4-((4-(氨基甲基)苄基)氧基)-6-氯嘧啶-2-胺 | 913817-45-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 中文名称: 4-((4-(氨基甲基)苄基)氧基)-6-氯嘧啶-2-胺
• 英文名称: 4-((4-(aminomethyl)benzyl)oxy)-6-chloropyrimidin-2-amine
• 英文别名: 4-((4-(Aminomethyl)benzyl)oxy)-6-chloropyrimidin-2-amine；4-[[4-(aminomethyl)phenyl]methoxy]-6-chloropyrimidin-2-amine
• CAS: 913817-45-5
• 化学式: C₁₂H₁₃ClN₄O
• 分子量: 264.714
• InChiKey: WFXBBTCFFCOXFA-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.5
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.17
• 拓扑面积：
  87
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-((4-(氨基甲基)苄基)氧基)-6-氯嘧啶-2-胺 、 生物素化-epsilon-氨基己酸-N-羟基丁二酰亚胺活化酯 在 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 N-[4-(2-amino-4-chloropyrimidin-6-yloxymethyl)-benzyl]-6-biotinylamino-hexanoylcarboxamide
  参考文献：
  名称：

  WO2006/114409

  摘要：

  公开号：
• 作为产物：
  描述：

  N-(4-((2-amino-6-chloropyrimidin-4-yloxy)methyl)benzyl)-2,2,2-trifluoroacetamide 在 甲胺 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 为溶剂， 生成 4-((4-(氨基甲基)苄基)氧基)-6-氯嘧啶-2-胺
  参考文献：
  名称：

  WO2006/114409

  摘要：

  公开号：

文献信息

• RED-SHIFTED FLUOROPHORES
  申请人：HOWARD HUGHES MEDICAL INSTITUTE

  公开号：US20210171490A1

  公开（公告）日：2021-06-10

  A compound of the following structure is provided:

  提供了以下结构的化合物：
• [EN] CELL PERMEABLE, FLUORESCENT DYE<br/>[FR] COLORANT FLUORESCENT CAPABLE DE PÉNÉTRER DANS LES CELLULES
  申请人：ECOLE POLYTECH

  公开号：WO2013029650A1

  公开（公告）日：2013-03-07

  The invention pertains to a near-infrared fluorescent dye that is cell permeable and can be attached to selected proteins in living cells. The dye has the general formula (I) or its or its corresponding spirolactone (II) wherein Y is chosen from the group consisting of Si, Ge and Sn; R0 is -COO- or COOH; R1, R2, R3, R4, R5, R6, R7, R8, R9, R10, R11, R12, R13, R14, R15 and R16 are substituents, including hydrogen, independently from each other. The dye (i) absorbs and emits light at wavelengths above 600 nm; (ii) possesses high photostability; (iii) has high extinction coefficients and high quantum yields; (iv) can be derivatized with different molecules; and (v) is membrane-permeable and shows mini¬ mal background binding to biomolecules and biomolecular structures.

  该发明涉及一种近红外荧光染料，可以穿透细胞并附着于活细胞中的特定蛋白质。该染料具有一般式(I)或其相应的螺内酯(II)，其中Y选择自Si、Ge和Sn组成的群；R0为-COO-或COOH；R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15和R16为取代基，包括独立于彼此的氢。该染料(i)在600纳米以上的波长吸收和发射光；(ii)具有高光稳定性；(iii)具有高消光系数和高量子产率；(iv)可以与不同分子衍生化；(v)具有膜通透性，并显示对生物分子和生物分子结构的最小背景结合。
• Spontaneously Blinking Fluorophores Based on Nucleophilic Addition/Dissociation of Intracellular Glutathione for Live-Cell Super-resolution Imaging
  作者：Akihiko Morozumi、Mako Kamiya、Shin-nosuke Uno、Keitaro Umezawa、Ryosuke Kojima、Toshitada Yoshihara、Seiji Tobita、Yasuteru Urano

  DOI：10.1021/jacs.0c00451

  日期：——

  microscopy (SMLM) allows the reconstruction of super-resolution images, but generally requires prior intense laser irradiation and in some cases additives to induce blinking of conventional fluorophores. We previously introduced a spontaneously blinking rhodamine fluorophore based on an intramolecular spirocyclization reaction for live-cell SMLM under physiological conditions. Here, we report a novel

  单分子定位显微镜 (SMLM) 允许重建超分辨率图像，但通常需要事先进行强激光照射，在某些情况下还需要添加剂来诱导常规荧光团的闪烁。我们之前基于活细胞 SMLM 在生理条件下的分子内螺环化反应引入了自发闪烁的罗丹明荧光团。在这里，我们报告了活细胞中自发闪烁的新原理，该原理利用细胞内谷胱甘肽 (GSH) 对呫吨荧光团的可逆基态亲核攻击。结构优化提供了两种不同颜色的吡罗宁荧光团，两者都表现出平衡（在荧光解离形式和非荧光 GSH 加合物形式之间）和闪烁动力学，使活细胞中的微管能够进行 SMLM。此外，通过使用在近红外 (NIR) 和绿色范围内工作的自发闪烁荧光团，我们成功地实现了双色活细胞 SMLM，而无需优化成像介质。
• Cell Permeable, Fluorescent Dye
  申请人：Ecole Polytechnique Federale de Lausanne (EPFL)

  公开号：US20140349282A1

  公开（公告）日：2014-11-27

  The invention pertains to a near-infrared fluorescent dye that is cell permeable and can be attached to selected proteins in living cells. The dye has the general formula or its corresponding spirolactone wherein Y is chosen from the group consisting of Si, Ge and Sn; R 0 is —COO − or COOH; R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , R 5 , R 6 , R 7 , R 8 , R 9 , R 10 , R 11 , R 12 , R 13 , R 14 , R 15 and R 16 are substituents, including hydrogen, independently from each other. The dye (i) absorbs and emits light at wavelengths above 600 nm; (ii) possesses high photostability; (iii) has high extinction coefficients and high quantum yields; (iv) can be derivatized with different molecules; and (v) is membrane-permeable and shows minimal background binding to biomolecules and biomolecular structures.

  该发明涉及一种近红外荧光染料，该染料可穿透细胞，并可连接到活细胞中的特定蛋白质。 该染料具有一般化学式，或其相应的螺内酯化合物，其中Y选择自Si、Ge和Sn组成的组; R0为—COO−或COOH; R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15和R16为取代基，包括氢，彼此独立。 该染料(i)在600纳米以上吸收和发射光线; (ii)具有高光稳定性; (iii)具有高消光系数和高量子产率; (iv)可与不同分子衍生化; (v)具有膜渗透性，并对生物分子和生物分子结构显示最小的背景结合。
• Pyrimidines reacting with O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase fusion protein and method for detecting protein
  申请人：Covalys Biosciences AG

  公开号：US08178314B2

  公开（公告）日：2012-05-15

  The invention relates to pyrimidines suitable as substrates for O6-alkylguanine-DNA alkyltransferases (AGT) of formula (I) wherein R1 is hydrogen, lower alkyl, halogen, cyano, trifluoromethyl or azido; R2 is a linker; and L is a label or a plurality of same or different labels. The invention further relates to methods of transferring a label from pyrimidines of formula (I) to O6-alkylguanine-DNA alkyltransferases (AGT) and AGT fusion proteins.

  本发明涉及适用于O6-烷基鸟嘌呤-DNA烷基转移酶（AGT）的嘧啶衍生物，其化学式为（I），其中R1为氢、低碳基、卤素、氰基、三氟甲基或叠氮基；R2为连接基；L为标记或一组相同或不同的标记。本发明还涉及将化学式（I）的嘧啶衍生物从中转移标记到O6-烷基鸟嘌呤-DNA烷基转移酶（AGT）和AGT融合蛋白的方法。