核糖苷实现。

  DOI：

  10.1039/c2cc34556k
• 作为产物：
  描述：

  (2S,4R,5R)-4-(benzyloxy)-5-((benzyloxy)methyl)-2-methoxydihydrofuran-3(2H)-one 在 9-borabicyclo[3.3.1]nonane dimer 、 palladium on carbon 、 氢气 、 仲丁基锂 、 四氯化锡 、 三苯基膦 、 甲胺 、 偶氮二甲酸二乙酯 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 环己烷 、 乙酸乙酯 、 乙腈 为溶剂， 反应 127.25h， 生成 2'-deoxy-2'-C-α-[( α, α, α-trifluoroacetyl)aminomethyl]uridine
  参考文献：
  名称：

  2'-C-α-氨基甲基-2'-脱氧核苷有效合成。

  摘要：

  从甲基3,5-二-O-苄基-2-酮基的α-d呋喃核糖苷，会聚开始，六步合成进行显影，得到有效地所有四个2'-C-α-氨基甲基-2'-脱氧核苷（U，C，A，G）在38％，42％，分别为12％，产率12％。收敛通过全硅烷化的核碱基的糖基化与甲基2-α-苯二甲酰呋喃核糖苷实现。

  DOI：

  10.1039/c2cc34556k

文献信息

• NUCLEIC ACID DETECTION AND AMPLIFICATION BY CHEMICAL LINKAGE OF OLIGONUCLEOTIDES
  申请人：BIO-RAD LABORATORIES, INC.

  公开号：EP0828856B1

  公开（公告）日：2005-12-21
• US5843650A
  申请人：——

  公开号：US5843650A

  公开（公告）日：1998-12-01
• Efficient synthesis of 2′-C-α-aminomethyl-2′-deoxynucleosides
  作者：Nan-Sheng Li、Joseph A. Piccirilli

  DOI：10.1039/c2cc34556k

  日期：——

  Starting from methyl 3,5-di-O-benzyl-2-keto-alpha-D-ribofuranoside, a convergent, six-step synthesis is developed to give efficiently all four 2'-C-alpha-aminomethyl-2'-deoxynucleosides (U, C, A, G) in 38%, 42%, 12%, 12% yield, respectively. Convergence is achieved by the glycosylation of persilylated nucleobases with methyl 2-alpha-phthalimidomethyl ribofuranoside.

  从甲基3,5-二-O-苄基-2-酮基的α-d呋喃核糖苷，会聚开始，六步合成进行显影，得到有效地所有四个2'-C-α-氨基甲基-2'-脱氧核苷（U，C，A，G）在38％，42％，分别为12％，产率12％。收敛通过全硅烷化的核碱基的糖基化与甲基2-α-苯二甲酰呋喃核糖苷实现。